В статье представлен очерк жизни и научного вклада Виктора Алмона Маккьюсика (1921–2008) – выдающегося медицинского генетика, профессора Университета Джона Хопкинса, почётного члена Российской академии наук. Прослежен жизненный путь учёного от детства до многолетней работы в Университете Дж. Хопкинса, где он прошёл путь от кардиолога до создателя самостоятельного отделения медицинской генетики (1957). Выделены четыре ключевых достижения, обосновывающих признание Маккьюсика «отцом генетической медицины»: основание медицинской генетики как самостоятельной клинической дисциплины с системой образования и международных курсов; пионерские работы по картированию генов человека; лидерство в проекте «Геном человека» и создании организации HUGO; разработка каталога менделевской наследственности у человека (MIM/OMIM). Приводятся личные воспоминания автора о стажировке в Бар-Харборе (1989) и медико-генетическом консультировании в госпитале У. Ослера, а также сведения о влиянии опыта организации генетической помощи в США на открытие первой в России Генетической клиники в г. Томске (1994).

В статье прослеживаются связи Виктора Маккьюсика с отечественной генетикой от выхода русского перевода его книги «Генетика человека» (1967) до трёх визитов в СССР (в 1969, 1978, 1989 гг.). Освещены доклад Маккьюсика на XIV Международном генетическом конгрессе в Москве (1978), где он обосновал значение клинической генетики для генетики человека в целом и подчеркнул вклад советских учёных (Тимофеев-Ресовский, Дубинин) в формирование ключевых понятий. Описано его участие в Консультативных встречах HUGO, ЮНЕСКО и ГКНТ в Москве (1989), а также перевод каталога «Наследственные признаки человека» сотрудниками Института медицинской генетики АМН СССР. Отдельно рассмотрена проблема фенотипического анализа в генетической клинике и их связь с отечественной традицией феногенетики. В заключение В. Маккьюсик охарактеризован как историк медицинской генетики; выделены три положения из его лекции в Бар-Харборе (1989): немедилям как концептуальная основа нозологии, единство медицинской генетики и генетики человека, значение соматических мутаций для будущей медицинской генетики.

В статье исследована структура эпонимических названий наследственных болезней, синдромов и признаков, каталогизированных в базе OMIM (Online Mendelian Inheritance in Man), созданной Виктором Маккьюсиком. Показано, что среди более 30 тыс. единиц каталога 347 названий (1,7%) представлены эпонимами, рекомендованными в качестве основного наименования. Выделены и охарактеризованы четыре категории эпонимов: антропонимы (82,4%), акронимы (14,7%), топонимы (2,3%) и этнонимы (0,6%). Приведены примеры каждой категории. Отдельно рассмотрена проблема уничижительных (pejorative) названий наследственных синдромов, этические аспекты их употребления при общении с пациентами и дидактическая ценность образных названий в преподавании клинической генетики. Обсуждён культурно-исторический смысл эпонимической терминологии как хранителя памяти о выдающихся исследователях и событиях.

Статья посвящена анализу природы генетической гетерогенности наследственных болезней человека. Предполагается, что генетическая гетерогенность позволяет выявить главные гены для множества фенотипических признаков человека и, возможно, на этой основе попытаться создать особый уровень взаимоотношений «генотип-фенотип». Рассмотрена проблема общих транскрипционных фактов для генов, образующих одну функциональную группу в фенотипических сериях ОМІМ.

Статья посвящена анализу аллельной генетической гетерогенности наследственных болезней человека. Этот тип генетической гетерогенности позволяет выявить архитектуру генетического локуса, показать, что разные экзоны гена кодируют участки с разной значимостью, обнаружить регуляторные домены гена (тканеспецифичные энхансеры), выявляет критическую роль интронов в альтернативном сплайсинге, а также «горячие точки» и ряд других особенностей в структуре и функциях генов.

