АНАЛИЗ АЛЛЕЛЬНОГО ДИСБАЛАНСА ПРИ ГЛИОБЛАСТОМЕ: НОВЫЕ ХРОМОСОМНЫЕ УЧАСТКИ ПОТЕРИ ГЕТЕРОЗИГОТНОСТИ И НОВЫЕ ГЕНЫ-КАНДИДАТЫ

Путём микросателлитного анализа исследовано одиннадцать хромосомных локусов, в которых прежде не было описано случаев аллельного дисбаланса при глиобластоме. В двух локусах из одиннадцати — 18q11.2 и 21q21.1 — не выявлено случаев аллельного дисбаланса в выборке из 108 образцов глиобластомы. Однако в большинстве исследованных участков — 2q31.2, 3p25.1, 5q14.3, 6p21.1, 7q21.2, 9q21.33, 12q21.33, 16p13.12 и 19p13.2 — выявлены случаи аллельного дисбаланса с частотами 5,0%, 19,0%, 11,1%, 3,8%, 28,6%, 3,6%, 5,9%, 9,6% и 17,0% соответственно, что говорит об актуальности продолжения изучения глиобластомы на молекулярно-генетическом уровне. Для контроля репрезентативности выборки исследованы два хромосомных локуса: 8q21.3 и 14q13.3, для которых ранее было описано явление потери гетерозиготности при глиобластоме. Частоты аллельного дисбаланса по 8q21.3 и 14q13.3 в настоящем исследовании составили 15,8% и 42,3% соответственно, что совпадает с результатами других авторов. В работе рассматриваются потенциальные гены-кандидаты, расположенные в новых хромосомных локусах, для которых выявлен аллельный дисбаланс при глиобластоме. 

1. Алексеева Е.А., Шубина М.В., Горбачева Ю.В. и др. Молекулярно-генетическая диагностика в таргетной терапии опухолей головного мозга // Медицинская генетика. — 2012. — №2. — С. 3—10.

2. Алексеева Е.А., Горбачева Ю.В., Бабенко О.В. и др. Молекулярно-генетическая дифференциальная диагностика опухолей головного мозга // Медицинская генетика. — 2012. — №1. — С. 10—14.

3. Кузнецова Е.Б., Пудова Е.А., Танас А.С., Залетаев Д.В., Стрельников В.В. SEMA6B — кандидат на роль гена супрессора опухолевого роста в критическом хромосомном районе 19р13.3 // Медицинская генетика. — 2013. — Т. 12, №2. — С. 32—36.

4. Стрельников В.В., Малышева А.С., Землякова В.В., Кузнецова Е.Б., Алексеева Е.А., Смолин А.В., Прозоренко Е.В., Залетаев Д.В.. Делеции области расположения гена MGMT на хромосоме 10q26.3 в глиомах // Молекулярная медицина. — 2011. — №2. — С. 28—31.

5. Abkevich V., Timms K.M., Hennessy B.T. et al. Patterns of genomic loss of heterozygosity predict homologous recombination repair defects in epithelial ovarian cancer // British journal of cancer. — 2012. — Vol. 107(10). — P. 1776—1782.

6. Adamson C., Kanu O.O., Mehta A.I. et al. Glioblastoma multiforme: a review of where we have been and where we are going // Informa healthcare. — 2009. — Vol. 18(8). — P. 1061—1083.

7. Cairncross J.G., Ueki K., Zlatescu M.C. et al. Specific genetic predictors of chemotherapeutic response and survival in patients with anaplastic oligodendrogliomas // J. Natl. Inst. — 1998. — Vol. 90. — P. 1473—1479.

8. Cifola I., Spinelli R., Beltrame L. et al. Genome-wide screening of copy number alterations and LOH events in renal cell carcinomas and integration with gene expression profile // Molecular cancer. — 2008. — Vol. 7(1). — P. 6.

9. Davis F.G., McCarthy B.J. Current epidemiological trends and surveillance in brain tumors // Anticancer Ther. — 2001. — Vol. 1, №3. — P. 395—401.

10. Frank B., Wiestler M., Kropp S. et al. Association of a Common AKAP9 Variant With Breast Cancer Risk: A Collaborative Analysis // J. Natl. Cancer. — 2008. — Vol. 100. — P. 437—442.

