Структурные особенности гена SIRT1 у жителей сибирского региона
Аннотация
Депрессия - многофакторное психическое расстройство, являющееся одной из основных причин инвалидности и приводящее к самоубийству в 15% случаев. Активный поиск генетической компоненты депрессии выявил ряд генов-кандидатов, ассоциированных с депрессией. Недавние исследования продемонстрировали ассоциацию ряда полиморфных вариантов гена SIRT1 с депрессией. В то же время остается неизученной специфика распределения полиморфных вариантов в гене SIRT1 в различных популяциях, что может быть существенным при анализе ассоциаций. Нами была изучена структура кодирующей часть гена SIRT1 в популяциях якутов, тувинцев и жителей Новосибирска. В зависимости от этнической группы наблюдалось изменение частот встречаемости полиморфных вариантов.
Об авторах
Д. А. Бердюгина
ФГБНУ «Научно-исследовательский институт нейронаук и медицины»
Россия
Россия
А. Н. Савостьянов
ФГБНУ «Научно-исследовательский институт нейронаук и медицины»; ФГБНУ «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук»
Россия
Россия
Д. В. Базовкина
ФГБНУ «Научно-исследовательский институт нейронаук и медицины»; ФГБНУ «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук»
Россия
Россия
С. П. Коваленко
ФГБНУ «Федеральный исследовательский центр фундаментальной и трансляционной медицины»
Россия
Россия
Л. И. Афтанас
ФГБНУ «Научно-исследовательский институт нейронаук и медицины»
Россия
Россия
Список литературы
1. Möller H.J. Suicide, suicidality and suicide prevention in affective disorders. Acta Psychiatrica Scandinavica. 2003; 108(s418):73-80.
2. McKenna M. et al. Assessing the Burden of Disease in the United States Using Disability-Adjusted Life Years. American Journal of Preventive Medicine. 2005; 28(5): 415-423.
3. Alegria M. et al. Disparity in Depression Treatment Among Racial and Ethnic Minority Populations in the United States. Psychiatric Services. American Psychiatric Association Publishing. 2008; 59(11): 1264-1272.
4. González H.M. et al. The epidemiology of major depression and ethnicity in the United States. Journal of Psychiatric Research. 2010; 44(15): 1043-1051.
5. Williams E.D. et al. Depressive symptoms are doubled in older British South Asian and Black Caribbean people compared with Europeans: Associations with excess co-morbidity and socioeconomic disadvantage. Psychological Medicine. 2015; 45(9): 1861-1871.
6. Haverkamp G.L.G. et al. Psychological distress in the hospital setting: A comparison between native Dutch and immigrant patients. PLoS ONE. 2015; 10(6):e0130961. doi: 10.1371/journal.pone.0130961.
7. Schouten R.W. et al. Ethnic Differences in the Association of Depressive Symptoms with Clinical Outcome in Dialysis Patients. Journal of Racial and Ethnic Health Disparities. 2019; 6(5): 990-1000.
8. Bigdeli T.B. et al. Genetic effects influencing risk for major depressive disorder in China and Europe. Translational Psychiatry. 2017; 7(3): e1074.
9. Sullivan P.F. et al. A mega-analysis of genome-wide association studies for major depressive disorder. Molecular Psychiatry. 2013; 18(4): 497-511.
10. Consortium C. Sparse whole-genome sequencing identifies two loci for major depressive disorder. Nature. 2015; 523(7562): 588-591.
11. Sullivan P.F., Neale M.C., Kendler K.S. Genetic Epidemiology of Major Depression: Review and Meta-Analysis. American Journal of Psychiatry. 2000; 157(10): 1552-1562.
12. Eley T.C., Stevenson J. Exploring the Covariation between Anxiety and Depression Symptoms: A Genetic Analysis of the Effects of Age and Sex // Journal of Child Psychology and Psychiatry. 1999; 40(8): 1273-1282.
13. Muglia P. et al. Genome-wide association study of recurrent major depressive disorder in two European case-control cohorts. Molecular Psychiatry. 2010; 15(6): 589-601.
14. Millan M.J. Multi-target strategies for the improved treatment of depressive states: Conceptual foundations and neuronal substrates, drug discovery and therapeutic application. Pharmacology and Therapeutics. 2006; 110(2): 135-370.