Введение. ДНК, выделенная из FFPE-образцов, не всегда пригодна для использования в генетических исследованиях. По этой причине при пробоподготовке для NGS секвенирования критически важным этапом является контроль качества до, во время и после подготовки библиотек. В данной работе были определены преаналитические и постаналитические предикторы успешного секвенирования таргетных библиотек, приготовленных по протоколу TSO 500 HT. Цель: на основе анализа выборки из 293 таргетных библиотек, приготовленных по протоколу TSO 500 HT определить значимые метрики контроля качества и пороги для каждого из показателей, разработать рекомендации для успешной подготовки и секвенированию. Методы. Проведено патоморфологическое исследование с последующим выделением ДНК 268 образцов различных типов злокачественных новообразований, приготовлены 293 таргетные библиотеки по протоколу TruSight Oncology 500 High Throughput (Illumina, США) и проведено секвенирование на приборах Illumina NovaSeq 6000 и Illumina NextSeq 2000. Результаты. Включение в протокол пробоподготовки дополнительной стадии очистки и концентрирования выделенной ДНК на 34% повышает вероятность успешного секвенирования и значимо увеличивает биоинформатические метрики: медианное покрытие экзонов, медианный размер вставки, процент экзонов, отсеквенированных с покрытием >50х. Значимыми предикторами успешности последующего секвенирования являются средняя длина библиотеки и концентрация библиотек. Вероятность успеха повышается при секвенировании библиотек с концентрацией не менее 15 нг/мкл и средней длиной не менее 240 п.н.

Актуальность. Внедрение технологий массового параллельного секвенирования (massively parallel sequencing, MPS) в клиническую практику требует разработки экономически эффективных и воспроизводимых протоколов пробоподготовки. Особый интерес представляет использование Tn5-транспозазы для подготовки ДНК-библиотек, позволяющей совместить фрагментацию ДНК и лигирование адаптеров в одной реакции, что сокращает время и количество необходимых этапов по сравнению со стандартными методами с ультразвуковой фрагментацией. Цель. Разработка протокола подготовки ДНК-библиотек на основе отечественной Tn5-транспозазы с последующим гибридизационным обогащением для таргетного секвенирования. Методы. Исследование проводили на геномной ДНК, выделенной из лейкоцитов периферической крови человека. Пре-библиотеки получали методом тагментации с использованием набора SyntEra-DNA на основе Tn5-транспозазы. Обогащение целевых регионов гена EGFR осуществляли путем двухраундовой гибридизации со специально подобранным пулом биотинилированных зондов с последующим захватом на стрептавидиновых магнитных частицах. Секвенирование обогащенных библиотек выполняли на платформе Illumina MiSeq. В качестве референсных технических данных использовали показатели секвенирования ранее полученных ДНК-библиотек, подготовленных с применением коммерческого набора SureSelectXT. Результаты и обсуждение. Разработанный протокол позволил получить ДНК-библиотеку со средней длиной фрагментов около 300 п.н. и концентрацией, достаточной для секвенирования. Доля целевых оснований гена EGFR с покрытием выше 10× достигала 98%, а доля с покрытием не менее 20× была 96%. Доля оснований, попавших в целевые регионы, составила 87%. Значение Fold-80 base penalty составило 1,5, что свидетельствует о равномерном покрытии целевой области. Выводы. Предложенный протокол на основе Tn5-транспозазы и отечественных реагентов позволил получить ДНК-библиотеку, пригодную для таргетного MPS, и подтверждает принципиальную применимость разработанного подхода для эффективного обогащения целевых регионов.

