Preview

Медицинская генетика

Расширенный поиск

Генетические маркеры фиброгенеза при хроническом вирусном гепатите С

Полный текст:

Аннотация

В исследование включены больные хроническим вирусным гепатитом С (ХВГС) (n = 184) и популяционная выборка жителей г.Томска (n = 285). Генотипирование 58 полиморфных вариантов выполнено методом масс-спектрометрии на приборе Sequenom MassARRAY® (США). Статистическая обработка данных проводилась в программной среде R с помощью стандартного пакета «stats» (версия 3.0.3) [http://www.R-project.org/]. Больные ХВГС характеризуются более высокой частотой аллелей «А» rs679620 гена MMP3 (OR = 1,74, 95%CI: 1,25-2,42; p = 0,0001) и «С» rs3739998 гена KIAA1462 (OR = 1,33, 95%CI: 1,01-1,75; р = 0,044) и более низкой частотой аллелей «Т» rs20579 гена LIG1 (OR = 0,55, 95%CI: 0,36-0,84; р = 0,004), «G» rs3765124 гена ADAMDEC1 (OR = 0,68, 95%CI: 0,51-0,84; р = 0,006) и «С» rs1007856 гена ITGB5 (OR = 0,75, 95%CI: 0,57-0,99; p = 0,045), по сравнению с контрольной группой. Предрасполагающими к развитию ХВГС являются генотипы «СС» rs10087305 (OR = 5,83, 95%CI: 1,74-19,02; р = 0,002) и «АА» rs3765124 (OR = 1,78, 95%CI: 1,16-8,46; р = 0,008) гена ADAMDEC1 ; «АА» rs679620 гена MMP3 (OR = 2,40, 95%CI: 1,40-4,12; р = 0,001); «TT» rs1007856 гена ITGB5 (OR = 1,74, 95%CI: 1,10-2,73; р = 0,015); «СС» rs20579 гена LIG1 (OR = 1,92, 95%CI: 1,18-3,12; р = 0,007); «СС» rs3739998 гена KIAA1462 (OR = 1,89, 95%CI: 1,16-3,10; р = 0,009). Таким образом, в предрасположенность ХВГС вносят вклад гены регуляции метаболизма экстрацеллюлярного матрикса ( ADAMDEC1 ; MMP3; ITGB5 ), непосредственно влияющие на процессы фиброгенеза, а также гены, ответственные за функционирование эндотелия ( KIAA1462 ) и репарацию ДНК ( LIG1 ).

Об авторах

И. А. Гончарова
Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия


М. С. Назаренко
Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук; Сибирский государственный медицинский университет
Россия


Н. В. Тарасенко
Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук; Сибирский государственный медицинский университет
Россия


А. В. Марков
Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия


Е. В. Белобородова
Сибирский государственный медицинский университет
Россия


В. П. Пузырев
Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук; Сибирский государственный медицинский университет
Россия


Список литературы

1. Гончарова И.А., Кучер А.Н., Тарасенко Н.В., и др. Разработка панели генетических маркеров фиброгенеза и оценка ее информативности для русского населения г.Томска // Медицинская генетика. - 2015. - №8. - С.7-12.

2. Гончарова И.А., Макеева О.А., Голубенко М.В., и др. Гены фиброгенеза в детерминации предрасположенности к инфаркту миокарда // Молекулярная биология. - 2016. - Т. 50, № 1. - С. 94-105.

3. Гончарова И.А., Тарасенко Н.В., Макеева О.А., и др. Полиморфизм гена ADAMDEC1 и его вклад в развитие заболеваний, характеризующихся процессами фиброгенеза // Медицинская генетика.- 2015. - №9. - С.24-30.

4. Емельянова А.Н., Витковский Ю.А. Полиморфизм генов цитокинов ИЛ2 (T330G), ИЛ10 (C819T) и ил10 (G1082A) при хроническом вирусном гепатите C // Молекулярная медицина. - 2013. - №3. - С. 41-44.

5. Лукманова Л.И., Давлетшин Р.А., Юлдашев В.Л. и др. Поиск ассоциаций полиморфных вариантов генов XRCC1, XPD и XRCC3 с повышенным риском развития алкогольного гепатита // Медицинская генетика. - 2011. - № 9. - С. 31-35.

