Preview

Медицинская генетика

Расширенный поиск
Том 18, № 5 (2019)

ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ

28-36 176
Аннотация
Актуальность. Нейрофиброматоз первого типа является одним из наиболее распространенных моногенных заболеваний. Этиологическим фактором его развития является патогенная мутация в гене NF1. Однако у части пациентов не удается достичь молекулярно-генетического подтверждения клинического диагноза. Мы полагаем, что в некоторых случаях это может быть обусловлено соматическим мозаицизмом с малой долей клеток, несущих патогенный аллель, в анализируемом образце биологического материала. Аллели с низкой представленностью отсеиваются общепринятыми фильтрами программного обеспечения при поиске генетических вариантов методом высокопроизводительного параллельного секвенирования (ВПС) и/или не детектируются визуально за счет слияния с фоновым шумом при анализе результатов секвенирования по Сэнгеру. Цель. Поиск патогенных мозаичных генетических вариантов у пациентов с нейрофиброматозом первого типа без выявленных стандартными методами герминальных мутаций в гене NF1. Материалы и методы. Исследование проведено на материале ДНК лимфоцитов периферической крови 275 пациентов, объединенных клиническим диагнозом нейрофиброматоз первого типа и отсутствием герминальных мутаций в генах NF1 и NF2 по результатам стандартных лабораторных исследований. Поиск точковых мутаций осуществляли методом ВПС на платформе Ion Torrent. Дизайн панели праймеров включал экзоны, прилегающие к ним интронные сегменты (20-70 п.н.), а также 3’UTR и 5’UTR генов NF1 и NF2. Исключение протяженных делеций в NF1 и NF2 осуществляли методом MLPA. С целью поиска мозаичных генетических вариантов был разработан и проведен углубленный анализ данных ВПС, основанный на биоинформатических и статистических подходах. Для верификации выявленных мозаичных патогенных генетических вариантов использовали секвенирование ДНК по Сэнгеру и гетеродуплексный анализ. Результаты. Патогенные соматические мутации в гене NF1 выявлены в 12 из 275 образцов (4,4%) ДНК больных, у которых были исключены герминальные мутации. В 8 образцах наличие мутантного аллеля было подтверждено альтернативными методами. Выводы. ДНК-диагностика доминантно наследуемых заболеваний требует особых подходов, учитывающих явление соматического мозаицизма. Предложенный метод позволяет выявить генетические варианты, представленные с малой аллельной частотой, без увеличения глубины секвенирования исследуемого образца и может быть применен для ретроспективного анализа данных ВПС с целью повышения качества ДНК-диагностики.

ИНФОРМАЦИЯ

КРАТКОЕ СООБЩЕНИЕ

51-53 107
Аннотация
Генетико-эпидемиологическое обследование населения республики Северная Осетия-Алания проводится сотрудниками лаборатории генетической эпидемиологии ФГБНУ «МГНЦ». В рамках стандартного протокола исследования проводится изучение максимально возможного числа популяционно-генетических характеристик. На основании 27583 брачных записей проанализированы индекс эндогамии, интенсивность метисации и этническая брачная ассортативность в 8 районах Северной Осетии и г. Владикавказе. Выявлены различия этих брачно-миграционных характеристик между двумя субэтносами - иронцами и дигорцами. Дигорцы характеризуются более высокой эндогамностью и более низкой метисацией, чем иронцы.

ОРГАНИЗАЦИОННО-МЕТОДИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ

3-27 342
Аннотация
Практические рекомендации (ПР) по обеспечению качества и надежности пренатальных и постнатальных цитогенетических исследований подготовлены рабочей группой Российского общества медицинских генетиков. Их основой послужили Европейские стандарты для цитогенетических и молекулярно-цитогенетических исследований конститутивных и приобретенных хромосомных аномалий, подготовленные постоянной рабочей группой «Цитогенетики и общество» Европейской цитогенетической ассоциации (Е.С.А.). ПР посвящены цитогенетической диагностике конститутивных нарушений, направлены на стандартизацию лабораторно-генетической службы и призваны способствовать совершенствованию цитогенетической службы РФ. В ПР рассматривают вопросы контроля качества и надежности цитогенетических и молекулярно-цитогенетических методов, используемых в цитогенетических лабораториях в настоящее время.

