Preview

Медицинская генетика

Расширенный поиск

Сигналы направленного отбора в популяциях коренного населения Средней Азии

https://doi.org/10.25557/2073-7998.2023.02.52-54

Аннотация

   Популяции коренных этносов Средней Азии представляют значительный интерес для популяционной геномики по причине специфичности их генофондов, развивавшихся в различных генетико-демографических условиях. Данные о сигналах направленного отбора являются важным дополнением к существующим данным о эволюции генофондов и механизмах генетической адаптации населения Евразии. Мы использовали массив генотипов по 1779819 SNP в выборке из 128 человек, включающей 5 популяций населения Средней Азии, для поиска сигналов направленного отбора с помощью тестов на протяженную гомозиготность гаплотипов (nSL, iHS). Обнаружено, что все исследованные популяции сильно отличаются друг от друга по составу генов, которые демонстрируют влияние отбора. Наибольшее число значимых сигналов естественного отбора выявлено в популяциях киргизов и узбеков. Среди локусов генома, несущих наиболее выраженные сигналы направленного отбора, в популяциях выделяются гены CUEDC1, ERC1, FAM20C, MRC1.

Об авторах

Н. А. Колесников
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия

634050

ул. Набережная р. Ушайки, д. 10

Томск



В. Н. Харьков
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия

634050

ул. Набережная р. Ушайки, д. 10

Томск



А. А. Зарубин
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия

634050

ул. Набережная р. Ушайки, д. 10

Томск



В. А. Степанов
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия

634050

ул. Набережная р. Ушайки, д. 10

Томск



Список литературы

1. Henn B. M., Cavalli-Sforza L. L., Feldman M. W. The great human expansion. Proc Natl Acad Sci U S A. 2012; 109 (44): 17758.

2. Szpiech Z. A., Hernandez R. D. Selscan: An efficient multithreaded program to perform EHH-based scans for positive selection. Molecular Biology and Evolution. 2014; 31 (10): 2824–2827.

3. Kolesnikov N. A., Kharkov V. N., Zarubin A. A., et al. Signals of Directed Selection in the Indigenous Populations of Siberia. Russian Journal of Genetics. 2022; 58 (4): 473–477.

4. Tagliabracci V. S., Engel J. L., Wen J. et al. Secreted Kinase Phosphorylates Extracellular Proteins That Regulate Biomineralization. Science. 2012; 336 (6085): 1150.

5. Schlesinger P. H., Doebber T. W., Mandell B. F., et al. Plasma clearance of glycoproteins with terminal mannose and N-acetylglucosamine by liver non-parenchymal cells. Studies with beta-glucuronidase, N-acetyl-beta-D-glucosaminidase, ribonuclease B and agalacto-orosomucoid. Biochemical Journal. 1978; 176 (1): 103.

6. Lee S. J., Evers S., Roeder D., et al. Mannose receptor-mediated regulation of serum glycoprotein homeostasis. Science. 2002; 295 (5561): 1898–1901.

7. Tang K., Thornton K. R., Stoneking M. A New Approach for Using Genome Scans to Detect Recent Positive Selection in the Human Genome. PLOS Biology. 2007; 5 (7): e171.

8. Myles S., Somel M., Tang K., et al. Identifying genes underlying skin pigmentation differences among human populations. Human Genetics. 2007; 120 (5): 613–621.

9. Pickrell J. K., Coop G., Novembre J., et al. Signals of recent positive selection in a worldwide sample of human populations. Genome Research. 2009; 19 (5): 826.


Рецензия

Для цитирования:


Колесников Н.А., Харьков В.Н., Зарубин А.А., Степанов В.А. Сигналы направленного отбора в популяциях коренного населения Средней Азии. Медицинская генетика. 2023;22(2):52-54. https://doi.org/10.25557/2073-7998.2023.02.52-54

For citation:


Kolesnikov N.A., Kharkov V.N., Zarubin A.A., Stepanov V.A. Signals of directed selection in the indigenous populations of Central Asia. Medical Genetics. 2023;22(2):52-54. (In Russ.) https://doi.org/10.25557/2073-7998.2023.02.52-54

Просмотров: 347


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2073-7998 (Print)