Полиморфизм генов саркомерных белков при гипертрофической кардиомиопатии: ассоциация генетических вариантов в TPM1 с эхокардиографическими параметрами.

Гипертрофическая кардиомиопатия (ГКМП) является частым наследственным заболеванием. Клинический полиморфизм возраста начала и характера течения заболевания даже у носителей одного и того же патогенного варианта предполагает влияние дополнительных факторов, в том числе генетических, на фенотип ГКМП. В данной работе проведен поиск связи полиморфизма генов TPM1 и TNNT2 с изменчивостью эхокардиографических параметров у пациентов с ГКМП. Выявлена ассоциация величины фракции выброса левого желудочка с генотипами по двум вариантам (rs1071646 и rs111470259), находящимся в некодирующих регионах гена TPM1, которые могут иметь значение для регуляции экспрессии гена. Также выявлена ассоциация rs1071646 с толщиной межжелудочковой перегородки, массой миокарда и индексом массы миокарда. Полученные результаты позволяют предположить, что кроме патогенных вариантов в генах саркомерных белков, которые необходимы для развития заболевания, отдельные полиморфизмы могут оказывать модифицирующий эффект на формирование фенотипа ГКМП.

1. Maron B.J., Desai M.Y., Nishimura R.A., et al. Diagnosis and Evaluation of Hypertrophic Cardiomyopathy: JACC State-of-the Art Review. J Am Coll Cardiol. 2022;79(4):372-389.

2. Massera D., Sherrid M.V., Maron M.S., et al. How common is hypertrophic cardiomyopathy… really?: Disease prevalence revisited 27 years after CARDIA. Int J Cardiol. 2023;382:64-67.

3. Arbelo E., Protonotarios A., Gimeno J.R., et al. 2023 ESC Guidelines for the management of cardiomyopathies. Eur Heart J. 2023;44(37):3503-3626.

4. van der Harst P., van Setten J., Verweij N., et al. 52 Genetic Loci Influencing Myocardial Mass. J Am Coll Cardiol. 2016;68(13):1435 1448.

5. Harper A.R., Goel A., Grace C., et al. Common genetic variants and modifiable risk factors underpin hypertrophic cardiomyopathy susceptibility and expressivity. Nat Genet. 2021;53(2):135-142. doi: 10.1038/s41588-020-00764-0. Epub 2021 Jan 25.

6. Walsh R., Offerhaus J.A., Tadros R., Bezzina C.R. Minor hypertrophic cardiomyopathy genes, major insights into the genetics of cardiomyopathies. Nat Rev Cardiol. 2022;19(3):151-167.

7. Salakhov R.R., Golubenko M.V., Valiakhmetov N.R., et al. Application of Long-Read Nanopore Sequencing to the Search for Mutations in Hypertrophic Cardiomyopathy. Int J Mol Sci. 2022;23(24):15845.

8. Rentzsch P., Schubach M., Shendure J., Kircher M. CADD-Splice improving genome-wide variant effect prediction using deep learning derived splice scores. Genome Med. 2021;13(1):31.

9. Barbitoff Y.A., Khmelkova D.N., Pomerantseva E.A., et al. Expanding the Russian allele frequency reference via cross-laboratory data integration: insights from 7452 exome samples. Natl Sci Rev. 2024;11(10):nwae326.

10. Chen S., Francioli L.C., Goodrich J.K., et al. A genomic mutational constraint map using variation in 76,156 human genomes. Nature. 2024;625(7993):92-100.

11. Chang H.C., Tseng C.H., Huang W.M., et al. Supranormal Left Ventricular Ejection Fraction, Concentric Remodeling, and Long Term Survival. JACC Asia. 2024;4(12):928-937.

12. Denz C.R., Narshi A., Zajdel R.W., Dube D.K. Expression of a novel cardiac-specific tropomyosin isoform in humans. Biochem Biophys Res Commun. 2004;320(4):1291-7.

13. Kopylova G.V., Kochurova A.M., Yampolskaya D.S, et al. Structural and Functional Properties of Kappa Tropomyosin. Int J Mol Sci. 2023;24(9):8340.

14. Rajan S., Jagatheesan G., Karam C.N., et al. Molecular and functional characterization of a novel cardiac-specific human tropomyosin isoform. Circulation. 2010;121(3):410-8.

15. Abramov S., Boytsov A., Bykova D., et al. Landscape of allele specific transcription factor binding in the human genome. Nat Commun. 2021;12(1):2751.