Preview

Медицинская генетика

Расширенный поиск
Доступ открыт Открытый доступ  Доступ закрыт Только для подписчиков

Связь локуса 17q23.1 с клинически выраженным атеросклерозом сонных артерий

https://doi.org/10.25557/2073-7998.2021.10.25-32

Полный текст:

Аннотация

Проведен анализ ассоциаций rs8078424 (chr17:59873104) с риском развития клинически выраженного атеросклероза сонных артерий и патогенетически значимыми для развития данной патологии количественными признаками, а также оценена связь данного генетического варианта с экспрессией гена MIR21 в лейкоцитах периферической крови пациентов. В группу обследования включены пациенты с клинически выраженным атеросклерозом сонных артерий (стеноз при ультразвуковом исследовании более 80%; n=104). В качестве контроля использованы популяционная выборка жителей г. Томска (n=161) и группа, состоящая из относительно здоровых индивидов, которые имели начальные стадии атеросклероза сонных артерий, но без гемодинамически значимых изменений (стеноз не более 24%; n=84). Генотипирование rs8078424 выполняли методом MALDI-TOF масс-спектрометрии на приборе Sequenom MassARRAY® (США). Уровень экспрессии гена MIR21 в лейкоцитах крови оценивался методом капельной цифровой ПЦР на приборе QX200 Droplet Digital PCR System (Bio-Rad). Выявлено, что генотип GG rs8078424 является протективным относительно развития клинически выраженного атеросклероза сонных артерий (OR=0,023, 95%CI:0,08-0,62; р=0,003), ассоциирован с меньшим уровнем общего холестерина в сыворотке крови и повышенной экспрессией гена MIR21 в лейкоцитах крови пациентов. Потенциальными молекулярными механизмами ассоциации rs8078424 с атеросклерозом являются изменение сайта связывания транскрипционных факторов (FOXP1, SOX18, GATA3, HOXD9, HOXD10 и C/EBPalpha), а также связь с экспрессией гена MIR21 в клетках органов-мишеней патологии. Полиморфизм локуса 17q23.1 (в области генов TUBD1, VMP1/MIR21) представляет интерес для более детального изучения подверженности к сердечно-сосудистым заболеваниям в контексте эпигенетических механизмов в отдельных клетках органов-мишеней патологии.

Об авторах

И. А. Гончарова
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия


Ю. А. Королева
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия


А. А. Слепцов
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия


Н. П. Бабушкина
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия


М. С. Кузнецов
Научно-исследовательский институт кардиологии, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия


Б. Н. Козлов
Научно-исследовательский институт кардиологии, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия


М. С. Назаренко
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия


Список литературы

1. Andreou I., Sun X., Stone P.H., et al. miRNAs in atherosclerotic plaque initiation, progression, and rupture. Trends Mol Med. 2015; 21(5):307-318. doi: 10.1016/j.molmed.2015.02.003.

2. Fasolo F., Di Gregoli K., Maegdefessel L., Johnson J.L. Non-coding RNAs in cardiovascular cell biology and atherosclerosis. Cardiovasc Res. 2019; 115(12):1732-1756. doi: 10.1093/cvr/cvz203

3. Herrmann B.G., Frischauf A.M. Isolation of genomic DNA. Methods Enzymol. 1987; 152:180-183. doi: 10.1016/0076-6879(87)52018-3.

4. Taylor S.C., Laperriere G., Germain H. Droplet Digital PCR versus qPCR for gene expression analysis with low abundant targets: from variable nonsense to publication quality data. Sci Rep. 2017; 7(1):2409. doi: 10.1038/s41598-017-02217-x.

5. Messeguer X., Escudero R., Farré D., et al. PROMO: detection of known transcription regulatory elements using species-tailored searches. Bioinformatics. 2002;18(2):333-334. doi: 10.1093/bioinformatics/18.2.333.

6. García-Ramírez M., Martínez-González J., Juan-Babot J.O., et al. Transcription factor SOX18 is expressed in human coronary atherosclerotic lesions and regulates DNA synthesis and vascular cell growth. Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2005; 25(11):2398-2403. doi: 10.1161/01.ATV.0000187464.81959.23.

7. Zhuang T., Liu J., Chen X., et al. Endothelial Foxp1 Suppresses Atherosclerosis via Modulation of Nlrp3 Inflammasome Activation. Circ Res. 2019; 125(6):590-605. doi: 10.1161/CIRCRESAHA.118.314402.

8. Yang M., Song L., Wang L., et al. Deficiency of GATA3-Positive Macrophages Improves Cardiac Function Following Myocardial Infarction or Pressure Overload Hypertrophy. J Am Coll Cardiol. 2018; 72(8):885-904. doi: 10.1016/j.jacc.2018.05.061.

9. Lescroart F., Zaffran S. Hox and Tale transcription factors in heart development and disease. Int J Dev Biol. 2018; 62(11-12):837-846. doi: 10.1387/ijdb.180192sz.

10. Souilhol C., Serbanovic-Canic J., Fragiadaki M., et al. Endothelial responses to shear stress in atherosclerosis: a novel role for developmental genes. Nat Rev Cardiol. 2020;17(1):52-63. doi: 10.1038/s41569-019-0239-5.

11. Manea S-A., Todirita A., Raicu M., Manea A. C/EBP transcription factors regulate NADPH oxidase in human aortic smooth muscle cells. J Cell Mol Med. 2014;18(7):1467-1477. doi: 10.1111/jcmm.12289.

