Дефицит ацил-КоА дегидрогеназы жирных кислот с очень длинной углеродной цепью (VLCADD) − редкое аутосомно-рецессивное нарушение митохондриального бета-окисления жирных кислот, обусловленное мутациями в гене ACADVL. Заболевание характеризуется гетерогенным фенотипическим спектром от бессимптомного до тяжелой неонатальной формы и имеет высокий риск летального исхода в отсутствии терапии. С 1 января 2023 года в Российской Федерации VLCADD включен в программу расширенного неонатального скрининга (РНС). В рамках РНС было проведено обследование 1 231 401 новорожденного, родившегося в Российской Федерации в период с января по декабрь 2023 года, и 1 199 015 новорожденных, родившихся в период с января по декабрь 2024 года. По результатам первичного скрининга (24-48 ч жизни) 4342 новорожденных были отнесены к группе риска VLCADD: у данных пациентов наблюдалось повышение уровня тетрадеценоилкарнитина (C14:1) крови. При подтверждающей диагностике в ФГБНУ Медико-генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова были проведены повторное определение концентрации ацилкарнитинов крови методом тандемной масс-спектрометрии, а также молекулярно-генетическое исследование кодирующей области гена ACADVL (NM_000018.4). При подтверждающей биохимической диагностике у 35 пациентов концентрация C14:1 в крови была также повышена. Диагноз подтвержден на молекулярно-генетическом уровне у 22 пациентов. Частота VLCADD за 2023–2024 гг составила 1:110 473 живых новорожденных (95% ДИ: 1:72,123 – 1: 175 963). В статье представлена клиническая, биохимическая и молекулярно-генетическая характеристика 22 пациентов с VLCADD, выявленных по результатам первых двух лет РНС в Российской Федерации.

Актуальность. Синдром Линча относится к группе наследственных опухолевых синдромов и ассоциирован с повышенным риском развития колоректального рака и рака эндометрия, реже – опухолей других локализаций. Генетическое тестирование на выявление патогенных вариантов, связанных с синдромом Линча, предоставляет возможность для генетического консультирования не только самого пациента, но и членов семьи. Преимуществом генетической диагностики наследственных опухолевых синдромов для всех членов семьи являются профилактические мероприятия с целью ранней диагностики и предотвращения прогрессирования заболевания. Такое преимущество особенно важно для пациентов с отягощенным семейным анамнезом по онкологическим заболеваниям. Современные технологии секвенирования позволяют анализировать не только известные, но и выявлять новые ранее не описанные варианты, связанные с заболеванием.

Цель исследования. Представить клиническое описание и результаты молекулярно-генетической диагностики ранее не описанного вероятно патогенного варианта нуклеотидной последовательности в гене MLH1, обусловливающего синдром Линча.

Методы. Пробанду проведено полногеномное секвенирование с валидацией методом Сэнгера, родственникам пробанда – секвенирование по Сэнгеру.

Результаты. В представленном клиническом случае выявлен вероятно патогенный вариант в гене MLH1: chr3:37017551delT (hg38), в гетерозиготном состоянии, приводящий к аминокислотной замене p.Val279GlyfsTer18. Валидация выявленного вероятно патогенного варианта проведена секвенированием по Сэнгеру. Проведен анализ сегрегации.

Выводы. Использование высокопроизводительного секвенирования, в частности полногеномного, позволяет проанализировать всю последовательность кандидатных генов и выявлять редкие, в том числе ранее не описанные в научной литературе варианты, потенциально ассоциированные с развитием заболевания. Своевременное выявление каузативного варианта влияет на план лечения и наблюдения пациента, а также позволяет обследовать его родственников I-II степени родства с формированием рекомендаций по профилактике и скринингу возможных злокачественных новообразований.

Введение. Муковисцидоз (МВ) характеризуется выраженной генетической гетерогенностью, в связи с этим клинической вариабельностью, встречается во всех странах мира, но существуют выраженные популяционные различия в его частоте с уменьшением градиента распространения с Севера на Юг и с Запада на Восток Евразии.

Цель: изучение региональных клинико-генетических и эпидемиологических особенностей МВ для разработки оптимальных алгоритмов диагностики и лечения заболевания.

Пациенты и методы. Молекулярно-генетическое исследование выполнено 1403 человекам, включая членов семей пациентов с МВ, контрольные и популяционные выборки. Применялись клинико-лабораторные и молекулярно-генетические методы исследования, биоинформатическая обработка результатов NGS секвенирования.

Результаты. Выявлена генетическая гетерогенность МВ по спектру и частотам патогенных изменений в гене CFTR в этнических группах РБ, мутации 3849+10kbC->T, р.[G509D;Е217G] специфичны для пациентов татарской и башкирской этнической принадлежности, 394delTT и р.[S466X;R1070Q] – для татар.

Заключение. Внедрение молекулярно-генетических технологий, повышение их доступности в РБ, позволили разработать эффективный алгоритм ДНК-диагностики МВ.

Белки с шаперонными свойствами играют важную роль как в риске развития ишемического инсульта (ИИ), так и в защите клеток в условиях ишемии. Целью данной работы стал анализ ассоциаций полиморфных вариантов генов Hero (SERBP1, SERF2, C19orf53, C11orf58, C9orf16) с риском развития и клиническими проявлениями ИИ. Обнаружено, что связь SNPs Hero с ИИ характеризуется пол-специфическими эффектами, а также значительно модулируется средовыми факторами риска. Функциональное аннотирование SNPs показало, что молекулярные механизмы связи генов Hero с ИИ обусловлены их участием в регуляции нейро- и ангиогенеза, апоптоза, окислительного стресса, гипоксии и воспаления.

В кратком сообщении представлены результаты анализа генетической дифференциации пяти популяций Дагестана, относящихся к двум языковым ветвям, по 15 X-STR, используемым для ДНК-идентификации.