11. Furnari F.B., Fenton T., Bachoo R.M. et al. Malignant astrocytic glioma: genetics, biology, and paths to treatment // Genes. Dev. — 2007. — Vol. 21. — P. 2683—2710.

12. Ginzinger D.G., Godfrey T.E., Nigro J. et al. Measurement of DNA copy number at microsatellite loci using quantitative PCR analysis // Cancer research. — 2000. — Vol. 60(19). — P. 5405—5409.

13. Harris T., Pan Q., Sironi J. et al. Both gene amplification and allelic loss occur at 14q13.3 in lung cancer // Clinical Cancer Research. — 2011. — Vol. 17(4). — P. 690—699.

14. Heaphy C.M., Bissofi M., Griffith J.K. Diagnostic significance of allelic imbalance in cancer // Informa healthcare. — 2007. — Vol. 1(2). — P. 159—168.

15. Heroux M.S., Chesnik M.A., Halligan B.D. et al. Comprehensive characterization of glioblastoma tumor tissue for biomarker identification using mass spectrometry-based label-free quantitative proteomics // Physiol. Genomics. — 2014. — Vol. 46. — P. 467—481.

16. Kim N., Hong Y., Kwon D. et al. Somatic Mutaome Profile in Human Cancer Tissues // Genomics and Informatics. — 2013. — Vol. 11(4). — P. 239—244.

17. Kim S.J., Sohn I., Do I.-G. et al. Gene expression profiles for the prediction of progression-free survival in diffuse large B cell lymphoma: results of a DASL assay // Ann. Hematol. — 2014. — Vol. 93. — P. 437—447.

18. Lapointe C.P., Wickens M. The Nucleic Acid-binding Domain and Translational Repression Activity of a Xenopus Terminal Uridylyl Transferase // J. Biol. Chem. — 2013. — Vol. 288(28). — P. 20723—20733.

19. Li Y., Wang Y., Yu L. miR-146b-5p inhibits glioma migration and invasion by targeting MMP16 // Cancer Letters. — 2013. — Vol. 339(2). — P. 260—269.

20. Mizoguchi M., Kuga D., Guan Y. Loss of heterozygosity analysis in malignant gliomas // Brain Tumor Pathol. — 2011. — Vol. 28. — P. 191—196.

21. Morita T., Mayanagi T., Sobue K. Dual roles of myocardin-related transcription factors in epithelial-mesenchymal transition via slug induction and actin remodeling // The J. of Cell Biology. — 2007. — Vol. 179. — P. 1027—1042.

22. Nigro J.M., Takahashi M.A., Ginzinger D.G. et al. Detection of 1p and 19q loss in oligodendroglioma by quantitative microsatellite analysis, a real-time quantitative polymerase chain reaction assay // The American journal of pathology. — 2001. — Vol. 158(4). — P. 1253—1262.

23. Ruano Y., Mollejo M., Ribalta T. et al. Identification of novel candidate target genes in amplicons of Glioblastoma multiforme tumors detected by expression and CGH microarray profiling // Molecular Cancer. — 2006. — Vol. 5. — P. 39.

24. Sainio A., Nyman M., Lund R. et al. Lack of Decorin Expression by Human Bladder Cancer Cells Offers New Tools in the Therapy of Urothelial Malignancies // Plos One. — 2013. — Vol. 8. — P. 1—8.

25. Tao L.-J., Chen Y.-S., Yao L. et al. PIN1 promoter polymorphism (842G>C) contributes to a decreased risk of cancer: Evidence from meta-analysis // Oncology Letters. — 2014. — Vol. 8. — P. 1360—1366.

26. Van Meir E.G., Hadjipanayis C.G., Norden A.D. et al. Exciting New Advances in Neuro-Oncology: the Avenue to a Cure for Malignant Glioma // CA Cancer J. Clin. — 2010. — Vol. 60(3). — P. 166—193.

27. Yu J., Madison J.M., Mundlos S. Characterization of a Human Homologue of the Saccharomyces cerevisiae Transcription Factor Spt3 (SUPT3H) // Genomics. — 1998. — Vol. 53. — P. 90—96.