Интерпретация фенотипа пациента c учетом результатов комплексных молекулярно-цитогенетических исследований
Аннотация
Актуальность: Врожденные и наследственные болезни в значительной мере представлены хромосомной патологией. В связи с этим ранняя диагностика, своевременно начатые лечение и реабилитация, профилактика возникновения и распространения этих заболеваний имеют особое значение. Цель: Используя комбинацию молекулярно-цитогенетических методов, литературные данные и исследуя несколько типов клеток, выяснить генетические причины заболевания у пациента. Материалы и методы: У пробанда взяты лимфоциты периферической крови и фибробласты кожи. Исследование проведено путем метафазного анализа, матричной сравнительной геномной гибридизации (aCGH) на микрочипах 8х 60K (Agilent Technologies), ПЦР в реальном времени и флюоресцентной in situ гибридизации (FISH). Результаты: У пациента с цитогенетически визуализируемой кольцевой хромосомой 13 - r(13) - выявлены симптомы, не ассоциированные с данной хромосомной аномалией. Кроме терминальной делеции 13q34, обусловившей r(13), идентифицирована трипликация 3q12. В фибробластах в ходе микрочипового исследования дополнительно обнаружена моносомия 13. Методом FISH-анализа установлено, что доля лимфоцитов и фибробластов с моносомией по хромосоме 13 составила 47% и 50% соответственно. Выводы: В случае хромосомной патологии объяснить все симптомы пациента, дать объективный прогноз заболевания и предложить лечение позволяет комплексный подход, включающий в себя применение адекватных методов исследования, анализ нескольких тканей в сложных случаях, работу с литературными данными и базами и взаимодействие врачей и специалистов разного профиля.
Ключевые слова
метафазный анализ,
флюресцентная in situ гибридизация (FISH),
матричная сравнительная геномная гибридизация (aCGH),
кольцевая хромосома,
моносомия,
делеция,
трипликация,
metaphase analysis,
fluorescent in situ hybridization (FISH),
array comparative genomic hybridization (aCGH),
ring chromosome,
monosomy,
deletion,
triplication
Об авторах
А. А. Кашеварова
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр РАН
Россия
Россия
Е. О. Беляева
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр РАН
Россия
Россия
А. М. Никонов
Краевое государственное бюджетное учреждение здравоохранения «Диагностический центр Алтайского края»
Россия
Россия
О. В. Плотникова
Краевое государственное бюджетное учреждение здравоохранения «Диагностический центр Алтайского края»
Россия
Россия
И. Г. Гергерт
Алтайский Краевой Клинический Перинатальный центр «Дар»
Россия
Россия
Т. В. Никитина
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр РАН
Россия
Россия
Н. А. Скрябин
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр РАН
Россия
Россия
С. А. Васильев
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр РАН
Россия
Россия
М. Е. Лопаткина
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр РАН
Россия
Россия
А. В. Чурилова
Национальный исследовательский Томский государственный университет
Россия
Россия
Е. Н. Толмачева
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр РАН
Россия
Россия
Л. П. Назаренко
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр РАН
Россия
Россия
И. Н. Лебедев
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр РАН
Россия
Россия
Список литературы
1. Протокол aCGH для микрочипов Agilent Technologies - http://www.chem-agilent.com/pdf/G4410-90020v3_1_CGH_ULS_Protocol.pdf
2. База данных геномных вариантов - http://projects.tcag.ca/variation/?source=hg18
3. База о генах - https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene
4. Xu F, DiAdamo AJ, Grommisch B, Li P. Interstitial duplication and distal deletion in a ring chromosome 13 with pulmonary atresia and ventricular septal defect: a case report and review of literature. N A J Med Sci. 2013; 6(4):208-212.
5. Brandt CA, Hertz JM, Petersen MB et al. Ring chromosome 13: lack of distinct syndromes based on different breakpoints on 13q. J Med Genet. 1992; 29:704-708.
6. Izykowska K, Przybylski GK, Gand C et al. Genetic rearrangements result in altered gene expression and novel fusion transcripts in Sezary syndrome. Oncotarget. 2017; 8(24):39627-39639.
Рецензия
Для цитирования:
Кашеварова А.А., Беляева Е.О., Никонов А.М., Плотникова О.В., Гергерт И.Г., Никитина Т.В., Скрябин Н.А., Васильев С.А., Лопаткина М.Е., Чурилова А.В., Толмачева Е.Н., Назаренко Л.П., Лебедев И.Н. Интерпретация фенотипа пациента c учетом результатов комплексных молекулярно-цитогенетических исследований. Медицинская генетика. 2017;16(11):46-50.
For citation:
Kashevarova A.A., Belyaeva E.O., Nikonov A.M., Plotnikova O.V., Gergert I.G., Nikitina T.V., Skryabin N.A., Vasilyev S.A., Lopatkina M.E., Churilova A.V., Tolmacheva E.N., Nazarenko L.P., Lebedev I.N. Interpretation of a patient`s phenotype using a complex of molecular cytogenetic methods. Medical Genetics. 2017;16(11):46-50. (In Russ.)
Просмотров: 405
Послать статью по эл. почте 