Изучена брачная структура супружеских пар при проведении репродуктивного генетического скрининга на носительство наследственных заболеваний. Оценку брачной структуры проводили по данным этнической принадлежности и по месту рождения супругов. Брачные миграционные процессы ограничены территорией Якутии. Наиболее часто встречаются моноэтнические якутские браки. Получено положительное значение брачной ассортативности у якутов. Выявлена высокая частота гетерозиготного носительства аутосомно-рецессивных заболеваний. Для их профилактики необходим генетический скрининг по всей территории республики.

Приведена клинико-генетическая характеристика 9 случаев гиперфенилаланинемии (ГФА), выявленных в ходе расширенного неонатального скрининга (РНС) за период 2023-2024 гг. При подтверждающей диагностике с использованием тандемной масс-спектрометрии и молекулярно-генетического исследования генов, ассоциированных с ГФА, у 5-х детей диагностирована тяжёлая ГФА и у 4-х – легкая. У всех больных с тяжёлой ГФА наблюдались мутации в гене PAH: частая мутация с.1222С>T в гомо- или гемизиготном состоянии (у 3-х детей), сочетание двух патогенных нуклеотидных вариантов в компаунд-гетерозиготном состоянии (у 2-х детей ). Трое детей с легкой ГФА имели мутации в гене PAH в компаунд-гетерозиготном состоянии: частую мутацию и редкую (1 ребенок); частую и мутацию с неустановленной клинической значимостью (1 ребенок), две редких мутации (1 ребенок). Один ребенок с легкой ГФА имел 2 мутации в гене PTS в компаунд-гетерозиготном состоянии. Все дети (как с тяжёлой ГФА, получающие лечение, так и с лёгкой ГФА, имеющие допустимый уровень фенилаланина в крови и не получающие лечение) находились в удовлетворительном состоянии и наблюдались врачом генетиком со второй недели жизни.

Семейная гиперхолестеринемия (СГХС) – это частое генетическое заболевание, характеризующееся высоким уровнем общего холестерина (ОХС) и холестерина липопротеинов низкой плотности (ХС-ЛПНП) в крови. Несмотря на большую распространённость СГХС в мире и России, остаётся актуальной проблема недостаточной выявляемости СГХС, что приводит к большей частоте развития ранних сердечно-сосудистых заболеваний в группе риска. Целью данной работы являлось применение технологии таргетного NGS-секвенирования для систематического скрининга СГХС. Описан новый семейный случай СГХС, связанный с патогенным вариантом в экзоне 14 гена LDLR (p.Cys677Tyr). Пробанд: женщина, 30 лет, клинический диагноз СГХС, 15 баллов в соответствии с диагностическими критериями Dutch Lipid Clinic Network. Изначальный уровень ХС-ЛПНП – 8,7 ммоль/л, на фоне подобранной терапии (розувастатин 10 мг+эзетимиб 10 мг) ХС-ЛПНП снизился до 3,1 ммоль/л. Распространённость СГХС при недостаточности диагностики заболевания остаётся актуальной проблемой медицины России. Таргетные NGS-панели являются экономически целесообразным инструментом, при этом показывая высокую эффективность в выявлении пациентов с СГХС.

Актуальность. Цитогенетические исследования выявляют хромосомные аномалии примерно в 40% лейомиом матки. При этом лейомиомы с нормальным кариотипом характеризуются скрытым мозаицизмом по числовым аномалиям хромосом 7 и 16, кратным и некратным гаплоидному набору (гетероплоидиями).

Цель: поиск клеток с аномалиями числа хромосом 7, 16 и Х в лейомиомах с аномальным кариотипом, культивированных в среде с добавлением эстрогена и прогестерона и без таковых.

Методы. Частоту и спектр гетероплоидий в образцах 9 лейомиом с аномальным кариотипом, культивированных в среде без гормонов и с добавлением эстрогена и прогестерона, определяли методом FISH на интерфазных ядрах с ДНК-зондами к локусам DXZ1, D7Z1, D16Z3 хромосом X, 7 и 16, соответственно.

Результаты. Во всех культурах лейомиом выявлены малочисленные популяции тетраплоидных клеток и клеток с моносомиями по хромосомам X, 7 и 16. Суммарная частота гетероплоидий варьировала от 0,8 до 9,1%, с преобладанием тетраплоидных клеток над моносомными, а также моносомий по хромосоме 7 над моносомиями по хромосомам 16 и X. Спектр и частота гетероплоидий не различались между образцами лейомиом, культивированными с добавлением гормонов и без таковых.

Выводы. Малочисленные популяции тетраплоидных и моносомных клеток характерны для культивированных лейомиом не только с нормальным, но и с аномальным кариотипом. При этом добавление в культуральную среду эстрогена и прогестерона не влияет на частоту и спектр гетероплоидий.

При нарушении стабильности атеросклеротических бляшек (АСБ) сонных артерий отмечают изменение экспрессии микроРНК кластера miR-143/145. В некоторых тканях экспрессию кластера miR-143/145 регулирует изменение уровня метилирования промотора гена-хозяина CARMN (он же MIR143HG), однако возможно влияние метилирования в промоторах генов MIR143 и MIR145, приходящихся на «тело» гена CARMN. Как правило, для уровней экспрессии генов и метилирования в их промоторных регионах отмечается отрицательная корреляция. Целью работы был анализ связи экспрессии кластера микроРНК miR-143/145 с уровнем метилирования CpG-сайтов в гене CARMN в АСБ. ДНК и микроРНК для анализа выделены из АСБ пациентов с клинически выраженным атеросклерозом сонных артерий (n=14). Анализ метилирования ДНК проведен на метилочипе, экспрессии микроРНК – методом microRNA-seq. Выявлена обратная корреляция экспрессии miR-145-3p и miR-143-3p с метилированием cg01726320, cg01558401 и cg26585864 в промоторе CARMN и прямая – с метилированием cg04317047, cg16684117 и cg21242144 в «теле» гена CARMN и в промоторах MIR143 и MIR145. Полученные результаты говорят о важной роли метилирования промотора генахозяина CARMN в регуляции экспрессии кластера miR-143/145 при атеросклеротическом поражении сонных артерий.

