Preview

Медицинская генетика

Расширенный поиск
Доступ открыт Открытый доступ  Доступ закрыт Только для подписчиков

Молекулярно-генетический анализ 617 российских пациентов с клиническим диагнозом «нейрофиброматоз»: новые патогенные и редкие непатогенные генетические варианты

https://doi.org/ 10.25557/2073-7998.2018.11.20-24

Полный текст:

Аннотация

Актуальность. При нейрофиброматозе первого и второго типа патогенные мутации распределены вдоль кодирующих областей генов NF1 и NF2 равномерно, при этом более чем в 50% случаев заболевание является результатом мутации de novo . Как следствие, поиск патогенной мутации у пациента является особенно трудоемким, и каталоги патогенных и непатогенных генетических вариантов являются необходимым вспомогательным материалом в работе врача-генетика. Цель. Определить спектры генетических нарушений у российских больных нейрофиброматозом; охарактеризовать ранее не описанные патогенные генетические варианты и непатогенные генетические варианты с низкой популяционной частотой. Материалы и методы. Исследование проведено на материале ДНК лимфоцитов периферической крови и/или опухолевого материала 617 пациентов. Высокопроизводительное параллельное секвенирование (NGS) проводили на приборах Ion Torrent PGM и Ion Torrent S5 с использованием панели праймеров, охватывающей экзоны генов NF1 и NF2 , включая нетранслируемые области, а также прилегающие к экзонам участки интронов (20-70 п.н.). Верификацию патогенных генетических вариантов осуществляли секвенированием по Сэнгеру, поиск протяженных делеций генов NF1 и NF2 - методом MLPA. Результаты. Проведена комплексная молекулярно-генетическая диагностика нарушений генов NF1 и NF2 у 617 пациентов. В 303 случаях выявлены нарушения в гене NF1 и в 19 случаях - NF2 . Выводы. Охарактеризовано 69 ранее неописанных патогенных вариантов (68 - в геге NF1, 1 - в гене NF2 ), а также 68 редких непатогенных генетических вариантов генов NF1 и NF2 . Большинство непатогенных генетических вариантов представлено синонимичными однонуклеотидными заменами и нуклеотидными заменами в нетранслируемых регионах, которые особенно сложны для интерпретации при проведении медико-генетического консультирования.

Об авторах

М. С. Пащенко
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»
Россия


К. О. Карандашева
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»
Россия


Е. Б. Кузнецова
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»; ФГАОУ ВО Первый Московский государственный медицинский университет имени И.М. Сеченова Министерства здравоохранения Российской Федерации
Россия


И. В. Анисимова
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»
Россия


Л. А. Бессонова
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»
Россия


В. А. Галкина
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»
Россия


Д. М. Гусева
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»
Россия


Н. А. Демина
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»
Россия


О. Н. Макиенко
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»
Россия


Т. В. Маркова
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»
Россия


Г. Н. Матющенко
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»
Россия


М. С. Петухова
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»
Россия


Н. А. Семенова
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»
Россия


А. С. Танас
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»; ФГБОУ ВО «Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Пирогова» Министерства здравоохранения Российской Федерации
Россия


Д. В. Залетаев
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»; ФГАОУ ВО Первый Московский государственный медицинский университет имени И.М. Сеченова Министерства здравоохранения Российской Федерации
Россия


В. В. Стрельников
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»; ФГБОУ ВО «Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Пирогова» Министерства здравоохранения Российской Федерации
Россия


Список литературы

1. Kresak JL, Walsh M. Hereditary Cancer Syndromes in Children: Neurofibromatosis: A Review of NF1, NF2, and Schwannomatosis. Journal of pediatric genetics. 2016 Jun;5(2):98.

2. Ferner RE, Huson SM, Thomas N, Moss C, Willshaw H, Evans DG, Upadhyaya M, Towers R, Gleeson M, Steiger C, Kirby A. Guidelines for the diagnosis and management of individuals with neurofibromatosis 1 (NF1). Journal of medical genetics. 2006(14):81-88.

3. Friedman JM. Epidemiology of neurofibromatosis type 1. American journal of medical genetics. 1999 Mar 26;89(1):1-6.

4. Шнайдер НА. Нейрофиброматоз 1-го типа: этиопатогенез, клиника, диагностика, прогноз. Международный неврологический журнал. 2007(5):162-7.

