Болезнь Альцгеймера является наиболее распространённой формой нейродегенеративной деменции, характеризующейся накоплением β-амилоида, гиперфосфорилированного тау-белка и выраженной глиальной реакцией. Несмотря на интенсивное изучение патогенеза заболевания, эффективные патогенетические методы терапии остаются ограниченными. В последние годы особый интерес вызывают редкие генетические варианты, ассоциированные с естественной устойчивостью к болезни Альцгеймера. Наиболее изученными среди них являются варианты APOE3 Christchurch и RELN-COLBOS, обнаруженные у носителей мутации PSEN1 Glu280Ala в колумбийских семьях с аутосомно-доминантной формой заболевания. У этих пациентов когнитивное снижение было отсрочено более чем на два десятилетия по сравнению с типичными случаями, что указывает на наличие эндогенных механизмов нейропротекции. Обзор обобщает современные данные о роли вариантов APOE и RELN в регуляции сигнального каскада Reelin–ApoE, включающего белки DAB1, AKT и GSK3β, участвующие в контроле фосфорилирования тау и синаптической пластичности. Обсуждаются возможные механизмы влияния этих генетических факторов на активность микроглии, астроцитов и сохранение синаптических структур. Понимание молекулярных основ устойчивости мозга к болезни Альцгеймера открывает перспективы для разработки новых патогенетических стратегий, направленных на модуляцию Reelin–ApoE-зависимых путей и профилактику нейродегенерации.

Миотоническая дистрофия 2 типа – мультисистемное нейродегенеративное заболевание с аутосомно-доминантным типом наследования, которое традиционно рассматривается как дебютирующее на 3-4 десятилетии жизни. В этой работе описаны клинические наблюдения миотонической дистрофии 2 типа с манифестацией в возрасте до 18 лет. По мнению авторов, ознакомление с представленными случаями будет способствовать совершенствованию знаний об особенностях фенотипических проявлений и ранней диагностике этой патологии.

Представлен клинический случай рака молочной железы, ассоциированного с беременностью (pregnancy-associated breast cancer – PABC) у пациентки с патогенным вариантом CHEK2 c.1100delC. Заболевание манифестировало в послеродовом периоде и изначально расценивалось как лактостаз, что привело к поздней диагностике опухоли крупного размера. Была проведена комбинированная терапия с полным метаболическим и морфологическим ответом, после чего выявлен наследственный характер заболевания. Обсуждаются особенности биологии PABC и влияние патогенных вариантов CHEK2 на клиническое течение и прогноз, включая риск контралатерального рака. Отмечена необходимость персонализированного подхода к диагностике и лечению у женщин репродуктивного возраста с PABC и обоснована целесообразность включения варианта CHEK2 c.1100delC в перечень скрининговых ПЦР-тестов. Подчёркиваются важность раннего генетического тестирования и отсутствие унифицированных рекомендаций по ведению таких пациенток.

В кратком сообщении представлены результаты анализа транскриптомного профиля опухолей толстой кишки и метастазов в печень в процессе химиотерапии FOLFOXIRI у больных метастатическим раком толстой кишки (мРТК). Полнотранскриптомное секвенирование проведено на платформе DNBSeq с использованием набора DNBSEQ-G400RS High-throughput Sequencing Kit (MGI, China). Продемонстрирована трансформация транскриптома первичных опухолей толстой кишки и метастазов в печень в процессе предоперационной химиотерапии FOLFOXIRI в комбинации с таргетной терапией. Определена потенциальная панель кандидатных генов IL1RN, DUSP1, NAMPT, IL7R, PCSK9, DGAT1, EPS8L2 и FOS, вовлеченных в механизмы метастазирования и ответа на химиотерапию FOLFOXIRI.