На сегодняшний день имеются данные о том, что хромосомная нестабильность может быть связана с нарушением развития ЦНС. В работе описывается сравнительный анализ двух случаев хромосомной нестабильности у детей с психическими расстройствами и похожим анамнезом, обследованных цитогенетическими и молекулярно-цитогенетическими методами (SNP-array). Показано, что повышенный уровень хромосомной нестабильности ассоциируется с отрицательной динамикой заболевания. Метод SNParray в сочетании с биоинформатическим анализом позволил определить генетические варианты, связанные с возникновением и ростом уровня хромосомной нестабильности.

Введение. С 2023 года в Российской Федерации реализуется программа расширенного неонатального скрининга, включающая молекулярно-генетическую диагностику фенилкетонурии (ФКУ)/гиперфенилаланинемии (ГФА) у новорожденных с повышенным уровнем фенилаланина (ФА). Анализ большой группы пациентов, собранной из всех регионов России, позволил оценить широкий диапазон аллельных вариантов гена РАН.

Методы. Анализировались 1254 образца высушенной крови на фильтр-бумаге и цельной крови в пробирке с ЭДТА новорожденных, у которых при проведении скрининга методом тандемной масс-спектрометрии (ТМС) были выявлены повышенные значения ФА (>120 мкмоль/л), соотношения ФА/тирозин (>3мкмоль/л) на 2 сутки жизни и более. Проведен повторный анализ методом ТМС новорожденных одновременно с анализом 25 частых вариантов методом аллель-специфичной MLPA (1252 пробанда), далее при наличии одного патогенного варианта в гене PAH и/или повторном повышении уровня ФА последовательно проводилось панельное NGS секвенирование (гены РАН, PTS, QDPR, GCH1, PCBD1, SPR, DNAJC12) и анализ методом количественной MLPA.

Результаты. У 540 новорожденных (1080 хромосом) было выявлено 2 и более патогенных варианта гена РАН. У 5 пробандов установлены два варианта в генах, ответственных за развитие ГФА. Частота молекулярно-генетически подтвержденной ФКУ в Российской Федерации составила 1:4501 человек, в отличие от ранее рассчитанной частоты 1:7000.

Своевременное направление пациента на медико-генетическое консультирование (МГК) по поводу возникшего рака молочной железы (РМЖ) позволяет скорректировать лечение и предпринять превентивные меры.

Проконсультирована пациентка 29 лет с РМЖ и отягощенным семейным анамнезом по линии матери. Учитывая отсутствие частых патогенных вариантов в генах BRCA1, BRCA2, проведено панельное таргетное секвенирование. По результатам тестирования выявлен патогенный вариант с.844С>T (p.Arg282Trp) в экзоне 8 гена TP53 в гетерозиготном состоянии, связанный с развитием синдрома Ли-Фраумени. Валидация результата выполнена методом секвенирования по Сэнгеру.

Учитывая наследственную природу заболевания, а также имеющийся риск развития первично-множественного РМЖ, пробанду выполнено хирургическое вмешательство в объеме радикальной двусторонней подкожной мастэктомии с одномоментной реконструкцией эндопротезами и биопсией сторожевого лимфатического узла слева. Лучевая терапия не проводилась в связи с высокой вероятностью радиационно-индуцированного рака при данном синдроме. Таким образом, направление пациентки на МГК и последующее проведение ДНК-диагностики позволили скорректировать лечение и предпринять превентивные меры.

Целью настоящего исследования стали подбор и определение списка наследственных заболеваний в якутской популяции для проведения пилотного молекулярно-генетического скрининга на мажорные мутации в программах пренатального, неонатального скрининга. Были определены 17 заболеваний и мажорных мутаций, 13 из которых могут быть включены в список кандидатных генов наследственных заболеваний для программы молекулярно-генетического скрининга в рамках программ расширенного неонатального или раннего пренатального скрининга.

Цель настоящего исследования заключалась в изучении экспрессии мРНК генов IL20RB, SELENOP в лейкоцитах периферической крови (ЛПК) больных саркоидозом лёгких. В исследование включено 52 человека, из которых 24 – пациенты (средний возраст 42,11±2,21 года) с установленным диагнозом саркоидоз лёгких, хроническое течение, II стадия, не получающие терапию. Диагноз установлен в соответствии с критериями на основе клинико-рентгенологических и лабораторных изменений с гистологической верификацией исследования биоптата. Контрольная группа сформирована из 28 условно здоровых доноров (средний возраст 43,03±1,84 года). Уровень транскриптов генов IL20RB, SELENOP в исследуемых группах оценивали методом ПЦР в режиме реального времени. Согласно полученным данным, уровень экспрессии мРНК гена IL20RB в ЛПК больных саркоидозом лёгких ниже в сравнении с контролем (p=0,0001). Количество транскриптов гена SELENOP достоверно отличалось от показателей в контрольной группе (p=0,0004). Результаты исследования могут свидетельствовать о вероятном вовлечении исследуемых генов в патогенез саркоидоза лёгких.

Введение. Мутации в гене STRC – вторая основная причина врожденной двусторонней тугоухости легкой или умеренной степени после мутаций в гене GJB2.

Цель: оценить распространенность аутосомно-рецессивной формы DFNB16, данные анамнеза и результаты аудиологического обследования детей с мутациями в гене STRC.

Методы. Анализ амбулаторных карт детей с 2008 по 2023 г.р., состоящих на диспансерном учете в Городском детском консультативно-диагностическом сурдологическом центре, осмотр, аудиологическое и оториноларингологическое обследование, анализ результатов генетических исследований.

