Preview

Медицинская генетика

Расширенный поиск

Новая транзиция c.1621C>T (p.Gln541*) гена FYCO1 - основная причина аутосомно-рецессивной формы катаракты (CTRCT18) в Якутии: результаты полноэкзомного секвенирования

Полный текст:

Аннотация

Врожденная катаракта - основная причина детской слепоты во многих популяциях мира. В Якутии врожденная катаракта является одним из наиболее частых орфанных заболеваний с неустановленной генетической природой. Для поиска молекулярно-генетических причин этого заболевания было проведено полноэкзомное секвенирование (Illumina NextSeq 500) у одного пациента с врожденной катарактой из якутской семьи, в которой, помимо обследуемого, было еще два пораженных сибса, а родители имели сохранное зрение. Полноэкзомный анализ выявил у этого пациента новую гомозиготную транзицию c.1621C>T в 8-м экзоне гена FYCO1 (локус CATC2, CTRCT18, OMIM 610019), ранее известного в ассоциации с врожденной катарактой. Замена c.1621C>T приводит к образованию преждевременного стоп-кодона p.Gln541*, терминирующего трансляцию белка FYCO1 (FYVE and coiled-coil domain containing 1 protein), выполняющего ключевую транспортную роль при процессах автофагии в клетках хрусталика. В настоящее время сведения о транзиции c.1621C>T отсутствуют в базах данных 1000 Genomes, ESP6500 и ExAC. Секвенирование по Сэнгеру подтвердило сегрегацию гомозиготности по c.1621C>T с врожденной катарактой в якутской семье: все пораженные сибсы были гомозиготами, а их здоровые родители - гетерозиготами по этому варианту. Результаты полноэкзомного секвенирования в обследованной якутской семье и последующий скрининг варианта c.1621C>T у других пациентов с врожденной катарактой в Якутии показали, что, в целом, вклад гомозиготной транзиции с.1621C>T (p.Gln541*) в этиологию врожденной катаракты составил 87,5%, с очагами накопления в центральных районах Якутии. Полученные результаты позволяют предположить, что обнаруженный впервые вариант c.1621C>T (p.Gln541*) гена FYCO1 является основной причиной врожденной аутосомно-рецессивной катаракты (CTRCT18) в Якутии.

Об авторах

Н. А. Барашков
Якутский научный центр комплексных медицинских проблем; Северо-Восточный федеральный университет им. М.К. Аммосова
Россия


Ф. А. Коновалов
Медико-генетический научный центр; Геномед
Россия


А. В. Соловьев
Якутский научный центр комплексных медицинских проблем; Северо-Восточный федеральный университет им. М.К. Аммосова
Россия


Ф. М. Терютин
Якутский научный центр комплексных медицинских проблем; Северо-Восточный федеральный университет им. М.К. Аммосова
Россия


В. Г. Пшенникова
Якутский научный центр комплексных медицинских проблем; Северо-Восточный федеральный университет им. М.К. Аммосова
Россия


Н. В. Сапожникова
Республиканская школа-интернат для слепых и слабовидящих детей
Россия


Л. С. Вытюжина
Республиканская больница №1 - Национальный центр медицины
Россия


М. И. Томский
Якутский научный центр комплексных медицинских проблем
Россия


Л. У. Джемилева
Институт биохимии и генетики УНЦ РАН; Башкирский государственный медицинский университет
Россия


Э. К. Хуснутдинова
Институт биохимии и генетики УНЦ РАН; Башкирский государственный университет
Россия


О. Л. Посух
Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики СО РАН; Новосибирский государственный университет
Россия


С. А. Федорова
Якутский научный центр комплексных медицинских проблем; Северо-Восточный федеральный университет им. М.К. Аммосова
Россия


Список литературы

1. Robinson GC, Jan JE, Kinnis C. Congenital ocular blindness in children 1945 to 1984. Am J Dis Child. 1987. 141: 1321-1324.

2. Lambert SR, Drack AV. Infantile cataracts. Surv. Ophthalmol. 1996. 40: 427-458.

3. Francois J. Genetics of cataract Ophthalmologica. 1982. 184: 61-71.

4. Merin S. Inherited Cataracts. Inherited Eye Diseases. 1991. S.Merin (Ed.) Marcel Dekker, Inc., New York: 86-120.

5. Haargaard B, Wohlfahrt J, Fledelius HC et al. A nationwide Danish study of 1027 cases of congenital/infantile cataracts: etiological and clinical classifications // Ophthalmology. 2004. 111: 2292-229.

6. Hejtmancik J.F. Congenital cataracts and their molecular genetics. 2008. Semin. Cell Dev. Biol. 19: 134-149

7. Shiels A, Bennett TM, Hejtmancik JF. Cat-Map: Putting cataract on the map. Mol. Vis., 2010. 16: 2007-2015.

8. Cohen D, Bar-Yosef U, Levy J et al. Homozygous CRYBB1 deletion mutation underlies autosomal recessive congenital cataract. Invest. Ophthalmol. 2007. 48: 2208-2213.

9. Chacon-Camacho OF, Buentello-Volante B, Velazquez-Montoya R et al. Homozygosity mapping identifies a GALK1 mutation as the cause of autosomal recessive congenital cataracts in 4 adult siblings. Gene. 2014 Jan 25; 534(2): 218-221.