12. Villegas-Ruiz V., Hendlmeier F., Buentello-Volante B., et al. Genome-wide mRNA analysis reveals a TUBD1 isoform profile as a potential biomarker for diabetic retinopathy development. Exp Eye Res. 2017;155:99-106. doi: 10.1016/j.exer.2017.01.004.

13. Ventham N.T., Kennedy N.A., Adams A.T., et al. Integrative epigenome-wide analysis demonstrates that DNA methylation may mediate genetic risk in inflammatory bowel disease. Nat Commun. 2016;7:13507. doi: 10.1038/ncomms13507.

14. O’Leary K., Adams A., Nimmo E., et al. Genetics, methylation, and disease state interact at the VMP1/MIR21 locus. Journal of Crohn’s and Colitis. 2018; 12(1): S544. https://doi.org/10.1093/ecco-jcc/jjx180.973

15. Prakash T., Veerappa A., Ramachandra N.B. Complex interaction between HNRNPD mutations and risk polymorphisms is associated with discordant Crohn’s disease in monozygotic twins. Autoimmunity. 2017;50(5):275-276. doi: 10.1080/08916934.2017.1300883.

16. Cruz-Romero C., Guo A., Bradley W.F., Novel Associations Between Genome-Wide Single Nucleotide Polymorphisms and MR Enterography Features in Crohn’s Disease Patients. J Magn Reson Imaging. 2021;53(1):132-138. doi: 10.1002/jmri.27250.

17. Chu A.Y., Guilianini F., Grallert H., et al. Genome-wide association study evaluating lipoprotein-associated phospholipase A2 mass and activity at baseline and after rosuvastatin therapy. Randomized Controlled Trial Circ Cardiovasc Genet. 2012; 5(6):676-685. doi: 10.1161/CIRCGENETICS.112.963314.

18. Kristensen S.L., Ahlehoff O., Lindhardsen J., et al. Disease activity in inflammatory bowel disease is associated with increased risk of myocardial infarction, stroke and cardiovascular death--a Danish nationwide cohort study. PLoS One. 2013;8(2):e56944. doi: 10.1371/journal.pone.0056944.

19. Sun P., Tang L.N,. Li G.Z., Effects of MiR-21 on the proliferation and migration of vascular smooth muscle cells in rats with atherosclerosis via the Akt/ERK signaling pathway. Eur Rev Med Pharmacol Sci. 2019;23(5):2216-2222. doi: 10.26355/eurrev_201903_17269.

20. Weber M., Baker M.B., Moore J.P., Searles C.D. MiR-21 is induced in endothelial cells by shear stress and modulates apoptosis and eNOS activity. Biochem Biophys Res Commun. 2010;393(4):643-8. doi: 10.1016/j.bbrc.2010.02.045.

21. Das A., Ganesh K., Khanna S., et al. Engulfment of apoptotic cells by macrophages: a role of microRNA-21 in the resolution of wound inflammation. J Immunol. 2014;192(3):1120-9. doi: 10.4049/jimmunol.1300613.

22. Fan X., Wang E., Wang X., et al. MicroRNA-21 is a unique signature associated with coronary plaque instability in humans by regulating matrix metalloproteinase-9 via reversion-inducing cysteine-rich protein with Kazal motifs. Exp Mol Pathol. 2014; 96(2):242-9. doi: 10.1016/j.yexmp.2014.02.009.

23. Markus B., Grote K., Worsch M., et al. Differential Expression of MicroRNAs in Endarterectomy Specimens Taken from Patients with Asymptomatic and Symptomatic Carotid Plaques. PLoS One. 2016; 11(9):e0161632. doi: 10.1371/journal.pone.0161632.

24. Nariman-Saleh-Fam Z., Vahed S.Z., Aghaee-Bakhtiari S.H., et al. Expression pattern of miR-21, miR-25 and PTEN in peripheral blood mononuclear cells of patients with significant or insignificant coronary stenosis. Gene. 2019; 698:170-178. doi: 10.1016/j.gene.2019.02.074.

25. Li S., Fan Q., He S., et al. MicroRNA-21 negatively regulates Treg cells through a TGF-β1/Smad-independent pathway in patients with coronary heart disease. Cell Physiol Biochem. 2015; 37(3):866-78. doi: 10.1159/000430214.

26. Miśkowiec D., Lipiec P., Wierzbowska-Drabik K., et al. Association between microRNA-21 concentration and lipid profile in patients with acute coronary syndrome without persistent ST-segment elevation. Pol Arch Med Wewn. 2016;126(1-2):48-57. doi: 10.20452/pamw.3267.

27. Li J., Chen H., Ren J., et al. Effects of statin on circulating microRNAome and predicted function regulatory network in patients with unstable angina. BMC Med Genomics. 2015; 8:12. doi: 10.1186/s12920-015-0082-4.


Рецензия

Для цитирования:


Гончарова И.А., Королева Ю.А., Слепцов А.А., Бабушкина Н.П., Кузнецов М.С., Козлов Б.Н., Назаренко М.С. Связь локуса 17q23.1 с клинически выраженным атеросклерозом сонных артерий. Медицинская генетика. 2021;20(10):25-32. https://doi.org/10.25557/2073-7998.2021.10.25-32

For citation:


Goncharova I.A., Koroleva I.A., Sleptsov A.A., Babushkina N.P., Kuznetsov M.S., Kozlov B.N., Nazarenko M.S. The association of 17q23.1 locus with advanced carotid atherosclerosis. Medical Genetics. 2021;20(10):25-32. (In Russ.) https://doi.org/10.25557/2073-7998.2021.10.25-32

Просмотров: 42


ISSN 2073-7998 (Print)