Результаты. Проанализированы амбулаторные карты 1256 детей с двусторонней тугоухостью I и II степени. Генетическое обследование проведено 540 детям (43%). В этой группе мутации в гене GJB2 были подтверждены у 44% обследованных, в гене STRC – у 8%, в гене USH2A – у 2%. Возраст детей с DFNB16 при первичном обращении к сурдологу составил 48 месяцев. Аудиологический скрининг в роддоме «не прошли» 50% детей, 30% имели результат «прошел», и в 20% случаев скрининг в роддоме не проводился. По данным первичной тональной пороговой аудиометрии средний порог слуха на частотах 0,5-4 кГц составил 45,8 дБ, при повторном обследовании – 42,8 дБ.

Выводы. Рецессивная форма DFNB16 в обследованной группе детей с легкой или умеренной степенями тугоухости подтверждена в 8% случаев. Наличие сопутствующей патологии ЛОР-органов увеличивает возраст обращения к сурдологу и проведения генетических исследований.

Известно, что в воздухе угольного производства содержится целый ряд канцерогенных соединений, оказывающих негативное воздействие на генетическую стабильность. В связи с этим необходимо определить генотоксические эффекты у работников угольных теплоэлектростанций. В работе изучено влияние производственной среды на эпигенетическую регуляцию генов XRCC1, XRCC2, XRCC3, XRCC4 у 455 работников угольных теплоэлектростанций г. Кемерово по сравнению с 533 неработающими на производстве жителями той же области. Оценка статуса метилирования промоторов изучаемых генов проводилась с использованием метил-специфической полимеразной цепной реакции. Установлено влияние промышленной среды на изменение статуса метилирования промоторов всех изучаемых генов у работников.

Галактоземия – аутосомно-рецессивное наследственное заболевание, связанное с нарушением преобразования галактозы в  глюкозу. Поскольку галактоза является одним из основных сахаров материнского молока и поступает в организм новорожденного с первых часов жизни, ранняя диагностика галактоземии является приоритетной задачей. Целью этого исследования являлась разработка технологии ранней диагностики галактоземии с использованием отечественных реагентов путем измерения общей галактозы в сухих пятнах крови (DBS). Набор основан на ферментативном окислении галактозы в галактонат галактозодегидрогеназой, при котором происходит восстановление NAD⁺ до NADH. Регистрация происходит по измерению интенсивности флуоресценции NADH. Галактозо-1-фосфат, содержащийся в эритроцитах, под действием фермента щелочной фосфатазы превращается в галактозу. На сегодняшний день разработаны регламент и инструкция к набору. Нами разработаны штаммы-продуценты галактозодегидрогеназы и щелочной фосфатазы. Полученные ферменты могут долгое время храниться в лиофилизованном виде и сохраняют высокую активность после реконструкции в буферных растворах. Новый набор не уступает по точности определения галактозы аналогичным, но имеет новую реагентную базу.

Представлена молекулярно-цитогенетическая характеристика возникшей de novo дериватной Х хромосомы с терминальной делецией короткого плеча и терминальной дупликацией длинного плеча у девочки с аномальным фенотипом. Обсуждаются возможный механизм формирования данной хромосомной аномалии и роль хромосомного дисбаланса в формировании клинических проявлений.

Приведен клинический случай болезни Вильсона-Коновалова в сочетании с хроническим вирусным гепатитом С у пациента 36 лет. Отражена динамика состояния пациента с момента диагностики заболевания до настоящего времени, данные инструментальных и лабораторных исследований, лечение пациента.

Синдром Ниймеген (СН) − заболевание с аутосомно-рецессивным типом наследования из группы комбинированных первичных иммунодефицитом (ПИД)/врожденных дефектов иммунитета (ВДИ) c нарушением репарации ДНК, характеризуется четко очерченным фенотипом (микроцефалия, «птичье» лицо), высокой частотой развития инфекционных осложнений и злокачественных новообразований (ЗНО). 99% случаев СН в Российской Федерации (РФ) связано с наличием «славянской» делеции c.657_661delACAAA в гене NBN в гомозиготном состоянии в семьях с неродственным браком. В связи с высокими рисками развития жизнеугрожающих осложнений, в частности ЗНО, терапией выбора является трансплантация гемопоэтических стволовых клеток до развития опухолей. Нами представлен случай быстрой постановки диагноза у ребенка с микроцефалией, положительным результатом РНС (низкие значения TREC, KREC) и поздней диагностики данного заболевания у старшей сестры пробанда. Программа расширенного неонатального скрининга (РНС) открывает возможности своевременной диагностики редких заболеваний, раннего начала лечения, а также планирования семьи.

Эндогенные ретровирусы человека (HERV) – это последствия инфекции ретровирусами, которые интегрировались в геном человека и сохранились в процессе эволюции. Подгруппа HML2 является частью семейства HERV-K и сохраняет активность в определенных типах клеток. Цель данного исследования: оценить экспрессию HML2 в образцах нормальных и опухолевых тканей пациентов с колоректальным раком (КРР) с использованием нескольких биоинформатических инструментов и сравнить их результаты.

Для анализа экспрессии HML2 использовали три биоинформатических инструмента: GeneTEFlow, TECount и Telescope. Дифференциальная экспрессия была оценена с помощью пакета DESeq2. В ходе исследования мы также провели проверку детектированных транспозиций в геномных данных с помощью инструмента MELT. Все локусы, показывающие экспрессию по транскриптомным данным, были подтверждены в геномных данных.

