Preview

Медицинская генетика

Расширенный поиск

Медицинская технология комплексной ДНК-диагностики туберозного склероза

https://doi.org/10.25557/2073-7998.2018.08.32-37

Полный текст:

Аннотация

Проведено комплексное молекулярно-генетическое обследование 76 больных с туберозным склерозом. Для диагностики заболевания использовалась внедренная в практическую деятельность ФГБНУ «МГНЦ» новая медицинская технология, которая включает в себя методы таргетного высокопроизводительного параллельного секвенирования (ВПС), мультиплексной амплификации лигированных зондов (MLPA), а также секвенирование ДНК по Сенгеру. Поиск точковых мутаций, а также малых делеций/инсерций в генах TSC1 и TSC2 осуществляли методом ВПС на приборе Ion S5. Для исключения артефактов секвенирования, подтверждения патогенности обнаруженных однонуклеотидных замен и выявления семейных случаев проводили секвенирование по Сенгеру. Для выявления протяженных делеций в генах TSC1 и TSC2 использовали метод MLPA. Патогенные генетические варианты выявлены в 46% случаев, из них 70% - в гене TSC2 , и 30% - в гене TSC1 . Подавляющее большинство мутаций было выявлено методом ВПС - 91,9%; методом MLPA протяженные делеции выявлены в 8,1% информативных образцов.

Об авторах

К. И. Аношкин
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»; ФГБОУ ВО «Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Пирогова» Министерства здравоохранения Российской Федерации
Россия


К. О. Карандашева
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»
Россия


А. С. Танас
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»; ФГБОУ ВО «Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Пирогова» Министерства здравоохранения Российской Федерации
Россия


Л. А. Бессонова
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»
Россия


Н. А. Демина
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»
Россия


М. С. Петухова
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»
Россия


И. В. Анисимова
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»
Россия


Д. В. Залетаев
ФГБОУ ВО «Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Пирогова» Министерства здравоохранения Российской Федерации; ФГБОУ ВО «Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова» Министерства здравоохранения Российской Федерации
Россия


В. В. Стрельников
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»; ФГБОУ ВО «Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Пирогова» Министерства здравоохранения Российской Федерации
Россия


Список литературы

1. Islam, M.P. and E.S. Roach, Tuberous sclerosis complex. Handb Clin Neurol, 2015. 132: 97-109.

2. Populo, H., J.M. Lopes, and P. Soares, The mTOR signalling pathway in human cancer. Int J Mol Sci, 2012. 13(2):1886-918.

3. Huang, J. and B.D. Manning, The TSC1-TSC2 complex: a molecular switchboard controlling cell growth. Biochem J, 2008. 412(2):179-90.

4. Fokkema, I.F., et al., LOVD v.2.0: the next generation in gene variant databases. Hum Mutat, 2011. 32(5):557-63.

5. Stenson, P.D., et al., Human Gene Mutation Database (HGMD): 2003 update. Hum Mutat, 2003. 21(6):577-81.

6. Landrum, M.J., et al., ClinVar: improving access to variant interpretations and supporting evidence. Nucleic Acids Res, 2018. 46(D1):D1062-D1067.

7. Lek, M., et al., Analysis of protein-coding genetic variation in 60,706 humans. Nature, 2016. 536(7616):285-91.

8. Wang, K., M. Li, and H. Hakonarson, ANNOVAR: functional annotation of genetic variants from high-throughput sequencing data. Nucleic Acids Res, 2010. 38(16):e164.

9. Robinson, J.T., et al., Integrative genomics viewer. Nat Biotechnol, 2011. 29(1):24-6.

10. Northrup H, K.M., Pearson DA, et al., Tuberous Sclerosis Complex. 2015.

11. Curatolo, P., et al., Genotype/Phenotype Correlations in Tuberous Sclerosis Complex. Semin Pediatr Neurol, 2015. 22(4):259-73.

12. Sancak, O., et al., Mutational analysis of the TSC1 and TSC2 genes in a diagnostic setting: genotype-phenotype correlations and comparison of diagnostic DNA techniques in Tuberous Sclerosis Complex. Eur J Hum Genet, 2005. 13(6):731-41.

13. Tyburczy, M.E., et al., Mosaic and Intronic Mutations in TSC1/TSC2 Explain the Majority of TSC Patients with No Mutation Identified by Conventional Testing. PLoS Genet, 2015. 11(11):e1005637.

14. Rosset, C., C.B.O. Netto, and P. Ashton-Prolla, TSC1 and TSC2 gene mutations and their implications for treatment in Tuberous Sclerosis Complex: a review. Genet Mol Biol, 2017. 40(1):69-79.


Для цитирования:


Аношкин К.И., Карандашева К.О., Танас А.С., Бессонова Л.А., Демина Н.А., Петухова М.С., Анисимова И.В., Залетаев Д.В., Стрельников В.В. Медицинская технология комплексной ДНК-диагностики туберозного склероза. Медицинская генетика. 2018;17(8):32-37. https://doi.org/10.25557/2073-7998.2018.08.32-37

For citation:


Anoshkin K.I., Karandasheva K.O., Tanas A.S., Bessonova L.A., Demina N.A., Petukhova M.S., Anisimova I.V., Zaletaev D.V., Strelnikov V.V. Medical technology for comprehensive DNA analysis in tuberous sclerosis. Medical Genetics. 2018;17(8):32-37. (In Russ.) https://doi.org/10.25557/2073-7998.2018.08.32-37

Просмотров: 144


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2073-7998 (Print)