6. Щёкотова А.П., Котельникова Л.П., Мугатаров И.Н., Федачук Н.Н. Эндотелиальная дисфункция, воспаление и фиброз при гепатобилиарной патологии // Фундаментальные исследования. - 2013. - № 5. - С. 451-455.

7. Azizian-Farsani F., Rafiei G., Saadat M. Impact of Sodium Arsenite on Chromosomal Aberrations With Respect to Polymorphisms of Detoxification and DNA Repair Genes // International Journal of Toxicology. - 2014. - Vol. 33, №6. - P. 518-522.

8. Boyd J., Luo B., Peri S.,et al. Whole exome sequence analysis of serous borderline tumors of the ovary // Gynecol Oncol. - 2013. - Vol. 130, №3. - P. 560-564.

9. Buch S.C., Diergaarde B., Nukui T., Day R.S., et al. Genetic variability in DNA repair and cell cycle control pathway genes and risk of smoking-related lung cancer // Mol. Carcinog. - 2012. - Vol. 51. - P. 11-20.

10. Chen Y., Nixon N. B., Dawes P. T., Mattey D. L. Influence of variations across the MMP-1 and -3 genes on the serum levels of MMP-1 and -3 and disease activity in rheumatoid arthritis // Genes and Immunity. - 2012. - V.13. - P. 29-37.

11. Claerhout S., Lim J.Y., Choi W., et al. Gene Expression Signature Analysis Identifies Vorinostat as a Candidate Therapy for Gastric Cancer // PLoS ONE. - 2011. - Vol. 6, №9. e24662.

12. de Bruyn M., Machiels K., Vandooren J. et al. Infliximab restores the dysfunctional matrix remodeling protein and growth factor gene expression in patients with inflammatory bowel disease // Inflamm. Bowel Dis. - 2014. - Vol. 20, №2. - P. 339-352.

13. de Chassey B., Navratil V., Tafforeau L., et al. Hepatitis C virus infection protein network // Molecular Systems Biology. - 2008. Vol. 4, №230. Р. 1-12.

14. Erdmann J., Willenborg C., Nahrstaedt J., Preuss M., et al. Genome-wide association study identifies a new locus for coronary artery disease on chromosome 10p11.23 // Eur. Heart J. - 2011. - Vol. 32. - P. 158-168.

15. Gaymes T.J., Mohamedali A.M., Patterson M., et al. Microsatellite instability induced mutations in DNA repair genes CtIP and MRE11 confer hypersensitivity to poly (ADP-ribose) polymerase inhibitors in myeloid malignancies // Haematologica. - 2013. - Vol. 98, №9. - P. 1397-1406.

16. Jung S.W., Park N.H., Shin J.W., et al. Polymorphisms of DNA repair genes in Korean hepatocellular carcinoma patients with chronic hepatitis B: Possible implications on survival // Journal of Hepatology. - 2012. - Vol. 57. - P. 621-627.

17. Kim H.S., Kim S.C., Kim S.J., et al. Identification of a radiosensitivity signature using integrative metaanalysis of published microarray data for NCI-60 cancer cells // BMC Genomics. - 2012. - V.13. - P. 348.

18. Kim S.K , Kang S.W., Kim D.H., et al. Matrix Metalloproteinase-3 Gene Polymorphisms Are Associated with Ischemic Stroke // Journal of Interferon & Cytokine Research. - 2012. - Vol. 32, №2. - P. 81-86.

19. Letra A., Silva R.M., Rylands R.J., Silveira E.M., et al. MMP3 and TIMP1 variants contribute to chronic periodontitis and may be implicated in disease progression // J Clin Periodontol. - 2012. - Vol. 39. - P. 707-716.

20. Li Y., Zhang Q., Liu Y. et al. Hepatitis C virus activates Bcl-2 and MMP-2 expression through multiple cellular signaling pathways // Journal of Virology. - 2012 - Vol. 86, №23. - P. 12531-12543.