Актуальность. Внедрение алгоритмов искусственного интеллекта (ИИ) в диагностику наследственных заболеваний открывает перспективы для персонализированной медицины, однако критическим ограничением, сдерживающим клиническую валидацию таких систем, остается проблема определения необходимого объема выборки. Для орфанных заболеваний сбор репрезентативных данных сопряжен с объективными трудностями, особенно в условиях этнической гетерогенности мутационных ландшафтов. Цель: представить методологический анализ современных подходов к определению объема выборки для валидации прогностических и диагностических алгоритмов на основе ИИ в контексте наследственных заболеваний с использованием миодистрофии Дюшенна (МДД) в качестве модельной патологии. Методы. Проведен нарративный обзор литературных источников за период 2015–2025 гг., посвященных эпидемиологии МДД, методам расчета объема выборки в исследованиях с применением ИИ, байесовским подходам, трансферному обучению и инновационным статистическим фреймворкам. Представлен условный расчет объема выборки для иллюстрации сложностей эпидемиологических исследований при редких заболеваниях. Результаты. Традиционные методы расчета мощности, требующие сотен наблюдений, часто неприменимы при популяционной частоте МДД 1:3500–5000 и необходимости стратификации по этническим группам. Условный расчет для выявления различий между группами с частотами 2,5 и 4,0 на 10000 мужчин демонстрирует, что требуется суммарная выборка более 529000 наблюдений, что создает существенные ограничения для традиционного дизайна. Представлен анализ инновационных подходов: байесовские иерархические модели, трансферное обучение и специализированные инструменты планирования выборки (planningML). Заключение. Переход от эмпирических правил к строгим математическим методам планирования выборки является необходимым условием клинической валидности и этичности внедрения ИИ-диагностики наследственных болезней. Байесовские методы и трансферное обучение могут рассматриваться как перспективные инструменты для работы с ограниченными данными, однако они не отменяют требований к независимой валидации и адекватной оценке неопределенности. Рекомендованы раннее взаимодействие с регуляторными органами и прозрачная отчетность согласно расширенным версиям TRIPOD для ИИ.

В 2024 году опубликована очередная версия Международной системы цитогеномной номенклатуры человека (ISCN), которая является действующей на сегодняшний день. Эта версия представляет собой один из наиболее значительных пересмотров ISCN с целью разработки руководства более удобного для практического использования. Введены новые главы, посвящённые общим правилам ISCN и номенклатуре геномного картирования, добавлены примеры записи результатов анализа хромосомных аномалий и их мозаичных вариантов, а также дополнительные сокращения. Важным моментом в ISCN 2024 является создание стандартизированной номенклатуры для согласованного описания результатов исследования независимо от используемой цитогеномной технологии. Представлены наиболее существенные изменения, внесенные в отдельные главы, касающиеся общих положений конституциональной цитогеномики, классического цитогенетического исследования и гибридизации in situ.

Международная система цитогеномной номенклатуры человека (ISCN – International System for Human Cytogenomic Nomenclature) – это руководство, определяющее стандарты номенклатуры для описания результатов цитогенетических и цитогеномных исследований, включая микроматричный анализ. В ISCN 2024 обновлены правила описания хромосомных аномалий, обнаруженных цитогеномными методами, что позволяет обеспечить единообразие записи и интерпретации результатов исследования. В обзоре представлены наиболее существенные изменения, внесенные в номенклатуру микроматричного анализа.

Синдром KBG – аутосомно-доминантное заболевание, проявляющееся задержкой психоречевого развития, когнитивными и поведенческими нарушениями, а также особенностями фенотипа. В настоящей работе представлены два клинических случая синдрома KBG с выявленными патогенными гетерозиготными вариантами в гене ANKRD11. У обоих пациентов отмечались малые аномалии развития (долихоцефалическая форма головы, удлиненное лицо, синофриз, длинные ресницы, широкое основание носа, широкий рот, поперечные ладонные складки, укорочение и клинодактилия пятых пальцев обеих кистей), диспропорциональное телосложение, задержка психоречевого развития, изменения на ЭЭГ, вентрикуломегалия. В то же время, такой специфический признак KBG-синдрома как макродентия, отсутствует у обоих пациентов. У одного из больных заболевание сопровождалось эпилептическими приступами и аутистическими особенностями поведения, тогда как у второго присутствовали позднее закрытие большого родничка и кондуктивная тугоухость. Значительная фенотипическая вариабельность KBG-синдрома подчеркивает ключевую роль секвенирования нового поколения в диагностике этого заболевания.