Анализ CNVs при анэмбрионии и неразвивающейся беременности

Несмотря на высокую частоту репродуктивных потерь, характерную для человека, вариации числа копий участков ДНК (CNVs) как одна из возможных причин невынашивания беременности остаются малоизученными. В связи с этим целью настоящего исследования являлся анализ CNVs при анэмбрионии и неразвивающейся беременности. Исследовано 29 образцов внезародышевых тканей спонтанных абортусов первого триместра беременности, полученных от женщин с диагнозом анэмбриония , и 18 образцов тканей, полученных от женщин с диагнозом неразвивающаяся беременность . Идентификация CNVs проведена методом матричной сравнительной геномной гибридизации (aCGH) на ДНК-микрочипах высокого разрешения. Выявлено 299 CNVs при анэмбрионии и 132 CNVs при неразвивающейся беременности. Некоторые потенциально патогенетически значимые CNVs были верифицированы методом ПЦР в реальном времени. При анэмбрионии выявлено 19 (54,3%) потенциально патогенетически значимых микроделеций и 16 (45,7%), микродупликаций, в то время как при неразвивающейся беременности в обследованной нами выборке обнаружены исключительно микродупликации хромосомных участков.

анэмбриония, неразвивающаяся беременность, вариации числа копий участков ДНК (CNV), матричная сравнительная геномная гибридизация (aCGH), anembryonic pregnancy, missed abortion, copy number variation (CNV), array comparative genomic hybridization (aCGH)

1. Macklon NS, Geraedts JP, Fauser BC. Conception to ongoing pregnancy: the «black box» of early pregnancy loss. Hum. Reprod. Update. 2002;8(4):333-343.

2. Неразвивающаяся беременность. Методические рекомендации МАРС / В.Е. Радзинский. - М.: Редакция журнала StatusPraesens, 2015. - 48 c.

3. Лебедев ИН, Кашеварова АА, Скрябин НА и др. Матричная сравнительная геномная гибридизация (array-CGH) в диагностике хромомсомного дисбаланса и CNV-полиморфизма при анэмбрионии. Материалы II национального конгресса «Дискуссионные вопросы современного акушерства». 2013;LXII (2):117-125.

4. Griffin DK. The incidence, origin and etiology of aneuploidy. Int. Rev. Cytol. 1996;167:263-295.

5. Bassett AS, Chow EW, Husted J et al. Clinical features of 78 adults with 22q11 Deletion Syndrome. Am J Med Genet A. 2005;138(4):307-313.

6. Blackwood DH, Fordyce A, Walker MT. Schizophrenia and affective disorders-cosegregation with a translocation at chromosome 1q42 that directly disrupts brain-expressed genes: clinical and P300 findings in a family. Am J Med Genet A. 2001;69(2):428-433.

7. Glessner JT, Wang K, Cai J et al. Autism genome-wide copy number variation reveals ubiquitin and neuronal genes. Nature. 2009;459(7246):569-573.

8. Aitman TJ, Dong R, Vyse TJ et al. Copy number polymorphism in Fcgr3 predisposes to glomerulonephritis in rats and humans. Nature. 2006;439(7078):851-855.

9. Schaeffer AJ, Chung J, Heretis K et al. Comparative genomic hybridization-array analysis enhances the detection of aneuploidies and submicroscopic imbalances in spontaneous miscarriages. Am. J. Hum. Genet. 2004;74:1168-1174.

10. Benkhalifa M, Kasakyan S, Clement P et al. Array comparative genomic hybridization profiling of first-trimester spontaneous abortions that fail to grow in vitro. Prenat. Diagn. 2005;25:94-900.

11. Shimokawa O, Harada N, Miyake N et al. Array comparative genomic hybridization analysis in first-trimester spontaneous abortions with «normal» karyotypes. Am. J. Hum. Genet. 2006;140:1931-1935.

12. Conrad DF, Andrews TD, Carter NP et al. A high-resolution survey of deletion polymorphism in the human genome. Nat. Genet. 2006;38(1):75-81.

13. Menten B, Swerts K, Delle Chiaie B. Array comparative genomic hybridization and flow cytometry analysis of spontaneous abortions and mors in utero samples. BMC Medical Genetics. 2009;10:89-94.

14. Rajcan-Separovic E, Diego-Alvarez D, Robinson WP et al. Identification of copy number variants in miscarriage from couples with idiopathic recurrent pregnancy loss. Hum. Reprod. 2010;25:2913-2922.

15. Rajcan-Separovic E, Qiao Y, Tyson C et al. Genomic changes detected by array CGH in human embryos with developmental defects. Hum. Reprod. 2010;16:125-134.

16. Robberecht С, Pexsters A, Deprest J et al. Cytogenetic and morphological analysis of early products of conception following hysteroembryoscopy from couples with recurrent pregnancy loss. Prenat. Diagn. 2012;4:1-10.

17. Database of genomic variants. URL: http://dgv.tcag.ca/dgv/app/home (дата обращения 15.01.2016)

18. Database of genomic variation and phenotype in humans using Ensembl Resources URL: https://decipher.sanger.ac.uk/ (дата обращения: 20.01.2016).

19. NCBI Gene. URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/ (дата обращения: 1.03.2016).

20. NCBI PubMed. URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ (дата обращения: 1.03.2016).

21. Genome Browser University of California Santa Cruz. URL: https://genome.ucsc.edu/ (дата обращения 20.03.2016).

22. Genome browser Ensembl. URL: http://www.ensembl.org/index.html/ (дата обращения: 20.03.2016).

23. NCBI BLAST. URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/ (дата обращения: 20.03.2016).

24. Viaggi CD, Cavani S, Malacarne M et al. First-trimester euploid miscarriages analysed by array-CGH. J Appl Genetics. 2013;54(3):353-359.