КЛИНИЧЕСКИЙ СЛУЧАЙ

37-43 102
Аннотация
Введение. Муколипидоз II альфа/бета (МЛ IIА/В) - редкое аутосомно-рецессивное заболевание из группы лизосомных болезней накопления. Это медленно прогрессирующая мультисистемная патология, которая проявляется с рождения и приводит к гибели пациентов в раннем детском возрасте. В статье представлены два собственных наблюдения муколипидоза II альфа/бета, обусловленного гомозиготной мутацией p. Arg375X в гене GNPTAB. Пациенты и методы. Пациент 1 впервые осмотрен врачом-генетиком в возрасте 9 дней. На основании фенотипических признаков и результатов лабораторного обследования ему установлен диагноз МЛ II. В возрасте 3 лет 4 месяцев мальчик существенно отстает в физическом и психомоторном развитии, ежемесячно болеет острыми респираторными заболеваниями. Определяются сухость кожи, гипертрихоз спины, плеч, шеи, черепно-лицевые дисморфии, короткая шея, грудная клетка бочкообразной формы, утолщение лучезапястных и голеностопных суставов наподобие «рахитических браслетов», ограничение подвижности крупных суставов, широкие кисти, ограничение разгибания межфаланговых суставов, диастаз прямых мышц живота, двусторонняя пахово-мошоночная грыжа, нарушение функций аортального и митрального клапанов, частичная атрофия зрительных нервов. Пациент 2 впервые был осмотрен генетиком в возрасте 9 месяцев в связи с задержкой роста и психомоторного развития. Диагноз МЛ II был установлен спустя год при повторной консультации. В 1 год и 10 месяцев у мальчика отмечены отставание в физическом и психо-моторном развитии, грубые черты лица, короткая шея, короткая грудная клетка, тораколюмбальный кифоз, ограничение подвижности в крупных суставах, широкие кисти и стопы, брахидактилия и камптодактилия, расширение устья аорты, нарушение функции клапанов аорты, недостаточность митрального клапана с признаками объемной перегрузки левого предсердия; дисплазия полости левого желудочка, снижение сократительной способности миокарда. Ребенок часто болел респираторными инфекциями, которые дважды сопровождались легочно-сердечной декомпенсацией и отеком легких. Продолжительность жизни пациента составила 3 года и 2 месяца. Молекулярно-генетические исследования для поиска мутаций в гене GNPTAB были выполнены пациенту 1 и его родителям, а также родителям и здоровым сибсам пациента 2. Анализ нуклеотидной последовательности гена GNPTAB проведен методом прямого секвенирования на автоматическом анализаторе ABI 3500. Результаты и обсуждение. Пациент 1 оказался гомозиготным носителем мутации p.Arg375Х в десятом экзоне гена GNPTAB, у его родителей этот аллель выявлен в гетерозиготном состоянии. Родители пациента 2 оказались гетерозиготными носителями мутации p.Arg375Х. Таким образом, мальчик, очевидно, был гомозиготным носителем этой мутации. Родной брат пробанда 2 не унаследовал мутацию p.Arg375Х, у сестры эта мутация была обнаружена в гетерозиготном состоянии. Несмотря на одинаковый генотип очевидны существенные различия в течении заболевания у описываемых пациентов: у пробанда 1 заболевание манифестировало с рождения выраженными дизморфиями и скелетными деформациями, однако первые признаки поражения клапанов сердца были выявлены только в возрасте трех лет четырех месяцев. Тяжесть состояния пациента 2, напротив, была обусловлена нарастающей сердечной недостаточностью вследствие раннего поражения клапанного аппарата сердца, которая и привела к смерти ребенка. Заключение. МЛ IIА/В - тяжелое прогрессирующее заболевание, для которого характерна вариабельность клинических проявлений и течения патологического процесса даже у пациентов с одинаковым генотипом. Продолжительность жизни при МЛ IIА/В определяется степенью поражения сердечно сосудистой системы. Ни возраст появления первых признаков заболевания, ни тяжесть костной патологии не являются предикторами скорости прогрессирования заболевания и продолжительности жизни у пациентов с МЛ IIА/В.
44-50 243
Аннотация
Введение. Синдром Барайтсера-Винтера (BWCFF) - очень редкое аутосомно-доминантное наследственное заболевание, обусловленное мутациями в генах ACTB и ACTG1. Практически все известные случаи этого заболевания обусловлены миссенс-мутациями в генах ACTB и ACTG1, возникшими de novo. В этой работе представлен новый случай синдрома BWCFF, обусловленный мутацией p.Ile136Val в гене ACTB. Пациенты и методы. Пробанд - мальчик 6 лет 8 месяцев, из двойни. Фенотип пациента анализировали с использованием приложения Face2Gene. Пробанду и всем членам его семьи проведено секвенирование 1-4 экзонов и прилежащих интронных последовательностей гена ACTB. Результаты. У пробанда отмечены характерные симптомы BWCFF: постнатальная пограничная микроцефалия, специфические дизморфии, колобомы радужной оболочки обоих глаз, короткая шея с крыловидными складками, эпилепсия, врожденный порок сердца. В отличие от большинства случаев синдрома у пациента отсутствовали задержка интеллектуального развития, а также грубые изменения коры или других структур головного мозга. В результате секвенирования экзонов гена АСТВ у пациента была выявлена замена с.406A>G (p.Ile136Val, rs1554329352) в гетерозиготном состоянии. У родителей пробанда и здоровых сибсов мутация не была обнаружена. Заключение. Использование современных технологий фенотипирования позволило предположить клинический диагноз, провести эффективный целенаправленный поиск мутаций в гене ACTB и диагностировать новый случай синдрома BWCFF.


ISSN 2073-7998 (Print)