5. Rasmussen SA, Yang Q, Friedman JM. Mortality in neurofibromatosis 1: an analysis using US death certificates. The American Journal of Human Genetics. 2001 May 1;68(5):1110-8.

6. Xu G, O’Connell P, Viskochil D, Cawthon R, Robertson M, Culver M, Dunn D, Stevens J, Gesteland R, White R, Weiss R. The neurofibromatosis type 1 gene encodes a protein related to GAP. Cell. 1990 Aug 10;62(3):599-608.

7. Cichowski K, Jacks T. NF1 tumor suppressor gene function: narrowing the GAP. Cell. 2001 Feb 23;104(4):593-604.

8. Barton B, North K. Social skills of children with neurofibromatosis type 1. Developmental Medicine & Child Neurology. 2004;46(8):553-563.

9. Asthagiri AR, Parry DM, Butman JA, Kim HJ, Tsilou ET, Zhuang Z, Lonser RR. Neurofibromatosis type 2. The Lancet. 2009 Jun 6;373(9679):1974-86.

10. Thomas G. Merel P., Sanson M. et al. Neurofibromatosis type 2. European Journal of Cancer. 1994;30(13):1981-1987.

11. Evans G. R., Lloyd S. K. W., Ramsden R. T. Neurofibromatosis type 2. Medical Genetics in the Clinical Practice of ORL. Karger Publishers. 2011(70):91-98.

12. McClatchey AI, Giovannini M. Membrane organization and tumorigenesis - the NF2 tumor suppressor, Merlin. Genes & development. 2005 Oct 1;19(19):2265-77.

13. Lallemand D, Curto M, Saotome I, Giovannini M, McClatchey AI. NF2 deficiency promotes tumorigenesis and metastasis by destabilizing adherens junctions. Genes & development. 2003 May 1;17(9):1090-100.

14. Alkindy A, Chuzhanova N, Kini U, Cooper DN, Upadhyaya M. Genotype-phenotype associations in neurofibromatosis type 1 (NF1): an increased risk of tumor complications in patients with NF1 splice-site mutations? Human genomics. 2012 Dec;6(1):12.

15. Чаплыгина МС, Кузнецова ЕБ, Танас АC и др. Результаты использования новой медицинской технологии комплексной ДНК-диагностики нейрофиброматоза. Медицинская генетика. 2016;15(11):24-8.

16. Рыжкова О.П., Кардымон О.Л., Прохорчук Е.Б., Коновалов Ф.А., Масленников А.Б., Степанов В.А., Афанасьев А.А., Заклязьминская Е.В., Костарева А.А., Павлов А.Е., Голубенко М.В., Поляков А.В., Куцев С.И. Руководство по интерпретации данных, полученных методами массового параллельного секвенирования (MPS). Медицинская генетика. 2017;16(7):4-17.


Для цитирования:


Пащенко М.С., Карандашева К.О., Кузнецова Е.Б., Анисимова И.В., Бессонова Л.А., Галкина В.А., Гусева Д.М., Демина Н.А., Макиенко О.Н., Маркова Т.В., Матющенко Г.Н., Петухова М.С., Семенова Н.А., Танас А.С., Залетаев Д.В., Стрельников В.В. Молекулярно-генетический анализ 617 российских пациентов с клиническим диагнозом «нейрофиброматоз»: новые патогенные и редкие непатогенные генетические варианты. Медицинская генетика. 2018;17(11):20-24. https://doi.org/ 10.25557/2073-7998.2018.11.20-24

For citation:


Pashchenko M.S., Karandasheva K.O., Kuznetsova E.B., Anisimova I.V., Bessonova L.A., Galkina V.A., Guseva D.M., Demina N.A., Makienko O.N., Markova T.V., Matyushchenko G.N., Petuhova M.S., Semenova M.A., Tanas A.S., Zaletaev D.V., Strelnikov V.V. Genetic analysis of 617 Russian neurofibromatosis patients: novel pathogenic and rare non-pathogenic mutations. Medical Genetics. 2018;17(11):20-24. (In Russ.) https://doi.org/ 10.25557/2073-7998.2018.11.20-24

Просмотров: 72


ISSN 2073-7998 (Print)