Выявлены локусы с повышенной экспрессией HML2 в образцах КРР: 1q22, 7p22.1, 8p23.1, 10q24.2, 11q12.1, 11p15.4b, 9q34.11, 19q13.41 и 22q11.23. В них находятся энхансеры и гены, регулирующие клеточный метаболизм, воспаление и иммунный ответ. Полученные результаты свидетельствуют о повышенной экспрессии HML2 в образцах КРР, что может указывать на возможное участие данных мобильных генетических элементов в процессах канцерогенеза. Для повышения точности и глубины исследования важно использовать несколько биоинформатических инструментов и анализировать пересекающиеся выходные данные, что позволяет минимизировать возможные ошибки и повысить достоверность результатов.

Пластинчатый (ламеллярный) ихтиоз (ЛИ) (OMIM: 606545) – тяжелое, аутосомно-рецессивное, генетически гетерогенное заболевание кожи, характеризующееся выраженным гиперкератозом, крупными, похожими на пластины, темными чешуйками и генерализованной эритродермией. ЛИ обычно проявляется с рождения или в первые несколько месяцев жизни и имеет прогрессирующее течение. С клинической точки зрения дифференциальная диагностика ЛИ с другими формами врожденного ихтиоза может быть затруднительной, что связано с большим количеством пересекающихся симптомов. В данном исследовании описывается клиническая картина двух пациентов с дерматологическими проявлениями врожденного ихтиоза. Проведено полногеномное секвенирование. В обоих случаях выявлен один и тот же патогенный вариант нуклеотидной последовательности в экзоне 7 гена ALOXE3, в первом – в компаунд-гетерозиготном, во втором – в гомозиготном состоянии, что подтверждает диагноз ЛИ. Исследование показывает, что для постановки окончательного диагноза и точной дифференциальной диагностики форм аутосомно-рецессивного врожденного ихтиоза требуется комплексный междисциплинарный подход, объединяющий эпидемиологические, клинические и генетические данные для получения новых сведений о заболевании и определения стратегий скрининга мутаций.

Введение. Прогнозирование исходов циклов вспомогательных репродуктивных технологий (ВРТ) в парах, особенно при носительстве транслокаций хромосом, является важной задачей.

Цель: определить характер влияния типа транслокации хромосом и пола носителя на эмбриологический этап циклов ВРТ при носительстве реципрокной или робертсоновской транслокации одним из супругов.

Методы. Проанализированы данные 137 эмбриологических протоколов циклов ВРТ 100 супружеских пар, в которых один из супругов являлся носителем реципрокной (31 женщина и 27 мужчин) или робертсоновской транслокации (21 женщина и 21 мужчина) хромосом.

Результаты. Проанализировано влияние типа транслокации и пола носителя на эффективность оплодотворения и доимплантационного развития. При носительстве робертсоновской транслокации частота образования двупронуклеарных зигот и способность эмбрионов к развитию до 3 дня выше при женском носительстве, чем при мужском (U=490, p=0,024 и U=476, p=0,044, соответственно). Частота образования двупронуклеарных зигот и способность эмбрионов к развитию до 3 дня выше при носительстве мужчиной реципрокной транслокации, чем робертсоновской (84,6% против 75%, U=528, p=0,017 и 59,5% против 50%, U=512, p=0,034 соответственно), что свидетельствует о негативной селекции эмбрионов до третьего дня культивирования именно при мужском носительстве робертсоновской транслокации. Способность эмбрионов к развитию до 5 дня не различалась между группами исследования (критерий Манна-Уитни, p>0,05).

Заключение. Результаты эмбриологического этапа циклов ВРТ в парах, в которых один из супругов является носителем транслокации хромосом, характеризуются самыми низкими значениями при мужском носительстве робертсоновской транслокации.

Открытие микроРНК (миРНК) предоставляет собой новый и мощный инструмент для изучения злокачественных опухолей различной локализации. Цель исследования: изучение аберрантного метилирования отдельных генов миРНК при раке яичников (РЯ). Материал: 25 парных образцов (опухоль/норма) РЯ, а также 15 контрольных образцов тканей яичников. Метод: MS-HRM анализ. Нами впервые получены сведения об уровне метилирования генов миРНК miR-663a и miR-663b при РЯ. Результаты исследования свидетельствуют о специфической вовлеченности генов микроРНК miR-663a и miR-127 в патогенез РЯ.

Синдром Питта-Хопкинса – редкое заболевание с аутосомно-доминантным типом наследования, характеризующееся комплексом патологических проявлений, включая умственную отсталость, нарушение речи, выраженную задержку когнитивного и моторного развития, а также специфические дисморфические черты лица. Заболевание обусловлено изменениями в нуклеотидной последовательности гена TCF4, кодирующего транскрипционный фактор, имеющий критическое значение для развития и функционирования нервной системы. Хотя спектр патогенных вариантов в TCF4 подробно охарактеризован, феномен их бессимптомного носительства не обсуждается в литературе. В данной работе с использованием баз данных ClinVar и gnomAD идентифицировано 7 патогенных или вероятно патогенных вариантов, встречающихся у здоровых людей: rs1568303086, rs751190049, rs121909121, rs863224934, rs1230192802, rs895426748, rs1603624808. Полученные данные свидетельствуют о необходимости функционального анализа и возможной реклассификации варианта rs1230192802. Выявленные случаи подчеркивают роль вариабельной экспрессивности вариантов в гене TCF4.

Введение. Теломеры представляют собой концевые участки хромосом, которые играют ключевую роль в клеточном старении и поддержании геномной стабильности. В то время как в соматических клетках их длина сокращается с возрастом, в сперматозоидах наблюдается обратная тенденция. Неполной остается информация о том, как длина теломер изменяется в ходе сперматогенеза человека и зависит ли она от возраста.

Цель: проанализировать, как изменяется длина теломер при дифференцировке сперматогенных клеток, и оценить ее ассоциацию с возрастом пациентов при азооспермии.

Методы. Исследование проведено на образцах биоптатов семенников 34 пациентов с азооспермией (возраст 24-60 лет). Из образцов получали цитогенетические препараты колхицинированных митотических и мейотических хромосом. Длину теломер определяли методом количественной флуоресцентной гибридизации in situ (Q-FISH) на хромосомах сперматогониев (n=483), сперматоцитов I (n=305) и сперматоцитов II (n=396).