Вахтовый труд является значимым фактором риска дезадаптации и раннего ремоделирования миокарда. Распространенность артериальной гипертензии (АГ) среди мужчин, работающих вахтовым методом в Арктике, достигает 47%. АГ в данных условиях характеризуется быстрым поражением органов-мишеней и развитием сердечной недостаточности. Ранее была показана ассоциация полиморфизмов в гене TNNT2 c эхокардиографическими (ЭхоКГ) параметрами у пациентов с гипертрофической кардиомиопатией. Цель: выполнить анализ ассоциации между частыми генетическими вариантами гена TNNT2 и показателями ЭхоКГ у пациентов с АГ, работающих вахтовым методом в условиях Арктики. В исследование вошли 190 мужчин (18–70 лет), образцы ДНК которых были генотипированы методом ПЦР в режиме реального времени. В результате варианты rs1104859, rs3729547 и rs10920184 показали статистически значимую ассоциацию с некоторыми ЭхоКГ параметрами (деформация левого предсердия, толщина задней стенки и объем левого желудочка, толщина межжелудочковой перегородки), что говорит о перспективе применения генотипирования в дальнейших проспективных исследованиях течения ремоделирования миокарда у работающих вахтовым методом c АГ в Арктике.

Представлены результаты изучения изменчивости популяционной структуры населения Белгородской области с 1999 по 2019 гг. Материалом для исследования послужили данные о частотах 28574 фамилий всего населения (более 1,5 млн. чел.) Белгородской области на 2019 г. в сравнении с данными на 1999 г. За 20 лет численность населения области сократилась в среднем на 12%, количество фамилий – на 34%, уровень миграционного притока – в 4,8 раза, что привело к увеличению уровня случайного инбридинга на 22,7%. Значимыми факторами изменчивости популяционной структуры населения области в течение двух десятилетий, оцененной на основании данных о фамилиях, оставались уровень миграционного притока населения и степень развития транспортной инфраструктуры.

Основным фактором динамики генофонда мегаполиса является миграция. В двух поколениях москвичей, а также в выборках из Санкт-Петербурга и Новосибирска изучены 18 STR Y-хромосомы, по полученным гаплотипам определены гаплогруппы Y-хромосомы с помощью интернет-предиктора Whit Athey’s. В двух поколениях москвичей изучены 27 аутосомных STR, не входящих в систему CODIS. При сравнении выборки из Новосибирска с выборками из Санкт-Петербурга и младшего поколения Москвы по профилям 18 STR Y-хромосомы выявлены статистически значимые различия по оценкам F_ST. Различия между двумя поколениями москвичей для 18 STR Y-хромосомы по значению F_ST существенно превышают значение F_ST, полученное для 27 аутосомных STR. Результаты исследования по ДНК-маркерам Y-хромосомы (18 STR, гаплогруппы) и аутосомным STR демонстрируют обоснованность специфического подхода при создании референтных баз данных для мегаполисов по конкретным ДНК-маркерам, обусловленного их различной динамикой в поколениях мегаполиса. Полученные результаты подтверждают необходимость создания отдельных баз данных для каждого мегаполиса для целей ДНК-идентификации и своевременного обновления этих баз в зависимости от динамики генофонда в поколениях под действием миграции.

В полногеномных ассоциативных исследованиях различают одномаркерные и многомаркерные подходы. При использовании одномаркерных методов анализируют каждый однонуклеотидный полиморфизм (SNP) отдельно, что позволяет быстро выявлять генетические маркеры, связанные с фенотипом. Многомаркерные методы учитывают комбинации SNP, что повышает мощность тестов и общую информативность анализа, хотя и увеличивает объём вычислений. Ранее мы предложили разбивать матрицу неравновесия по сцеплению на сингулярные подматрицы, используя определитель матрицы как меру корреляции SNP в группе. Применив этот подход к генотипам представителей Западной Европы (4929 больных ишемическим инсультом, 652 индивида контрольной группы, 883749 SNP), мы идентифицировали гены-кандидаты заболевания, которые не были выявлены одномаркерными методами. В данной работе мы повторно применили этот метод к той же выборке индивидов, но с использованием в 10 раз большего количества SNP, полученных путем обогащения исходных панелей маркеров с помощью импутации. Результаты исследования показали применимость метода определителя для анализа больших наборов SNP, в том числе полученных с помощью импутации, и позволили предположить возможную роль нейрогенеза в развитии ишемического инсульта.