Том 15, № 6 (2016)
ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
3-10 925
Аннотация
В рамках генетико-эпидемиологического изучения Ростовской области у 131 пациента с фенилкетонурией проанализированы результаты ДНК-диагностики, показатели уровня фенилаланина и зависимость клинических проявлений заболевания от генотипа больных. У 130 пациентов с фенилкетонурией выявлено 40 мутаций (49 различных генотипов) в гене РАН, у одного - в гене PTS. Проведен анализ гено-фенотипических корреляций, изучена взаимосвязь генотипов и показателей фенилаланина до начала лечения и на фоне проводимой диетотерапии. В процессе исследования получены результаты, которые свидетельствуют о зависимости клинической картины фенилкетонурии от генотипа. Проведенный регрессионный анализ показал наличие значимых отрицательных корреляций между активностью фермента фенилаланингидроксилазы и уровнем фенилаланина у больных при ретестировании и в результате диетотерапии.
11-18 812
Аннотация
Хроническая сердечная недостаточность (ХСН) является одной из лидирующих причин инвалидизации и смертности населения. Учитывая важную роль нейроэндокринных систем в развитии ХСН, актуальным подходом является изучение полиморфизма генов, продукты экспрессии которых участвуют в формировании различных типов ремоделирования миокарда и прогрессировании ХСН . Проведено изучение трех полиморфных локусов гена ACE - rs4343 (2350 G>А) , rs4291 (240A>T), rs4340 (I/D) у 271 пациента с ХСН (II-IV ФК) с различными типами ремоделирования левого желудочка (ЛЖ) и 194 условно здоровых мужчин и женщин соответствующего возраста, а также гаплотипов изученных полиморфных локусов гена АСЕ . Значимыми в развитии ХСН и различных типов ремоделирования миокарда ЛЖ являются гомозиготные генотипы *G*G локуса rs4343 и *D*D локуса rs4340, а также гаплотип на основе этих двух локусов *DG гена ACE . При рассмотрении гаплотипов всех трех полиморфных локусов ACE ( rs4291 , rs4340 и rs4343 ) преобладание гаплотипа *TDG было статистически значимым у больных с выраженной гипертрофией ЛЖ и умеренной гипертрофией ЛЖ.
19-24 546
Аннотация
Меланома кожи - злокачественное заболевание человека с высоким риском метастазирования. В странах с преимущественно белым населением меланома входит в первую десятку наиболее социально значимых категорий опухолей, как в отношении заболеваемости, так и смертности. Оценка ряда морфологических характеристик новообразования имеет существенное значение при определении прогноза течения заболевания и формирования групп риска у больных меланомой кожи. Целью настоящего исследования стало определение ассоциаций между мутационным статусом гена BRAF и клинико-морфологическими особенностями меланомы кожи у пациентов Юга России, проходившими плановое лечение в ФГБУ РНИОИ МЗ РФ в 2013-2015 гг. Молекулярно-генетическое исследование экзона 15 гена BRAF проведено методами прямого секвенирования по Сэнгеру и RT-PCR у 100 пациентов Юга России с морфологически подтвержденным диагнозом меланома кожи. Установлено, что присутствие мутаций в гене BRAF было достоверно связано с увеличением уровня инвазии по Кларку. Также наблюдалось статистически достоверное повышение частоты изъязвления опухоли на 54% у пациентов с наличием активирующих мутаций V600. Обнаружено, что опухоли с активирующими мутациями в гене BRAF чаще возникали на участках кожи, подверженных периодической солнечной инсоляции (туловище). Опухоли без мутаций в гене BRAF преобладали на участках кожи с хроническим солнечным облучением (голова и шея). Частота соматических мутаций V600 в гене BRAF составила 57% (57 из 100 пациентов). В рамках настоящего исследования в гене BRAF были выявлены три варианта мутаций с различными частотами встречаемости: p.V600E (88%), p.V600K (10%) и V600K601>E (2%). У пациентов моложе 50 лет частота встречаемости мутаций V600 была достоверно больше, чем в группе пациентов старше 50 лет. Также для пациентов моложе 50 лет было характерно отсутствие мутаций V600K и более высокая частота встречаемости мутаций V600E (в 1,7 раза).
Т. В. Кекеева,
Л. Х. Хашимов,
В. К. Лядов,
А. В. Каныгина,
Ю. Ю. Андреева,
Л. Э. Завалишина,
И. В. Поддубная,
В. В. Стрельников,
Д. В. Залетаев,
Г. А. Франк
25-30 754
Аннотация
Идентификация соматических генетических изменений в опухолях несет потенциальную диагностическую и прогностическую информацию о драйверных мутациях и сведения, позволяющие более обоснованно выбрать схему химиотерапевтического лечения для пациентов. Секвенирование клинического экзома уже зарекомендовало себя как высокоэффективный метод поиска мутаций. Проведен анализ соматических опухолевых изменений в клиническом экзоме, включающем 4813 генов, у шести пациентов с раком желудка (РЖ). Двухконцевое секвенирование парных образцов опухоли и нормальной ткани выполнено на приборе Nextseq500 набором «TruSight One Sequencing Panel» (Illumina). Обнаружены 102 различные соматические мутации, все они являлись однонуклеотидными заменами, их них 30 - синонимичными заменами, 66 - несинонимичными и 6 - нонсенс-мутациями. Проанализировано 82 новых мутации, из них 10 мутаций локализованы в генах, участвующих в патогенезе РЖ. Соматическая мутация известной клинической значимости обнаружена у одного пациента, и предположительно драйверные мутации найдены у трех пациентов. Дальнейшие функциональные исследования с последующим длительным наблюдением за пациентами позволят установить значимость найденных мутаций.