Результаты. Показано, что длина теломер сперматогониев меньше, чем таковая сперматоцитов I (p=0,0234), а длина теломер сперматоцитов I меньше, чем сперматоцитов II (p=0,0107). Установлена положительная корреляция между длиной теломер в сперматоцитах II и возрастом пациентов (ρ=0,3966; p=0,0496). Взаимосвязи возраста пациентов с длиной теломер в сперматогониях и сперматоцитах I не обнаружено (ρ=0,0643; p=0,7177 и ρ=-0,03297; p=0,8531, соответственно).

Заключение. Таким образом, при азооспермии длина теломер в сперматогенных клетках увеличивается от сперматогониев к сперматоцитам I, а затем к сперматоцитам II, и в сперматоцитах II она тем больше, чем старше пациент.

Патогенные биаллельные варианты гена NBAS вызывают аутосомно-рецессивное наследственное заболевание, ассоциированное с широким спектром симптомов, вовлекающих печень, скелет, глаза и нервную систему. За последнее время описано немногим более 100 пациентов, проводились попытки раскрытия корреляции фенотипа и генотипа. Нами представлено описание пациента с клиническим фенотипом, сочетающим в себе признаки синдрома SOPH (OMIM# 614800) и изолированной острой печеночной недостаточности 2 типа (ОMIM# 616483). Путём полноэкзомного секвенирования (WES) идентифицированы патогенные варианты гена NBAS: NM_015909.4:c.686dupT; p.(Ser230Glnfs*4) и миссенс-вариант NM_015909.4:c.5741G>A; p.Arg1914His. Методом секвенирования по Сэнгеру проведена валидация вариантов, доказано их транс-положение.

В работе представлены результаты исследования генетических вариантов F2 G20210A, F5 G1691A, F7 G10976A, F13A G103T, FGB G-455A, ITGA2 C807T, ITGB3 T1565C и SERPINE1 5G-6754G, ассоциированных с нарушениями гемостаза, в когорте пациентов, обратившихся за медицинской помощью в НМИЦ им. В.А. Алмазова с 2018 по 2022 гг.

Введение. Спиноцеребеллярная атаксия 1 типа (СЦА1) является аутосомно-доминантным заболеванием, относящимся к болезням экспансии. Новым методом профилактики СЦА1 служит ПГТ-М (преимплантационное генетическое тестирование моногенных болезней).

Цель: анализ изменения числа тринуклеотидных повторов гена ATXN1 в эмбрионах, протестированных в ходе ПГТ-М СЦА1.

Методы. Материалом для исследования являлась трофэктодерма эмбрионов 5-6 суток развития, полученных в ходе цикла ЭКО-ИКСИ, от пар, в которых один из супругов имел увеличение CAG-повторов в гене ATXN1. Исследование проведено методом гнездовой ПЦР с детекцией числа тринуклеотидных повторов гена ATXN1 и косвенных микросателитных маркеров, сцепленных с геном.

Результаты. Проведено тестирование 29 эмбрионов в трех неродственных семьях. Гаплотип, ассоциированный с экспансией, выявлен у 13 эмбрионов. В восьми эмбрионах наблюдалось изменение количества тринуклеотидных повторов в гене ATXN1.

Выводы. Изменение числа CAG-повторов гена ATXN1 (как увеличение, так и уменьшение) выявлено в аллелях с экспансией.

Анализ частых патогенных вариантов гена GALT проводился на протяжении 4,5 лет у детей с галактоземией, подозрением на галактоземию, включая новорожденных с повышенными или пограничными значениями общей галактозы. Обследовано 36 детей (33 неродственных) и 18 родителей. Выполнен один случай пренатальной диагностики. В одном случае галактоземии I типа был выявлен гомозиготный генотип по p.Gln188Arg. Остальные случаи генотипов с двумя выявленными вариантами были комбинациями с вариантом Дуарте D2. В 30,3% случаев один аллель остался невыявленным, в 15,2% – оба. Частота аллелей составила: p.Gln188Arg – 33,9%, p.Lys285Asn – 5,4% и аллель Дуарте D2 – 41,1%.

Для расширенного скрининга носительства (РСН) патогенных вариантов (ПВ) в генах, связанных с аутосомно-рецессивными заболеваниями (АРЗ), ACMG был предложен подход, учитывающий, как тяжесть заболеваний, так и частоты носительства ПВ в генах, связанных с АРЗ. Цель – оценка частоты носительства ПВ в генах, связанных с АРЗ и не включенных в рекомендации ACMG, в российской популяции. Была проведена оценка частоты носительства ПВ в 303 кандидатных генах в выборке пациентов НМИЦ ТПМ (n=1126). Для генов с частотой носительства ПВ, превышающей пороговое значение 0,005, проводилась оценка с помощью Базы данных популяционных частот генетических вариантов населения Российской Федерации». Частота носительства ПВ в гене SBDS (частота носительства=0,01171; p_adj < 0,001), связанном с синдромом Швахмана–Даймонда, и в гене ALOX12B, связанном с аутосомно-рецессивным врожденным ихтиозом (частота носительства=0,005845; p_adj < 0,001) в РФ превысила пороговое значение. Эти гены могут быть рассмотрены в качестве кандидатных для РСН в российских популяциях.

