Спектры герминальных и соматических мутаций при диффузном и интестинальном типах рака желудка
Аннотация
Актуальность. Рак желудка (РЖ) - одно из наиболее распространенных онкологических заболеваний, занимающее пятое место в мире по заболеваемости и третье - по смертности среди всех злокачественных новообразований. До недавнего времени классификация РЖ основывалась преимущественно на гистологических критериях. Цель. Охарактеризовать спектры мутаций генов, вовлеченных в канцерогенез РЖ, в различных гистологических типах опухолей, и провести поиск новых мутаций в этих генах у российских пациентов. Материалы и методы. Для анализа 52 образцов РЖ и парных им образцов морфологически неизмененной ткани применили метод NGS с использованием двух панелей праймеров - Ion AmpliSeq Cancer Hotspot Panel v2, широко используемой в мире для анализа «горячих точек» в генах, вовлеченных в онкогенез, и разработанной нами панели для секвенирования генов, вовлеченных в развитие РЖ. Результаты. При использовании двух панелей выявлено 20 генетических вариантов, характеризующихся исключительно низкими популяционными частотами (не выше 0,00004, согласно базе данных gnomAD), и 19 ранее не описанных генетических вариантов. Показано статистически значимое обогащение выборки опухолей интестинального гистологического типа соматическими миссенс-мутациями в гене TP53 . Герминальный статус определен для 4 новых генетических вариантов в генах RB1 , SMO и CDH1 .
Ключевые слова
Об авторах
М. В. Немцова
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»; Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова Министерства здравоохранения Российской Федерации
Россия
Россия
А. И. Калинкин
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»; Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова Министерства здравоохранения Российской Федерации
Россия
Россия
А. С. Танас
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»; Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова Министерства здравоохранения Российской Федерации
Россия
Россия
Т. В. Хоробрых
Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова Министерства здравоохранения Российской Федерации
Россия
Россия
И. И. Быков
Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова Министерства здравоохранения Российской Федерации
Россия
Россия
К. И. Кириллова
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»
Россия
Россия
Е. А. Алексеева
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»; Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова Министерства здравоохранения Российской Федерации
Россия
Россия
Е. Б. Кузнецова
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»; Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова Министерства здравоохранения Российской Федерации
Россия
Россия
Д. В. Залетаев
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»; Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова Министерства здравоохранения Российской Федерации
Россия
Россия
В. В. Стрельников
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»; Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова Министерства здравоохранения Российской Федерации
Россия
Россия
Список литературы
1. Torre LA, Bray F, Siegel RL, et al. Global cancer statistics, 2012. CA: a cancer journal for clinicians. 2015;65(2):87-108.
2. Lauren P. The two histological main types of gastric carcinoma: diffuse and so called intestinal type carcinoma: an attempt at a histoclinical classification. Acta Pathologica Microbiologica Scandinavica. 1965;64(1):31-49.
3. Hamilton SR, Aaltonen LA (Eds.). Pathology and genetics of tumours of the digestive system. 2000;Vol.48. Lyon:: IARC press.
4. Пирогов СС, Соколов ВВ, Беляков ММ, Каприн АД. Ранний рак желудка: современный взгляд на проблему. Сибирский онкологический журнал. 2017;16(5):71-86.
5. Katona BW, Rustgi AK. Gastric cancer genomics: advances and future directions. Cellular and molecular gastroenterology and hepatology. 2017;3(2):211-217.
6. Cancer Genome Atlas Research Network. Comprehensive molecular characterization of gastric adenocarcinoma. Nature. 2014;513(7517):202-209.
7. Cristescu R, Lee J, Nebozhyn M, et al. Molecular analysis of gastric cancer identifies subtypes associated with distinct clinical outcomes. Nature medicine. 2015;21(5):449-456.
8. Costa-Guda J, Soong CP, Parekh VI, Agarwal, SK, Arnold A. Germline and somatic mutations in cyclin-dependent kinase inhibitor genes CDKN1A, CDKN2B, and CDKN2C in sporadic parathyroid adenomas. Hormones and Cancer.2013;4(5):301-307.
9. Zauber NP, Sabbath Solitare M, Marotta S, et al. Clinical and genetic findings in an Ashkenazi Jewish population with colorectal neoplasms. Cancer. 2005;104(4):719-729.
10. Risinger JI, Berchuck A, Kohler MF, Boyd J. Mutations of the E-cadherin gene in human gynecologic cancers. Nature genetics. 1994;7(1), 98-102.
Рецензия
Для цитирования:
Немцова М.В., Калинкин А.И., Танас А.С., Хоробрых Т.В., Быков И.И., Кириллова К.И., Алексеева Е.А., Кузнецова Е.Б., Залетаев Д.В., Стрельников В.В. Спектры герминальных и соматических мутаций при диффузном и интестинальном типах рака желудка. Медицинская генетика. 2018;17(11):11-14. https://doi.org/ 10.25557/2073-7998.2018.11.11-14
For citation:
Nemtsova M.V., Kalinkin A.I., Tanas A.S., Khorobrykh T.V., Bykov I.I., Kirillova K.I., Alekseeva E.A., Kuznetsova E.B., Zaletaev D.V., Strelnikov V.V. Spectra of germline and somatic mutations in diffuse and intestinal types of gastric cancer. Medical Genetics. 2018;17(11):11-14. (In Russ.) https://doi.org/ 10.25557/2073-7998.2018.11.11-14
Просмотров: 470
Послать статью по эл. почте 