15. Nestler E.J. et al. Neurobiology of depression. Neuron. 2002; 34(1): 13-25.
16. Lacerda-Pinheiro S.F. et al. Are there depression and anxiety genetic markers and mutations? A systematic review. Journal of Affective Disorders. 2014; 168: 387-398.
17. López-León S. et al. Meta-analyses of genetic studies on major depressive disorder. Molecular Psychiatry. 2008; 13(8): 772-785.
18. Saavedra K. et al. Epigenetic Modifications of Major Depressive Disorder. International Journal of Molecular Sciences. 2016; 17(8): 1279.
19. Hattori E. et al. Preliminary genome-wide association study of bipolar disorder in the Japanese population. American journal of medical genetics. Part B, Neuropsychiatric genetics. 2009; 150B(8): 1110-1117.
20. Kohli M.A. et al. The Neuronal Transporter Gene SLC6A15 Confers Risk to Major Depression. Neuron. 2011; 70(2): 252-265.
21. Kovanen L., Donner K., Partonen T. SIRT1 polymorphisms associate with seasonal weight variation, depressive disorders, and diastolic blood pressure in the general population. PLoS ONE. 2015$ 10(10): e0141001. doi: 10.1371/journal.pone.0141001.
22. Hyde C.L. et al. Identification of 15 genetic loci associated with risk of major depression in individuals of European descent. Nature genetics. 2016; 48(9):1031-1036.
23. Wray N.R. et al. Genome-wide association analyses identify 44 risk variants and refine the genetic architecture of major depression. Nature Genetics. 2018; 50(5): 668-681.
24. Tang W. et al. SIRT1 rs3758391 and Major Depressive Disorder: New Data and Meta-Analysis. Neuroscience Bulletin. 2018; 34(5): 863-866.
25. Zhu Z. et al. Shared genetics of asthma and mental health disorders: a large-scale genome-wide cross-trait analysis. European Respiratory Journal. 2019; 54(6): 1901507.
26. Aftanas L.I. et al. SIRT1 Allele Frequencies in Depressed Patients of European Descent in Russia. Frontiers in Genetics. 2019; 9, 686.
27. Leheste J.R., Torres G. Resveratrol: brain effects on SIRT1, GPR50 and photoperiodic signaling. Frontiers in Molecular Neuroscience. 2015; 8:61.
28. Liu W. et al. The depression GWAS risk allele predicts smaller cerebellar gray matter volume and reduced SIRT1 mRNA expression in Chinese population. Translational Psychiatry. 2019; 9(1):333.
29. Li C. et al. miR-138 increases depressive-like behaviors by targeting SIRT1 in hippocampus. Neuropsychiatric Disease and Treatment. 2020; 16: 949-957.
30. Luo X.-J., Zhang C. Down-Regulation of SIRT1 Gene Expression in Major Depressive Disorder. American Journal of Psychiatry. 2016; 173(10): 1046-1046.
31. Lin R. et al. Common variants in SIRT1 and human longevity in a Chinese population. BMC Medical Genetics. 2016; 17(1): 1-7.
32. Tagliari C.F. da S. et al. Investigation of SIRT1 gene variants in HIV-associated lipodystrophy and metabolic syndrome. Genetics and Molecular Biology. 2020; 43(1): 1-9.
33. Clarke T.-K. et al. Investigating shared aetiology between type 2 diabetes and major depressive disorder in a population based cohort. American Journal of Medical Genetics Part B: Neuropsychiatric Genetics. 2017; 174(3): 227-234.
Рецензия
Для цитирования:
Бердюгина Д.А., Савостьянов А.Н., Базовкина Д.В., Коваленко С.П., Афтанас Л.И. Структурные особенности гена SIRT1 у жителей сибирского региона. Медицинская генетика. 2021;20(6):27-32. https://doi.org/10.25557/2073-7998.2021.06.27-32
For citation:
Berdyugina D.A., Savostyanov A.N., Bazovkina D.V., Kovalenko S.P., Aftanas L.I. Structural features of the gene SIRT1 in residents of the Siberian region. Medical Genetics. 2021;20(6):27-32. (In Russ.) https://doi.org/10.25557/2073-7998.2021.06.27-32
Просмотров: 185
Послать статью по эл. почте 