Результаты использования новой медицинской технологии комплексной ДНК-диагностики синдрома Сотоса

Проведено комплексное молекулярно-генетическое обследование больных с синдромом Сотоса. Для диагностики заболевания использовалась внедренная в практическую деятельность ФГБНУ «МГНЦ» новая медицинская технология, включающая методы таргетного высокопроизводительного параллельного секвенирования ДНК и мультиплексной амплификации лигированных зондов (MLPA). Поиск точковых мутаций и коротких инсерций/делеций в генах NSD1 и NFIX осуществляли с применением секвенирования нового поколения на приборе Ion Torrent PGM. Для выявления протяженных делеций в генах NSD1 и NFIX использовали метод MLPA. В группе пациентов с клиническими признаками синдрома Сотоса мутации в одном из исследуемых генов выявлены в 44% случаев. Все мутации выявлены высокопроизводительным параллельным секвенированием, расположены в кодирующих областях генов NSD1 и NFIX , и представлены однонуклеотидными заменами и делециями/инсерциями протяженностью от 1 до 31 нуклеотидов. Протяженных делеций/инсерций, охватывающих отдельные экзоны или целые гены, методом MLPA выявлено не было.

синдром Сотоса, ген NSD1, ген NFIX, медицинская технология, высокопроизводительное параллельное секвенирование ДНК, MLPA, Sotos syndrome, NSD1 gene, NFIX gene, medical technology, NGS, MLPA

1. Tatton-Brown K, Douglas J, Coleman K, et al. Genotype-phenotype associations in Sotos syndrome: an analysis of 266 individuals with NSD1 aberrations. Am J Hum Genet. 2005 Aug; 77(2):193-204.

2. Tatton-Brown K, Rahman N. Clinical features of NSD1-positive Sotos syndrome. Clin Dysmorphol. 2004 Oct; 13(4):199-204.

3. Cole TR, Hughes HE. Sotos syndrome: a study of the diagnostic criteria and natural history. J Med Genet. 1994 Jan; 31(1):20-32.

4. Baujat G, Rio M, Rossignol S, et al. Paradoxical NSD1 mutations in Beckwith-Wiedemann syndrome and 11p15 anomalies in Sotos syndrome. Am J Hum Genet. 2004 Apr; 74(4):715-720.

5. Wang, X., Yeh, S., Wu, G., et al. Identification and characterization of a novel androgen receptor coregulator ARA267-alpha in prostate cancer cells. J. Biol. Chem. 2001 Nov 2; 276(44): 40417-40423.

6. Faravelli F. NSD1 mutations in Sotos syndrome. Am J Med Genet C Semin Med Genet. 2005 Aug 15; 137C(1):24-31.

7. Visser R., Shimokawa O., Harada N., et al. Non-hotspot-related breakpoints of common deletions in Sotos syndrome are located within destabilised DNA regions. J Med Genet. 2005 Nov; 42(11):e66.

8. Malan, V., Rajan, D., Thomas, S., et al. Distinct effects of allelic NFIX mutations on nonsense-mediated mRNA decay engender either a Sotos-like or a Marshall-Smith syndrome. Am. J. Hum. Genet. 2010 Aug 13; 87(2):189-198.

9. Алексеева Е.А., Бабенко О.В., Козлова В.М., и соавт. Результаты использования новой медицинской технологии комплексной ДНК-диагностики ретинобластомы. Медицинская генетика. 2017; 16(10):41-46.

10. Залетаев, Д.В., Немцова, М.В., Стрельников, В.В. и соавт. Диагностика эпигенетической патологии при наследственных и онкологических заболеваниях. Молекулярная биология. 2004; 38(2):213-223.

11. Немцова, М.В., Стрельников, В.В., Бабенко, О.В. и соавт. Молекулярная диагностика эпигенетических нарушений при синдроме Видеманна-Беквита. Медицинская генетика. 2005; 4(1):33-38.

12. Strel’nikov, V.V., Nemtsova, M.V., Chesnokova, et al. Diagnosis of Martin-Bell syndrome based on an analysis of the structural-functional changes in the 5’-untranslated region of the FMR1 gene. Molekuliarnaia biologiia. 1998; 33(2):330-336.