Preview

Медицинская генетика

Расширенный поиск

Метилирование отдельных CpG-динуклеотидов в генах сигнального пути Wnt как потенциальный эпигенетический маркер злокачественных новообразований молочной железы

https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2016-5-18-23

Полный текст:

Аннотация

Актуальность. Аномальные изменения профилей метилирования ДНК в опухолевых клетках обладают высоким потенциалом для применения в качестве онкомаркеров. Злокачественные новообразования молочной железы являются одним из наиболее распространённых типов онкопатологии, в связи с чем идентификация новых молекулярно-генетических диагностических маркеров приобретает особую актуальность. Цель. Целью работы явилась характеристика профилей метилирования генов онкогенного пути Wnt SFRP2 , PYGO1 и WIF1 с точки зрения их потенциального применения в качестве эпигенетических маркеров злокачественных новообразований молочной железы. Материалы и методы. Для характеристики профилей метилирования ДНК вблизи точек начала транскрипции генов-кандидатов использован метод бисульфитного секвенирования. Анализ аналитической чувствительности и специфичности детекции опухолей проводили с помощью кривых ROC в статистическом пакете SPSS. Результаты. В опухолевых образцах обнаружено гиперметилирование исследованных областей генов SFRP2 , PYGO1 и WIF1 , включающих 14, 5 и 7 CpG-динуклеотидов, соответственно. В целом, в опухолях уровень метилирования ДНК был значительно выше, чем в гистологически нормальной ткани. Использование индекса метилирования наиболее информативных единичных CpG-динуклеотидов обеспечило высокие показатели чувствительности и специфичности детекции опухолевых образцов: 88% и 94% (ген SFRP2 , здесь и далее: чувствительность и специфичность), 100% и 81% (ген PYGO1 ), 81% и 88% (ген WIF1 ). Значимых изменений уровня метилирования CpG-динуклеотидов в зависимости от клинической стадии опухолей не обнаружено, что свидетельствует о раннем возникновении аномалий гиперметилирования при развитии рака молочной железы. Выводы. Уровень метилирования отдельных CpG-динуклеотидов генов SFRP2 , PYGO1 и WIF1 позволяет с высокой точностью детектировать образцы злокачественных новообразований молочной железы и представляет интерес в качестве потенциальных диагностических маркеров. Обнаружение аномального гиперметилирования уже на ранних стадиях развития опухоли перспективно в контексте разработки методов ранней онкодиагностики.

Об авторах

Е. А. Москалев
Институт патологии, Университет Фридриха-Александра в Эрлангене и Нюрнберге; НИИ медицинской генетики, Томский НИМЦ
Россия


В. В. Бубнов
Одесский национальный медицинский университет
Россия


И. Н. Лебедев
НИИ медицинской генетики, Томский НИМЦ
Россия


Список литературы

1. Warton K, Samimi G. Methylation of cell-free circulating DNA in the diagnosis of cancer. Front Mol Biosci. 2015;2(13): eCollection.

2. Cancer Genome Atlas Network. Comprehensive molecular portraits of human breast tumours. Nature. 2012;490(7418):61-70.

3. Vogelstein B, Papadopoulos N, Velculescu VE et al. Cancer genome landscapes. Science. 2013; 339(6127):1546-58.

4. Кекеева ТВ, Жевлова АИ, Подистов ЮИ. Аномальное метилирование генов-супрессоров опухолевого роста и микросателлитная нестабильность в предраковых состояниях шейки матки. Молекулярная биология. 2006;40:224-230.

5. van Hoesel AQ, Sato Y, Elashoff DA et al. Assessment of DNA methylation status in early stages of breast cancer development. Br J Cancer. 2013;108(10):2033-2038.

6. Skvortsova TE, Rykova EY, Tamkovich SN et al. Cell-free and cell-bound circulating DNA in breast tumours: DNA quantification and analysis of tumour-related gene methylation. Br J Cancer. 2006;94(10):1492-1495.

7. Ponomaryova AA, Rykova EY, Cherdyntseva NV et al. Potentialities of aberrantly methylated circulating DNA for diagnostics and post-treatment follow-up of lung cancer patients. Lung Cancer. 2013;81(3):397-403.

8. Botla SK, Gholami AM, Malekpour M et al. Diagnostic values of GHSR DNA methylation pattern in breast cancer. Breast Cancer Res Treat. 2012;135(3):705-713.

9. Lin SY, Xia W, Wang JC et al. Beta-catenin, a novel prognostic marker for breast cancer: its roles in cyclin D1 expression and cancer progression. Proc Natl Acad Sci U S A 2000;97:4262-4266.

10. Takebe N, Warren RQ, Ivy SP. Breast cancer growth and metastasis: interplay between cancer stem cells, embryonic signaling pathways and epithelial-to-mesenchymal transition. Breast Cancer Res. 2011;13(3):211.

11. Moskalev EA, Zavgorodnij MG, Majorova SP et al. Correction of PCR-bias in quantitative DNA methylation studies by means of cubic polynomial regression. Nucleic Acids Res. 2011;39(11):e77.

12. Anastas JN, Moon RT. WNT signalling pathways as therapeutic targets in cancer. Nat Rev Cancer. 2013;13(1):11-26.

13. Klarmann GJ, Decker A, Farrar WL. Epigenetic gene silencing in the Wnt pathway in breast cancer. Epigenetics. 2008;3(2):59-63.

14. Rush LJ, Raval A, Funchain P et al. Epigenetic profiling in chronic lymphocytic leukemia reveals novel methylation targets. Cancer Res. 2004;64(7):2424-2433.


Для цитирования:


Москалев Е.А., Бубнов В.В., Лебедев И.Н. Метилирование отдельных CpG-динуклеотидов в генах сигнального пути Wnt как потенциальный эпигенетический маркер злокачественных новообразований молочной железы. Медицинская генетика. 2016;15(5):18-23. https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2016-5-18-23

For citation:


Moskalev E.A., Bubnov V.V., Lebedev I.N. Single CpG methylation of Wnt signalling pathway components as a potential epigenetic marker of breast cancer. Medical Genetics. 2016;15(5):18-23. (In Russ.) https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2016-5-18-23

Просмотров: 136


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2073-7998 (Print)