Результаты преимплантационного генетического тестирования на анеуплоидии (ПГТ-А) не всегда совпадают с истинной генетической конституцией бластоцисты, особенно в случаях сложных хромосомных перестроек. Это может быть обусловлено как истинно биологическими причинами, такими как коррекция анеуплоидии и мозаицизм, так и техническими особенностями методов ПГТ-А. В данном сообщении мы приводим результаты анализа клеток трофэктодермы (ТЭ) и внутренней клеточной массы (ВКМ) из одной бластоцисты методами хромосомного микроматричного анализа (ХМА) и флуоресцентной гибридизации in situ (FISH) и их сравнение с результатом ПГТ-А. При ПГТ-А методом ХМА в клетках ТЭ исследуемой бластоцисты была выявлена тетрасомия по короткому плечу Х хромосомы, что стало основанием для признания эмбриона непригодным для переноса в полость матки. Была проведена повторная биопсия клеток ТЭ с последующим ХМА, а затем – разделение оставшейся части бластоцисты на ТЭ и ВКМ для анализа методом FISH с ДНК-зондами к короткому плечу и околоцентромерному району Х хромосомы. В каждом из 10 исследованных ядер клеток ТЭ было выявлено по четыре сигнала, соответствующих хромосоме Х, а в каждом из 7 исследованных ядер клеток ВКМ – по 2 сигнала. В результате как ХМА, так и FISH в ТЭ была выявлена тетрасомия по короткому плечу хромосомы Х. В ВКМ хромосомный дисбаланс по коротким плечам хромосомы Х отсутствовал. Таким образом, установлен истинный межтканевой мозаицизм по тетрасомии короткого плеча хромосомы Х.

Введение. Повышение содержания внеклеточного АТФ связано с активацией NLRP3 инфламмасомы, выработкой провоспалительных цитокинов и развитием воспаления. В регуляции уровня внеклеточного АТФ и аденозинэргического сигнального пути принимают участие эктонуклеотидазы СD39 и CD73, рецепторы аденозина, расположенные на поверхности ряда иммунных клеток. Однако сведения об изменении уровня экспрессии генов, которые кодируют данные ферменты (ENTPD1 (CD39), NT5E (CD73)) и рецепторы аденозина при эссенциальной артериальной гипертензии (ЭАГ) пока малочисленны.

Цель: определение уровня мРНК генов, кодирующих белки пуринэргического сигнального пути (ENTPD1, NT5E, ADORA2A) и гена NLRP3 в лейкоцитах периферической крови (ЛПК) больных ЭАГ.

Пациенты и методы. В исследовании приняли участие 16 здоровых индивидов, 17 пациентов с ЭАГ I-II стадии (из них 8 человек до назначения антигипертензивных препаратов и 9 человек, принимающих более года метапролол (25 мг/сут) или бисопролол (5-10 мг/сут)). Относительный уровень транскриптов генов определяли методом ПЦР в режиме реального времени.

Результаты. Уровень экспрессии генов ENTPD1, NT5E, ADORA2A, NLRP3 в лейкоцитах периферической крови больных ЭАГ был выше, чем у здоровых людей (р<0,05). Уровень экспрессии гена NLRP3 оказался тесно связан с относительным содержанием мРНК генов ENTPD1, NT5E, ADORA2A (соответственно, r=0,77; 0,66; 0,72; p<0,01).

Заключение. Формирование ЭАГ сопровождается повышением уровня экспрессии генов ENTPD1, NT5E, ADORA2A, NLRP3, что, вероятно, отражает активацию пуринэргического сигнального пути при данном заболевании.

Актуальность. Изучение механизмов влияния делеций локуса AZF на хромосоме Y, в том числе за счет нарушений биогенеза мРНК, регулируемого белком коилином, на мужскую фертильность является актуальной задачей.

Цель: поиск ассоциаций между содержанием и распределением в сперматогенных клетках коилина и типом делеции локуса AZF у пациентов с азооспермией.

Методы. Исследование проведено на биоптатах семенников 12 пациентов с азооспермией. Локус AZF анализировали методом ПЦР, коилин выявляли методом иммуногистохимии.

Результаты. Анализ локуса AZF позволил установить отсутствие делеций в 4 образцах, делецию gr/gr в 4 образцах и делеции AZFc и AZFb+c в 4 образцах. Коилин был локализован в ядрах только некоторых сперматогенных клеток. Среди сперматогониев А, сперматогониев В и сперматоцитов I, гаплоидных сперматогенных клеток образцов с делецией gr/gr доля клеток с коилином была выше, чем в образцах без делеций AZF (критерий хи-квадрат, р<0,001). В образцах с делециями AZFc и AZFb+c доля клеток с коилином как среди сперматогониев В и сперматоцитов I, так и среди гаплоидных клеток была больше по сравнению с группой без делеций (критерий хи-квадрат, р<0,025 и р<0,001, соответственно).

Заключение. Увеличение доли клеток с коилином на любом этапе сперматогенеза свидетельствует о его роли в патогенезе мужского бесплодия, связанного с делециями локуса AZF. Повышенное содержание коилина в сперматогенных клетках биоптатов с делецией gr/gr указывает на его возможное участие в компенсаторных механизмах поддержания сперматогенеза.

Большинство студентов первого курса медицинского университета, пришедших из разных учебных заведений, имеет разный базовый уровень подготовки по генетике. Таким образом, на первом курсе необходимо выровнять уровень знаний по данному предмету у обучающихся и расширить его, сформировав базу для дальнейшего изучения медицинской генетики на более старших курсах. С целью повышения качества преподавания генетики на первом курсе медицинского университета было проведено анкетирование студентов после изучения предмета. В ходе исследования было выявлено, что трудности возникают у большинства студентов с изучением молекулярных основ наследственности, а именно с процессами матричного синтеза, строением гена и этапами экспрессии гена. Несмотря на трудности, абсолютное большинство первокурсников отмечает актуальность данного предмета и хочет продолжить обучение по нему, углубляясь в изучение наследственных заболеваний человека и основы их возникновения.

Введение. Разработка прогностических моделей является актуальной задачей современной медицины. Это позволяет идентифицировать переменные, влияющие на прогнозирование риска появления или рецидива заболевания, например грыж передней брюшной стенки.

