Анализ аберраций числа копий ДНК генов BRCA1, NF-κB и PARP1 в опухоли молочной железы: связь с эффектом предоперационной химиотерапии и прогнозом заболевания

Известно, что дефицит гомологичной рекомбинации в опухолевых клетках, обусловленный, в основном, дефектом генов BRCA1/2, связан с высокой эффективностью лечения и благоприятным прогнозом заболевания. Однако наличие других альтернативных путей репарации ДНК, таких как активация генов NF-κB или PARP1, может оказывать дополнительный негативный эффект. Таким образом, целью работы явилась оценка связи аберраций числа копий ДНК генов BRCA1, NF-κB, PARP1 в опухолевой ткани молочной железы с эффектом химиотерапии и прогнозом заболевания. Материалы и методы. В исследование было включено 85 больных раком молочной железы IIA-IIIB стадии. ДНК выделяли из биопсийных образцов опухолевой ткани с использованием набора QIAamp DNA mini Kit (Qiagen, Germany). Было проведено микроматричное исследование всех образцов опухоли на ДНК-чипах высокой плотности фирмы Affymetrix CytoScanTM HD Array. Для оценки аберраций числа копий ДНК использовали программу «Chromosome Analysis Suite 3.3». Результаты. Было установлено, что наибольшая частота делеций наблюдается в гене BRCA1 (28%, 24 случая из 85), и это статистически значимо сопряжено с объективным ответом на неоадъювантную химиотерапии (p=0,02). Частота амплификации гена PARP1 в исследуемой группе больных составляет 62%, что также определяет хороший ответ на неоадъювантную химиотерапию вне зависимости от наличия аберраций других исследуемых генов. При анализе прогностической значимости аберраций генов было показано, что амплификация гена PARP1 является неблагоприятным маркером безметастатической выживаемости (log-rank test, p=0,02). Выводы. На основании полученных данных можно полагать, что аберрантное состояние генов BRCA1 и PARP1 в опухоли молочной железы, может также являться перспективным маркером эффективности химиотерапии и прогноза заболевания, что подтверждает актуальность исследования, но и требует дальнейшего детального изучения.

рак молочной железы, прогноз, breast cancer, microarray studies, BRCA1, PARP1, NF-κB, copy number aberrations, neoadjuvant chemotherapy, prognosis, микроматричные исследования, BRCA1, PARP1, NF-κB, аберрации числа копий, неоадъювантная химиотерапия