10. Kaul H, Riazuddin SA, Shahid M et al. Autosomal recessive congenital cataract linked to EPHA2 in a consanguineous Pakistani family. Mol. Vis. 2010. 16: 511-517.

11. Ponnam SP, Ramesha K, Tejwani S. et al. Mutation of the gap junction protein alpha 8 (GJA8) gene causes autosomal recessive cataract. J. Med. Genet. 2007. 44, e85.

12. Ponnam SP, Ramesha K, Tejwani S et al. A missense mutation in LIM2 causes auto-somal recessive congenital cataract. Mol. Vis. 2008. 14: 1204-1208.

13. Pras E, Frydman M, Levy-Nissenbaum E et al. A nonsense mutation (W9X) in CRYAA causes autosomal recessive cataract in an inbred Jewish Persian family. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 2000. 41: 3511-3515.

14. Pras E, Levy-Nissenbaum E, Bakhan T et al. A missense mutation in the LIM2 gene is associated with autosomal recessive presenile cataract in an inbred Iraqi Jewish family. Am J Hum Genet. 2002. 70: 1363-1367.

15. Pras E., Raz J, Yahalom V et al. A nonsense mutation in the glucosaminyl (N-acetyl) transferase 2 gene (GCNT2): Association with autosomal recessive congenital cataracts. Invest Ophthalmol Vis. Sci. 2004. 45: 1940-1945.

16. Ramachandran RD, Perumalsamy V, Hejtmancik JF. Autosomal recessive juvenile onset cataract associated with mutation in BFSP1. Hum Genet. 2007. 121: 475-482.

17. Riazuddin SA, Yasmeen A, Yao W. et al. Mutations in betaB3-crystallin associated with autosomal recessive cataract in two Pakistani families. Invest. Ophthalmol. 2005. Vis. Sci. 46: 2100-2106.

18. Smaoui N, Beltaief O, BenHamed S et al. A homozygous splice mutation in the HSF4 gene is associated with an autosomal recessive congenital cataract. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 2004. 45: 2716-2721.

19. Aldahmesh MA, Khan AO, Mohamed JY et al. Identification of a Truncation Mutation of Acylglycerol Kinase (AGK) Gene in a Novel Autosomal Recessive Cataract Locus // Hum Mut. 2012. 33: 960-962.

20. Tarskaia LA, Zinchenko RA, El’chinova GI et al. The structure and diversity of hereditary pathology in Sakha Republic (Yakutia). Russ J Genet. 2004. 40: 1530-1539.

21. Galeeva N M, Nazarenko LP, Nazarenko S.A. et al. Molecular-genetic cause of recessive congenital methemoglobinemia type 1 in Yakutia. Med Genet. 2005. 9: 15-21.

22. Макисмова Н.Р. Клинико-генеалогическая и молекулярно-генетическая характеристика этноспецифических форм наследственной патологии у якутов: автореферат дис.. доктора медицинских наук: 03.00.15, 14.00.09 / Максимова Надежда Романовна; [Место защиты: Науч.-исслед. ин-т медицинской генетики Том. науч. центра СО РАМН]. - Томск, 2009. - 43 с.

23. Barashkov NA, Dzhemileva LU, Fedorova SA et al. Autosomal recessive deafness 1A (DFNB1A) in Yakut population isolate in Eastern Siberia: extensive accumulation of the splice site mutation IVS1+1G>A in GJB2 gene as a result of founder effect. J Hum Genet. 2011; 56: 631- 639.

24. Pankiv S, Johansen T. FYCO1: Linking autophagosomes to microtubule plus end directing molecular motors, Autophagy 2010. 6: 550-552.

25. Pras E, Pras E, Bakhan T et al. A gene causing autosomal recessive cataract maps to the short arm of chromosome 3. Isr. Med. Assoc. 2001. J.3: 559-562.

26. Chen J, Ma Z, Jiao X. Mutations in FYCO1 cause autosomal-recessive congenital cataracts. Am J Hum Genet. 2011. 88: 827-38.


Для цитирования:


Барашков Н.А., Коновалов Ф.А., Соловьев А.В., Терютин Ф.М., Пшенникова В.Г., Сапожникова Н.В., Вытюжина Л.С., Томский М.И., Джемилева Л.У., Хуснутдинова Э.К., Посух О.Л., Федорова С.А. Новая транзиция c.1621C>T (p.Gln541*) гена FYCO1 - основная причина аутосомно-рецессивной формы катаракты (CTRCT18) в Якутии: результаты полноэкзомного секвенирования. Медицинская генетика. 2016;15(10):25-33.

For citation:


Barashkov N.A., Konovalov F.A., Solovyev A.V., Teryutin F.M., Pshennikova V.G., Sapojnikova N.V., Vytuzhina L.S., Tomsky M.I., Dzhemileva L.U., Khusnutdinova E.K., Posukh O.L., Fedorova S.A. Novel transition c.1621C>T (p.Gln541*) in the FYCO1 gene is a major cause of congenital autosomal recessive cataract (CTRCT18) in Yakutia: results of whole exome sequencing. Medical Genetics. 2016;15(10):25-33. (In Russ.)

Просмотров: 158


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2073-7998 (Print)