Preview

Медицинская генетика

Расширенный поиск

Анализ коэкспрессии генов плацентарного транскриптома как основа для поиска ключевых сигнальных путей и биомаркеров преэклампсии

https://doi.org/10.25557/2073-7998.2020.11.71-72

Полный текст:

Аннотация

Проблема профилактики и ранней диагностики преэклампсии (ПЭ) продолжает оставаться одной из ведущих в акушерстве, поскольку данное осложнение беременности несет большой риск материнской и младенческой смертности. Считается, что основная причина ПЭ - это нарушение этапов формирования плаценты, а регуляции экспрессии генов является значимым механизмом развития плацентарной патологии. Классический подход в транскриптомных исследованиях экспрессии основан на поиске дифференциально-экспрессирующихся генов при заболевании, однако такой подход рассматривает гены изолированно, не учитывая их возможные взаимодействия. Более перспективным подходом является анализ коэкспрессии, который описывает гены, вовлеченные в единые биологические пути патологического процесса, а также позволяет выделять в каждом из кластеров наиболее функционально значимый ген в сети - центральный (hub gene).

Об авторах

А. А. Бабовская
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия


Е. А. Трифонова
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия


А. А. Зарубин
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия


А. В. Марков
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия


В. А. Степанов
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия


Список литературы

1. Gene Expression Omnibus. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/

2. DAVID Bioinformatics Resources 6.8. URL: https://david.ncifcrf.gov/

3. STRING. URL: https://string-db.org/

4. Wu Y. et al. Identification of novel biomarkers for preeclampsia on the basis of differential expression network analysisю Experimental and therapeutic medicine 2016; 12(1): 201-207.


Для цитирования:


Бабовская А.А., Трифонова Е.А., Зарубин А.А., Марков А.В., Степанов В.А. Анализ коэкспрессии генов плацентарного транскриптома как основа для поиска ключевых сигнальных путей и биомаркеров преэклампсии. Медицинская генетика. 2020;19(11):71-72. https://doi.org/10.25557/2073-7998.2020.11.71-72

For citation:


Babovskaya A.A., Trifonova E.A., Zarubin A.A., Markov A.V., Stepanov V.A. Co-expression network analysis of placental transcriptome as the basis for searching signal ways and preeclampsia biomarkers. Medical Genetics. 2020;19(11):71-72. (In Russ.) https://doi.org/10.25557/2073-7998.2020.11.71-72

Просмотров: 18


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2073-7998 (Print)