Редкие вариации числа копий ДНК: микродупликация 20p13 материнского происхождения у пациента с комплексным пороком сердца и аномалией бронхов

В работе представлены клинические данные и молекулярно-цитогенетическое описание редкой микродупликации в регионе 20p13 у пациентки с комплексным пороком сердца, аномалией бронхов, дисморфичными фенотипическими чертами, гидроцефалией. Материалы и методы. Пациентке в возрасте 4 месяцев, был проведен полногеномный анализ с использованием ДНК-микрочипов высокого разрешения SurePrint G3 Human Genome CGH+SNP Microarray Kit, 8 х 60K. Результаты. Унаследованная от матери микродупликация включает 46 генов. Фенотип пациентки и данные анамнеза могут быть частично объяснены входящими в перестройку генами. Дупликация генов GnRH-II, OXT у матери могла повлиять на преждевременное рождение ребенка. Гены EBF4 , CENPB , участвуют в процессах клеточного деления и миграции клеток, активации MAP-киназного пути, и таким образом могут быть вовлечены в эмбриогенез. Ген ADAM33 влияет на межклеточные взаимодействия в легких и возможно, связан с развитием брониальных аномалий у ребенка. Дальнейшее наблюдение за ребенком и обследование матери позволят уточнить влияние микродупликации 20p13 на фенотип.

вариации числа копий повторов, врожденные пороки сердца, микродупликация, 20p13, GnRH-II, гонадотропин-рилизинг гормон, Copy number variations, congenital heart defects, microduplication, 20p13, GnRH-II, gonadotropin-releasing hormone

1. Kearney HM, Thorland EC, Brown KK, Quintero-Rivera F, South ST. American College of Medical Genetics standards and guidelines for interpretation and reporting of postnatal constitutional copy number variants. Genet Med. 2011;13(7):680-5. doi:10.1097/GIM.0b013e3182217a3a.

2. Fahed AC, Gelb BD, Seidman JG, Seidman CE. Genetics of congenital heart disease: the glass half empty. Circ Res. 2013;112(4):707-20. doi:10.1161/CIRCRESAHA.112.300853.

3. Lang RM, Bierig M, Devereux RB, и др. Рекомендации по количественной оценке структуры и функции камер сердца. Российский кардиологический журнал. 2012;3(95):3-28.

4. Слепухина АA, Кашеварова АА, Скрябин НА, Новикова МА, Лифшиц ГИ, Лебедев ИН. Алгоритм молекулярно-цитогенетической диагностики микроделеционных синдромов врожденных пороков развития. В: Методические рекомендации по медицинским технологиям диагностики и лечения хромосомных, орфанных и многофакторных заболеваний человека/ под редакцией проф. В.А. Степанова. Академизда. Новосибирск; 2016:175-194.

5. Wang X, Li W, Huang K, и др. Genetic variants in ADAM33 are associated with airway inflammation and lung function in COPD. BMC Pulm Med. 2014;14:173. doi:10.1186/1471-2466-14-173.

6. Robitaille G, Christin M-S, Clеment I, Senеcal J-L, Raymond Y. Nuclear autoantigen CENP-B transactivation of the epidermal growth factor receptor via chemokine receptor 3 in vascular smooth muscle cells. Arthritis Rheum. 2009;60(9):2805-16. doi:10.1002/art.24765.

7. Martin MM, Vanzo RJ, Sdano MR, Baxter AL, South ST. Mosaic deletion of 20pter due to rescue by somatic recombination. Am J Med Genet Part A. 2016;170(1):243-248. doi:10.1002/ajmg.a.37407.

8. Ohlsson B. Gonadotropin-Releasing Hormone and Its Role in the Enteric Nervous System. Front Endocrinol (Lausanne). 2017;8:110. doi:10.3389/fendo.2017.00110.

9. Mafra F, Mazzotti D, Pellegrino R, и др. Copy number variation analysis reveals additional variants contributing to endometriosis development. J Assist Reprod Genet. 2017;34(1):117-124. doi:10.1007/s10815-016-0822-1.

10. DiVasta AD, Laufer MR. The use of gonadotropin releasing hormone analogues in adolescent and young patients with endometriosis. Curr Opin Obstet Gynecol. 2013;25(4):287-292. doi:10.1097/GCO.0b013e32836343eb.

11. Firth HV. DECIPHER: Database of Chromosomal Imbalance and Phenotype in Humans using Ensembl Resources. Am J Hum Genet. 2009;84:524-533.

12. Гринберг КН, Кухаренко ВИ. Реализация фенотипического эффекта хромосомных аномалий у человека. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2013;17(1):32-39.

13. Fakhro KA, Choi M, Ware SM, и др. Rare copy number variations in congenital heart disease patients identify unique genes in left-right patterning. Proc Natl Acad Sci. 2011;108(7):2915-2920. doi:10.1073/pnas.1019645108.

14. Hitz M-P, Lemieux-Perreault L-P, Marshall C, и др. Rare Copy Number Variants Contribute to Congenital Left-Sided Heart Disease. Spinner NB, ред. PLoS Genet. 2012;8(9):e1002903. doi:10.1371/journal.pgen.1002903.

15. Priest JR, Girirajan S, Vu TH, Olson A, Eichler EE, Portman MA. Rare copy number variants in isolated sporadic and syndromic atrioventricular septal defects. Am J Med Genet Part A. 2012;158A(6):1279-1284. doi:10.1002/ajmg.a.35315.

16. Lalani SR, Shaw C, Wang X, и др. Rare DNA copy number variants in cardiovascular malformations with extracardiac abnormalities. Eur J Hum Genet. 2013;21(2):173-81. doi:10.1038/ejhg.2012.155.

17. Xie L, Chen J-L, Zhang W-Z, и др. Rare De Novo Copy Number Variants in Patients with Congenital Pulmonary Atresia. Zwick ME, ред. PLoS One. 2014;9(5):e96471. doi:10.1371/journal.pone.0096471.

18. Weiss LA, Arking DE, Gene Discovery Project of Johns Hopkins & the Autism Consortium TGDP of JH the A, Daly MJ, Chakravarti A. A genome-wide linkage and association scan reveals novel loci for autism. Nature. 2009;461(7265):802-8. doi:10.1038/nature08490.