Эпигенетическая модификация Х-сцепленных CNV в норме и патологии
https://doi.org/ 10.25557/2073-7998.2018.11.29-33
Аннотация
Актуальность: Процесс инактивации Х-хромосомы в женском организме происходит равновероятно, тогда как отклонения в сторону преимущественной инактивации одного из родительских гомологов могут свидетельствовать о наличии в нём мутаций и приводить к развитию наследственной патологии у потомства. Цель: Идентификация Х-сцепленных локусов, эпигенетические модификации которых могут компенсировать развитие патологического фенотипа. Материалы и методы: Обследовано 111 женщин с невынашиванием беременности и 47 женщин, не имеющих спонтанных абортов в анамнезе. С использованием метилчувствительной ПЦР и микроматричного хромосомного анализа проанализированы Х-сцепленные вариации в числе копий повторов ДНК (CNV) в лимфоцитах периферической крови женщин с экстремальным смещением инактивации Х-хромосомы. Результаты: Частота экстремального смещения Х-инактивации среди женщин с невынашиванием беременности и в контрольной группе составила 9 и 4% соответственно (p>0,05). У 8 женщин с экстремальным смещением инактивации и невынашиванием беременности идентифицированы Х-сцепленные CNV в Xp11.23, Xp22.33, Xq24 и Xq28, а также проанализирован их генный состав. Показано, что большая часть идентифицированных СNV тем или иным образом связана с развитием Х-сцепленных форм умственной отсталости. Выводы: Эпигенетическая модификация Х-сцепленных CNV компенсирует их фенотипическое проявление у женщин-носительниц. В то же время, отсутствие компенсаторных эпигенетических модификаций может явиться фактором риска рождения ребенка с Х-сцепленной формой наследственной болезни или нарушения эмбрионального развития, несовместимого с живорождением.
Об авторах
Е. Н. Толмачёва
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр РАН; Сибирский государственный медицинский университет
Россия
Россия
А. А. Кашеварова
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр РАН
Россия
Россия
Л. П. Назаренко
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр РАН; Сибирский государственный медицинский университет
Россия
Россия
Н. А. Скрябин
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр РАН
Россия
Россия
Е. А. Фонова
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр РАН
Россия
Россия
Е. О. Беляева
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр РАН
Россия
Россия
О. А. Салюкова
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр РАН; Сибирский государственный медицинский университет
Россия
Россия
Л. И. Минайчева
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр РАН
Россия
Россия
К. А. Павлова
Сибирский государственный медицинский университет
Россия
Россия
Л. А. Затула
Сибирский государственный медицинский университет
Россия
Россия
И. Н. Лебедев
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр РАН; Сибирский государственный медицинский университет
Россия
Россия
Список литературы
1. Sui Y., Chen Q., Sun X. Association of skewed X chromosome inactivation and idiopathic recurrent spontaneous abortion: a systematic review and meta-analysis. Reprod Biomed Online. 2015 Aug;31(2):140-148.
2. Thunstrom А., Sodermark L., Ivarsson L., Samuelsson L., Stefanova M. UBE2A deficiency syndrome: a report of two unrelated cases with large Xq24 deletions encompassing UBE2A gene. Am J Med Genet A. 2015 Jan;167A(1):204-210.
3. Tsurusaki Y., Ohashi I., Enomoto Y. et al. A novel UBE2A mutation causes X-linked intellectual disability type Nascimento. Hum Genome Var. 2015 Jгn;4:17019.
4. Verkerk A.J.M.H., Zeidler S., Breedveld G. et al. CXorf56, a dendritic neuronal protein, identified as a new candidate gene for X-linked intellectual disability. Eur J Hum Genet. 2018 Apr;26(4):552-560.
5. Толмачёва Е.Н., Васильев С.А., Саженова Е.А. и др. Асимметричная инактивация Х-хромосомы у внутриутробно погибших эмбрионов человека. Цитология. 2015, 57(11): 808-812.
6. Mithani S.K., Smith I.M., Califano J.A. Use of integrative epigenetic and cytogenetic analyses to identify novel tumor-suppressor genes in malignant melanoma. Melanoma Res. 2011 Aug;21(4):298-307.
7. Yan Z., Fedorov S.A., Mumby M.C., Williams R.S. PR48, a novel regulatory subunit of protein phosphatase 2A, interacts with Cdc6 and modulates DNA replication in human cells. Mol Cell Biol. 2000 Feb;20(3):1021-1029.
8. База данных GENE: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene 1.08.2018
9. El-Hattab A.W., Fang P., Jin W. et al. Int22h-1/int22h-2-mediated Xq28 rearrangements: intellectual disability associated with duplications and in utero male lethality with deletions. J Med Genet. 2011 Dec;48(12):840-850.
10. Morin R.D., O’Connor M.D., Griffith M. et al. Application of massively parallel sequencing to microRNA profiling and discovery in human embryonic stem cells. Genome Res. 2008 Apr;18(4):610-621.
Рецензия
Для цитирования:
Толмачёва Е.Н., Кашеварова А.А., Назаренко Л.П., Скрябин Н.А., Фонова Е.А., Беляева Е.О., Салюкова О.А., Минайчева Л.И., Павлова К.А., Затула Л.А., Лебедев И.Н. Эпигенетическая модификация Х-сцепленных CNV в норме и патологии. Медицинская генетика. 2018;17(11):29-33. https://doi.org/ 10.25557/2073-7998.2018.11.29-33
For citation:
Tolmacheva E.N., Kashevarova A.A., Nazarenko L.P., Skryabin N.A., Fonova E.A., Belyaeva E.O., Saliukova O.A., Minaycheva L.I., Pavlova K.A., Zatula L.A., Lebedev I.N. Epigenetic modification of X-linked CNV in norm and pathology. Medical Genetics. 2018;17(11):29-33. (In Russ.) https://doi.org/ 10.25557/2073-7998.2018.11.29-33
Просмотров: 356
Послать статью по эл. почте 