Preview

Медицинская генетика

Расширенный поиск

Ассоциации полиморфизма генов TOMM40 и APOE с количественными фенотипами сердечно-сосудистой системы в популяции русских Сибирского региона

https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2016-5-24-27

Полный текст:

Аннотация

Актуальность: гены TOMM40 и APOE расположены в одном локусе на хромосоме 19 (19p13). Анализ вклада полиморфизма этих генов в вариабельность клинически значимых показателей в популяции позволит оценить их роль в формировании заболеваний сердечно-сосудистой системы и их эндофенотипов. Цель: изучить полиморфизм восьми однонуклеотидных замен и политиминового (поли-Т) повтора в локусе TOMM40 / APOE в выборке здоровых индивидуумов и выявить ассоциации полиморфных вариантов с количественными показателями деятельности сердечно-сосудистой системы. Материалы и методы: в двух выборках индивидов, здоровых в отношении сердечно-сосудистых заболеваний (г.Томска, N = 183 и г.Кемерово. N = 183), были изучены полиморфизмы rs741780, rs2075650, rs1160985, rs157580, rs8106922, rs10524523 (поли-Т повтор) в гене TOMM40 и APOE: rs7259620, rs429358 и rs7412. Генотипирование проведено методами ПЦР в реальном времени и фрагментного анализа. Анализ ассоциаций с количественными признаками выполнен путем дисперсионного анализа и непараметрических критериев Манна-Уитни и Краскела-Уоллеса. Результаты. Получены оценки частот аллелей исследованных полиморфизмов у русского населения Западной Сибири, соответствующие характеристикам европеоидных популяций. Редкие аллели rs741780 и rs1160985 ассоциированы с более низкими уровнями триглицеридов (p = 0,031 и p = 0,044, соответственно); длинный аллель (L) поли-Т повтора rs10524523 ассоциирован с более высоким уровнем глюкозы (p = 0,027); rs7412 вносит вклад в вариабельность общего холестерола (р = 0,002) и липопротеидов низкой плотности (р = 0,006); rs2075650 ассоциирован с уровнями систолического артериального давления и липопротеидов низкой плотности в подгруппе мужчин (p = 0,026 и p = 0,002); генотип GG rs8106922 - с уровнем триглицеридов в подгруппе женщин (p = 0,036); rs429358 - с уровнем общего холестерола и липопротеидами низкой плотности (p = 0,002 и p = 0,006). Выводы. Полиморфизмы в локусе генов TOMM40/АРОЕ вносят вклад в изменчивость показателей липидного спектра, уровня глюкозы и артериального давления крови у русского населения Западной Сибири.

Об авторах

Р. Р. Салахов
Научно-исследовательский институт комплексных проблем сердечно-сосудистых заболеваний
Россия


О. А. Макеева
Научно-исследовательский институт комплексных проблем сердечно-сосудистых заболеваний; НИИ медицинской генетики, Томский НИМЦ
Россия


М. В. Голубенко
Научно-исследовательский институт комплексных проблем сердечно-сосудистых заболеваний; НИИ медицинской генетики, Томский НИМЦ
Россия


О. Л. Барбараш
Научно-исследовательский институт комплексных проблем сердечно-сосудистых заболеваний
Россия


В. П. Пузырев
Научно-исследовательский институт комплексных проблем сердечно-сосудистых заболеваний; НИИ медицинской генетики, Томский НИМЦ
Россия


Список литературы

1. Пузырёв ВП. Вопросы вокруг идентифицируемых генов подверженности распространенным болезням человека. Молекулярно-биологические технологии в медицинской практике. 2009;13:3-16.

2. Aulchenko YS, Ripatti S, Lindqvist I et al. Loci influencing lipid levels and coronary heart disease risk in 16 European population cohorts. Nat Genet. 2009;41:47-55.

3. Middelberg RP, Ferreira MA, Henders AK et al. Genetic variants in LPL, OASL and TOMM40/APOE-C1-C2-C4 genes are associated with multiple cardiovascular-related traits. BMC Med Genet. 2011;12:123.

4. Talmud PJ, Drenos F, Shah S et al. Gene-centric Association signals for lipids and apolipoproteins identified via the HumanCVD BeadChip. Am J Hum Genet. 2009;85:628-642.

5. The 1000 Genomes Project Consortium. A global reference for human genetic variation. Nature;526:68-74.

6. Roses AD, Lutz MW, Amrine-Madsen H, et al. A TOMM40 variable-length polymorphism predicts the age of late-onset Alzheimer’s disease. Pharmacogenomics Journal. 2010;10(5):375-384.

7. Ronald J, Rajagopalan R, Ranchalis JE et al. Analysis of recently identified dyslipidemia alleles reveals two loci that contribute to risk for carotid artery disease. Lipids. Health. Dis. 2009;8:52.

8. Mazzotti DR, Singulane CC, Ota VK et al. Association of APOE, GCPII and MMP9 polymorphisms with common diseases and lipid levels in an older adult/elderly cohort. Gene. 2014;535(2):370-375.


Для цитирования:


Салахов Р.Р., Макеева О.А., Голубенко М.В., Барбараш О.Л., Пузырев В.П. Ассоциации полиморфизма генов TOMM40 и APOE с количественными фенотипами сердечно-сосудистой системы в популяции русских Сибирского региона. Медицинская генетика. 2016;15(5):24-27. https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2016-5-24-27

For citation:


Salakhov R.R., Makeeva O.A., Golubenko M.B., Barbarash O.L., Puzyrev V.P. Associations of TOMM40 and APOE genes polymorphisms with quantitative phenotypes of cardiovascular system in Russian population of the Siberia region. Medical Genetics. 2016;15(5):24-27. (In Russ.) https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2016-5-24-27

Просмотров: 185


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2073-7998 (Print)