К. О. Карандашева,
Н. В. Жоржоладзе,
Н. Л. Шеремет,
Е. Б. Кузнецова,
А. С. Танас,
К. И. Аношкин,
Д. В. Залетаев,
В. В. Стрельников
31-36 1501
Аннотация
Актуальность. Мутации в гене ABCA4 вызывают широкий спектр рецессивных абиотрофий сетчатки, в том числе болезнь Штаргардта. Секвенирование полной белок-кодирующей последовательности гена у больных с клиническими признаками болезни Штаргардта не всегда позволяет выявить обе мутации, необходимые для развития заболевания. Ранее было высказано предположение, что патогенные мутации в гене ABCA4 могут располагаться глубоко в интронных областях, провоцируя формирование альтернативных сплайсоформ мРНК. Глубокое высокопроизводительное параллельное секвенирование РНК, выделенной из сетчатки доноров, выявило 15 альтернативных экзонов, слабо экспрессирующихся в нормальной сетчатке глаза человека. Были определены криптические интронные сайты сплайсинга, активация которых посредством мутаций может приводить к формированию патологических аллелей ABCA4 . Цель. Провести анализ криптических сайтов сплайсинга в некодирующих областях гена ABCA4 у российских пациентов с болезнью Штаргардта. Материалы и методы. Определение нуклеотидных последовательностей всех ранее описанных минорных экзонов и прилегающих к ним областей проведено в выборке из 29 пациентов с болезнью Штаргардта методом высокопроизводительного параллельного полупроводникового секвенирования ДНК клеток периферической крови. Результаты. В исследованной выборке выявлены только генетические варианты в криптических сайтах сплайсинга, представляющие собой частые полиморфизмы, которые не могут быть интерпретированы как патогенные мутации. Предположительно патогенных интронных нуклеотидных замен, которые ранее были выявлены в США и странах Западной Европы, нами не наблюдалось. Выводы. Отсутствие интронных мутаций в исследованных районах гена ABCA4 в выборке может объясняться низкой долей пациентов с единственной гетерозиготной экзонной мутацией или с отсутствием экзонных мутаций в гене ABCA4 , и не ставит под сомнение целесообразность поиска вариантов криптических сайтов сплайсинга в рамках молекулярно-генетической диагностики болезни Штаргардта.
Т. А. Васильева,
О. В. Хлебникова,
А. В. Марахонов,
Н. В. Петрова,
А. А. Воскресенская,
Н. А. Поздеева,
И. А. Крынская,
Ю. О. Козлова,
Н. В. Ряднинская,
А. Л. Чухрова,
Н. В. Шилова,
Р. А. Зинченко
37-43 671
Аннотация
Актуальность . Врожденные пороки развития органа зрения составляют немалую долю причин инвалидизации в детском возрасте. Врожденная аниридия является тяжелым наследственным пороком развития, наследующимся аутосомно-доминантно. Врожденная аниридия вызывается мутациями гена PAX6 . Цель . Оценить спектр генетических нарушений в группе больных врожденной аниридией из российской популяции. На основе полученных результатов разработать протокол диагностики врожденной аниридии. Материалы и методы . Тридцати четырем пациентам из 27 неродственных семей проведены офтальмологическое обследование и ДНК диагностика, включающая секвенирование кодирующих экзонов гена PAX6 с последующим анализом крупных хромосомных перестроек локуса 11p13. Результаты . Проанализировано 22 больных без отягощенной семейной истории и 12 семейных случаев врожденной аниридии. У двух пациентов определена протяженная делеция региона 11p13, позволившая установить предположительный диагноз синдрома WAGR. Среди оставшихся пациентов мутации были определены во всех случаях. У 23 пациентов были обнаружены точковые мутации гена PAX6 : семь новых и восемь различных ранее описанных мутаций. Крупные делеции определены у одиннадцати пациентов. Проанализированный спектр мутаций позволил определить особенности генетических причин врожденной аниридии у российских больных и разработать протокол диагностики врожденной аниридии. Выводы . Определены мутации у 100% проанализированных больных. Разработан протокол диагностики врожденной аниридии с учетом особенностей спектра наследственных изменений, приводящих к этому заболеванию, в российской популяции.
КРАТКОЕ СООБЩЕНИЕ
44-48 794
Аннотация
Представлен редкий случай интерстициальной делеции короткого плеча хромосомы 4(р15.1-р15.32), не включающей критический район синдрома Вольфа-Хиршхорна, размер и локализация которой были уточнены методом метафазной сравнительной геномной гибридизации (CGH). Обсуждаются особенности фенотипических проявлений данного синдрома.
ISSN 2073-7998 (Print)