21. Machida K., McNamara G., Cheng K., et al. Hepatitis C Virus Inhibits DNA Damage Repair through Reactive Oxygen and Nitrogen Species and by Interfering with the ATM-NBS1/Mre11/Rad50 DNA Repair Pathway in Monocytes and Hepatocytes // J Immunol. -2010. - Vol. 185. - P. 6985-6998.

22. Mangia A., Santoro R., Piattelli M., et al. IL-10 haplotypes as possible predictors of spontaneous clearance of HCV infection // Cytokine. - 2004. - Vol. 25, № 3. - P. 103-109.

23. Nunez O., Fernandez-Martэnez A., Majano P. L. et al. Increased intrahepatic cyclooxygenase 2, matrix metalloproteinase 2, and matrix metalloproteinase 9 expression is associated with progressive liver disease in chronic hepatitis C virus infection: role of viral core and NS5A proteins // Gut. - 2004. - Vol. 53, №11. - P. 1665-1672.

24. Okamoto K., Ishida C., Ikebuchi Y., et al. The genotypes of IL-1 beta and MMP-3 are associated with the prognosis of HCV-related hepatocellular carcinoma // Intern Med. - 2010. - Vol. 49, №10. - P. 887-895.

25. Pal S., Polyak S.J., Bano N., et al. Hepatitis C virus induces oxidative stress, DNA damage and modulates the DNA repair enzyme NEIL1 // Journal of Gastroenterology and Hepatology. - 2010. - Vol. 25. - P. 627-634.

26. Pasini F.S., Zilberstein B., Snitcovsky I. et al. A gene expression profile related to immune dampening in the tumor microenvironment is associated with poor prognosis in gastric adenocarcinoma // J. Gastroenterol. - 2014. -Vol. 49, №11. - P. 1453-1466.

27. Sanchez-Parada M.G., Alvarez-Rodriguez B.A., Gomez-Meda B.C., et al. Association of genetic polymorphisms with histological grading of necroinflammation, staging of fibrosis, and liver function in Mexicans with chronic hepatitis C virus infection // J Investig Med. - 2015. - Vol. 61, №7. -. P.1088-1096.

28. Sobczuk A., Poplawski T., Blasiak J. Polymorphisms of DNA repair genes in endometrial cancer // Pathol Oncol Res. - 2012. - Vol. 18, №4. - P. 1015-20.

29. Song X., Zhong H., Zhou J., et al. Association between polymorphisms of microRNA-binding sites in integrin genes and gastric cancer in Chinese Han population // Tumor Biology. - 2015. - Vol. 36, №4. - P. 2785-2792.

30. Vidigal P.G., Germer J.J., Zein N.N. Polymorphisms in the interleukin-10, tumor necrosis factor-alpha, and transforming growth factor-beta1 genes in chronic hepatitis C patients treated with interferon and ribavirin // J Hepatol. - 2002. - Vol. 36, №2. - P. 271-2777.

31. Zhao Y., Kang H., Ji Y., Chen X. Evaluate the relationship between polymorphisms of OAS1 gene and susceptibility to chronic hepatitis C with high resolution melting analysis // Clin Exp Med. - 2013. - Vol. 13. - P. 171-176.

32. Zheng S., Tansey W.P., Hiebert S.W., Zhao Z. Integrative network analysis identifies key genes and pathways in the progression of hepatitis C virus induced hepatocellular carcinoma // BMC Medical Genomics. - 2011. - Vol. 4, № 62. - P. 1-10.


Для цитирования:


Гончарова И.А., Назаренко М.С., Тарасенко Н.В., Марков А.В., Белобородова Е.В., Пузырев В.П. Генетические маркеры фиброгенеза при хроническом вирусном гепатите С. Медицинская генетика. 2016;15(12):29-36.

For citation:


Goncharova I.A., Nazarenko M.S., Tarasenko N.V., Markov A.V., Beloborodova E.V., Puzyrev V.P. Genetic markers of fibrogenesis in determining susceptibility to chronic hepatitis C virus infection. Medical Genetics. 2016;15(12):29-36. (In Russ.)

Просмотров: 133


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2073-7998 (Print)