Частоты аллелей и генотипов, ассоциированных с чувствительностью к антикоагулянтам из группы антагонистов витамина К, в казахской популяции
Аннотация
Изучена популяционная частота аллелей и генотипов CYP2C9*2 (rs12254292), *3 (rs9332108), *5 (rs1927465) и *6 (rs12254292); CYP2C19 (rs11187240); VKORC1 (rs9923231), (rs9934438); CYP4F2 (rs2108622); EPHX1 (rs7542242); GGCX (rs12616455); PROC (rs11887389), ассоциированных с эффективностью антикоагулянтной терапии антагонистами витамина К, в казахской популяции. Популяционную выборку составили 2230 условно здоровых казахов. Показано, что в казахской популяции распределение генотипов изученных 11 полиморфизмов находится в соответствии с равновесием Харди-Вайнберга (p>0,05), за исключением CYP2C9 * 3 (р<0,05). Сравнительный анализ показал, что по частотам аллелей CYP2C9*3 , CYP2C9*5 , CYP2C9*6 , неблагоприятных аллелей гена VKORC1 (rs9923231; rs9934438) и GGCX (rs11676382) казахская популяция занимает промежуточное положение между описанными ранее популяциями Европы и Азии. Частота минорных аллелей CYP2C9*2 , CYP2C19 , PROC (rs2069910) в казахской популяции не имела различий с европейскими популяциями, но достоверно отличается от аналогичных показателей популяции Южной Азии.
Об авторах
Г. С. Святова
Республиканское государственное предприятие на праве хозяйственного ведения «Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии» Министерства здравоохранения Республики Казахстан
Россия
Россия
Г. М. Березина
Республиканское государственное предприятие на праве хозяйственного ведения «Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии» Министерства здравоохранения Республики Казахстан
Россия
Россия
Е. М. Миербеков
Акционерное общество «Национальный научный центр хирургии им. А.Н. Сызганова»
Россия
Россия
А. В. Муртазалиева
Республиканское государственное предприятие на праве хозяйственного ведения «Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии» Министерства здравоохранения Республики Казахстан
Россия
Россия
Список литературы
1. V. G. Manolopoulos, G. Ragia, and A. Tavridou. Pharmacogenomics of oral antidiabetic medications: current data and pharmacoepigenomic perspective. Pharmacogenomics. Aug;12(8):1161-91.
2. V. G. Manolopoulos, G. Ragia, and A. Tavridou. Pharmacogenetics of coumarinic oral anticoagulants. Pharmacogenomics 2010 Apr; 11(4):493-6.
3. http://www.cypalleles.ki.se/cyp2c9.htm.
4. Wadelius M, Chen LY, Eriksson N, etc. Association of warfarin dose with genes involved in its action and metabolism. Hum Genet. 2007 Mar; 121(1):23-34.
5. Borgiani P, Ciccacci C, Forte V, Sirianni E, Novelli L, Bramanti P, Novelli G. CYP4F2 genetic variant (rs2108622) significantly contributes to warfarin dosing variability in the Italian population. Pharmacogenomics. 2009 Feb; 10(2):261-6.
6. L. Bodin, C. Verstuyft, D. A. Tregouet et al. Cytochrome P450 2C9 (CYP2C9) and vitamin K epoxide reductase (VKORC1) genotypes as determinants of acenocoumarol sensitivity. Blood. 2005 Jul 1;106(1):135-40.
7. http://www.fda.gov/downloads/NewsEvents/Newsroom/MediaTranscripts/ucm123583.pdf.
8. Zhu Y., Shennan M., Reynolds K.K., Johnson N.A., Herrnberger M.R., Valdes R., Jr., Linder M.W. Estimation of warfarin maintenance dose based on VKORC1 (-1639 G>A) and CYP2C9 genotypes. Clin Chem. 2007 Jul;53(7):1199-205.
9. http://warfarindosing.org/Source/Home.aspx
10. H. Schelleman, N. A. Limdi, and S. E. Kimmel. Ethnic differences in warfarin maintenance dose requirement and its relationship with genetics. Br J Clin Pharmacol. 2010 Sep; 70(3): 393-399
11. K. Arvanitidis, G. Ragia, M. Iordanidou et al. Genetic polymorphisms of drug-metabolizing enzymes CYP2D6, CYP2C9, CYP2C19 and CYP3A5 in the Greek population. Fundam Clin Pharmacol. 2007 Aug;21(4):419-26.
12. R. A. Mirghani, G. Chowdhary, and G. Elghazali. Distribution of the major Cytochrome P450 (CYP) 2C9 genetic variants in a Saudi population. Fundam Clin Pharmacol. 2007 Aug;21(4):419-26.
13. L. Yang, W. Ge, F. Yu, and H. Zhu. Impact of VKORC1 gene polymorphism on interindividual and interethnic warfarin dosage requirement - a systematic review and meta analysis. Thromb Res. 2010 Apr;125(4):e159-66.
14. E. Efrati, H. Elkin, E. Sprecher, and N. Krivoy. Distribution of CYP2C9 and VKORC1 risk alleles for warfarin sensitivity and resistance in the Israeli population. Biomed Res Int. 2013; 2013: 315980.
15. Price, A.L. Principal components analysis corrects for stratification in genome-wide association studies. Nat Genet. 2006 Aug;38(8):904-9.
16. www.oege.org/software/Hardy-Weinbergequilibriumcalculator
17. Minoli A Perera, Larisa H Cavallari, Nita A Limdi, et al. Genetic variants associated with warfarin dose in African-American individuals: a genome-wide association study. Lancet. 2013 Aug 31; 382(9894):790-796.
18. http://www.calculator.net/sample-size-calculator.html?type=1&cl=80&ci=1.52&pp=32&ps=&x=0&y=0
19. http://www.internationalgenome.org/
20. Iskakova AN, Romanova Voronina AA, Voronina EN, Sikhayeva NS, Belozerceva AB, et al. (2014) Allele Frequency and Genotype Distribution of 9 SNPs in the Kazakh Population. J Pharmacogenomics Pharmacoproteomics 5:129.
21. Корчагина РП. Полиморфизм генов биотрансформации ксенобиотиков (CYP2C9, CYP4F2, CYP2D6, GSTM1, GSTT1) и гена VKORC1 в популяциях коренных этносов северной Сибири. Диссертация кандидата биологических наук: 03.02.07. Новосибирск 2012
Рецензия
Для цитирования:
Святова Г.С., Березина Г.М., Миербеков Е.М., Муртазалиева А.В. Частоты аллелей и генотипов, ассоциированных с чувствительностью к антикоагулянтам из группы антагонистов витамина К, в казахской популяции. Медицинская генетика. 2018;17(9):37-44. https://doi.org/10.25557/2073-7998.2018.09.37-44
For citation:
Svyatova G.S., Berezina G.M., Miyerbekov Y.M., Murtazaliyeva A.V. Frequency of alleys and genotypes associated with sensitivity to anticoagulants from the group of vitamin K antagonists in the Kazakh population. Medical Genetics. 2018;17(9):37-44. (In Russ.) https://doi.org/10.25557/2073-7998.2018.09.37-44
Просмотров: 311
Послать статью по эл. почте 