Ассоциации полиморфизма генов TOMM40 и APOE с количественными фенотипами сердечно-сосудистой системы в популяции русских Сибирского региона

Актуальность: гены TOMM40 и APOE расположены в одном локусе на хромосоме 19 (19p13). Анализ вклада полиморфизма этих генов в вариабельность клинически значимых показателей в популяции позволит оценить их роль в формировании заболеваний сердечно-сосудистой системы и их эндофенотипов. Цель: изучить полиморфизм восьми однонуклеотидных замен и политиминового (поли-Т) повтора в локусе TOMM40 / APOE в выборке здоровых индивидуумов и выявить ассоциации полиморфных вариантов с количественными показателями деятельности сердечно-сосудистой системы. Материалы и методы: в двух выборках индивидов, здоровых в отношении сердечно-сосудистых заболеваний (г.Томска, N = 183 и г.Кемерово. N = 183), были изучены полиморфизмы rs741780, rs2075650, rs1160985, rs157580, rs8106922, rs10524523 (поли-Т повтор) в гене TOMM40 и APOE: rs7259620, rs429358 и rs7412. Генотипирование проведено методами ПЦР в реальном времени и фрагментного анализа. Анализ ассоциаций с количественными признаками выполнен путем дисперсионного анализа и непараметрических критериев Манна-Уитни и Краскела-Уоллеса. Результаты. Получены оценки частот аллелей исследованных полиморфизмов у русского населения Западной Сибири, соответствующие характеристикам европеоидных популяций. Редкие аллели rs741780 и rs1160985 ассоциированы с более низкими уровнями триглицеридов (p = 0,031 и p = 0,044, соответственно); длинный аллель (L) поли-Т повтора rs10524523 ассоциирован с более высоким уровнем глюкозы (p = 0,027); rs7412 вносит вклад в вариабельность общего холестерола (р = 0,002) и липопротеидов низкой плотности (р = 0,006); rs2075650 ассоциирован с уровнями систолического артериального давления и липопротеидов низкой плотности в подгруппе мужчин (p = 0,026 и p = 0,002); генотип GG rs8106922 - с уровнем триглицеридов в подгруппе женщин (p = 0,036); rs429358 - с уровнем общего холестерола и липопротеидами низкой плотности (p = 0,002 и p = 0,006). Выводы. Полиморфизмы в локусе генов TOMM40/АРОЕ вносят вклад в изменчивость показателей липидного спектра, уровня глюкозы и артериального давления крови у русского населения Западной Сибири.

популяция, сердечно-сосудистая система, липидный профиль, TOMM40, APOE, population, cardiovascular system, lipid profile, TOMM40, APOE

1. Пузырёв ВП. Вопросы вокруг идентифицируемых генов подверженности распространенным болезням человека. Молекулярно-биологические технологии в медицинской практике. 2009;13:3-16.

2. Aulchenko YS, Ripatti S, Lindqvist I et al. Loci influencing lipid levels and coronary heart disease risk in 16 European population cohorts. Nat Genet. 2009;41:47-55.

3. Middelberg RP, Ferreira MA, Henders AK et al. Genetic variants in LPL, OASL and TOMM40/APOE-C1-C2-C4 genes are associated with multiple cardiovascular-related traits. BMC Med Genet. 2011;12:123.

4. Talmud PJ, Drenos F, Shah S et al. Gene-centric Association signals for lipids and apolipoproteins identified via the HumanCVD BeadChip. Am J Hum Genet. 2009;85:628-642.

5. The 1000 Genomes Project Consortium. A global reference for human genetic variation. Nature;526:68-74.

6. Roses AD, Lutz MW, Amrine-Madsen H, et al. A TOMM40 variable-length polymorphism predicts the age of late-onset Alzheimer’s disease. Pharmacogenomics Journal. 2010;10(5):375-384.

7. Ronald J, Rajagopalan R, Ranchalis JE et al. Analysis of recently identified dyslipidemia alleles reveals two loci that contribute to risk for carotid artery disease. Lipids. Health. Dis. 2009;8:52.

8. Mazzotti DR, Singulane CC, Ota VK et al. Association of APOE, GCPII and MMP9 polymorphisms with common diseases and lipid levels in an older adult/elderly cohort. Gene. 2014;535(2):370-375.