Цель: провести анализ факторов риска и разработать прогностическую модель вентральной грыжи.

Методы. Исследование выполнено у 579 пациентов. Изучались морфологические факторы в биоптате коже и методом аутофлюоресценции кожи. Выполнялся ПЦР анализ rs3809060 гена WT1 и rs2009262 гена EFEMP1.

Результаты. В прогностическую модель были включены 1 генетический (rs2009262 EFEMP1) и два морфологических фактора изменения соединительной ткани. В последующем с помощью логистической регрессии выполнялся прогноз возникновения грыжи, а также ее рецидива, после чего пациентам выполняли различные типы герниопластики.

Заключение. Таким образом, это исследование вновь доказало большую роль генетического и морфологических факторов, связанных с изменениями в соединительной ткани, определяющих тактику хирурга.

Введение. Аномалии Х-хромосомы – одна из частых причин нарушений формирования пола, физического и полового развития, фертильности. Мозаицизм по Х-хромосоме у пациенток женского пола может приводить к синдромальным гоносомным аномалиям (синдрому Шерешевского-Тернера, трисомии Х, полисомии Х и др.), при этом некоторые кариотипы могут встречаться при разных клинических формах, что обуславливает их частичную перекрываемость.

Цель: представить случай сложного мозаицизма по X-хромосоме у пациентки с привычным невынашиванием беременности. Пациентка 37 лет обратилась с жалобами на невынашивание беременности. Развитие пациентки протекало по возрасту. В анамнезе 3 беременности, наступивших естественным путем, первая закончилась родами здорового мальчика, вторая и третья – замерли на ранних сроках.

Методы. Стандартное цитогенетическое исследование проводили на лимфоцитах периферической крови. Флуоресцентную in situ гибридизацию выполняли на ядрах лимфоцитов и клеток буккального эпителия с центромерными зондами на хромосомы 18 и Х.

Результаты. Кариотип по данным стандартного цитогенетического исследования определен как mos 45,X[29]/47,XXX[8]/46,XX[3]. По результатам FISH подтверждено наличие сложного мозаицизма по Х-хромосоме в лимфоцитах периферической крови – Х(78%)/ХХХ(10%)/ХХ(12%), выявлен мозаицизм в клетках буккального эпителия – ХХХ(70%)/Х(7%)/ХХХХ(3%)/ХХ(20%).

Заключение. Пациентки со сложным мозаицизмом по хромосоме Х могут не иметь выраженных клинических признаков. Поскольку данные пациенты имеют риск преждевременной недостаточности яичников, им требуется решение вопроса репродукции с проведением преимплантационного генетического тестирования на анеуплоидии (ПГТ-А), пренатальной цитогенетической диагностики.

Льготное лекарственное обеспечение за счет федерального или регионального бюджетов доступно пациентам при 28 редких (орфанных) заболеваниях, все пациенты учитываются в федеральных регистрах. Дополнительным механизмом обеспечения лекарственными препаратами детей с редкими (орфанными) заболеваниями до 19 лет является фонд «Круг добра», дети учитываются в информационном ресурсе Фонда. Учет в федеральных регистрах и льготное лекарственное обеспечение больных с редкими (орфанными) заболеваниями старше 19 лет могут быть организованы по нескольким сценариям. Для большинства больных лекарственное обеспечение возможно только при наличии статуса «инвалид», учет таких больных в федеральных регистрах пациентов с редкими (орфанными) заболеваниями не ведется. В результате анализа федеральных и региональных программ государственных гарантий льготного лекарственного обеспечения, в рамках которых возможно продолжение лекарственной терапии орфанными препаратами для пациентов с редкими (орфанными) заболеваниями старше 19 лет, установлено, что необходимо расширение государственных гарантий лекарственного обеспечения пациентов с редкими (орфанными) заболеваниями старше 19 лет по факту наличия у них «редкого» диагноза без необходимости иметь инвалидность.

Несмотря на сообщения о связи геномной/хромосомной нестабильности с нарушением развития ЦНС, соответствующие исследования систематически не проводились. В настоящей работе были исследованы 300 образцов крови детей с нарушением развития ЦНС (аутистические расстройства, умственная отсталость, эпилепсия) с помощью цитогенетического анализа и методом SNP-array. Хромосомная нестабильность обнаружена в 25 случаях (8,3%), геномная нестабильность – в 56 (18,7%). Таким образом, у 27% детей с нарушением развития ЦНС наблюдается хаотизация генома в виде хромосомной и геномной нестабильности.

Множественная экзостозная хондродисплазия (МЭХД) – заболевание, характеризующееся образованием доброкачественных остеохондром. Причиной МЭХД являются патогенные варианты в генах EXT1 и EXT2, однако имеются случаи с неизвестной этиологией. В недавних исследованиях было предположено, что в патогенезе МЭХД могут быть задействованы гены FUT7 и PTPN11. В данной работе проведен анализ белок-белковых взаимодействий EXT1 и EXT2, их патогенных вариантов, а также белков FUT7 и PTPN11 инструментом AlphaFold. Подтверждена тесная связь EXT1 и EXT2, необходимая для формирования нативного гликозилтрансферазного комплекса, нарушения которой могут вызывать известные патогенные варианты. Прямых сайтов связывания между EXT1 и FUT7 не выявлено. Выявлено возможное взаимодействие EXT1 и PTPN11 через наличие консенсусных сайтов связывания. Полученные результаты могут стать основой для будущих исследований, направленных на изучение патогенеза МЭХД и разработку подходов к её терапии.

Представлен случай выявления интрагенной делеции экзонов 30-32 гена DMD методом хромосомного микроматричного анализа (ХМА) у пациента с нарушением психомоторного развития (НПМР), позволивший установить диагноз мышечной дистрофии Беккера (МДБ) на доклинической стадии. Продемонстрирована эффективность ХМА в диагностическом поиске у пациентов с недифференцированным фенотипом.