Динамика генофонда населения мегаполиса по 18 STR Y-хромосомы и 27 аутосомным STR под действием миграции

Основным фактором динамики генофонда мегаполиса является миграция. В двух поколениях москвичей, а также в выборках из Санкт-Петербурга и Новосибирска изучены 18 STR Y-хромосомы, по полученным гаплотипам определены гаплогруппы Y-хромосомы с помощью интернет-предиктора Whit Athey’s. В двух поколениях москвичей изучены 27 аутосомных STR, не входящих в систему CODIS. При сравнении выборки из Новосибирска с выборками из Санкт-Петербурга и младшего поколения Москвы по профилям 18 STR Y-хромосомы выявлены статистически значимые различия по оценкам F_ST. Различия между двумя поколениями москвичей для 18 STR Y-хромосомы по значению F_ST существенно превышают значение F_ST, полученное для 27 аутосомных STR. Результаты исследования по ДНК-маркерам Y-хромосомы (18 STR, гаплогруппы) и аутосомным STR демонстрируют обоснованность специфического подхода при создании референтных баз данных для мегаполисов по конкретным ДНК-маркерам, обусловленного их различной динамикой в поколениях мегаполиса. Полученные результаты подтверждают необходимость создания отдельных баз данных для каждого мегаполиса для целей ДНК-идентификации и своевременного обновления этих баз в зависимости от динамики генофонда в поколениях под действием миграции.

1. Курбатова О.Л., Янковский Н.К. Миграция – основной фактор популяционной динамики городского населения России. Генетика. 2016;52(7):831–851.

2. Курбатова О.Л., Грачева А.С., Победоносцева Е.Ю., Удина И.Г. Генетико-демографические параметры населения Москвы. Миграционные процессы. Генетика. 2021;57(12):1438–1449.

3. Курбатова О.Л., Удина И.Г., Грачева А.С., и др. Генетико-демографические параметры населения г. Санкт-Петербурга. Миграционные процессы. Генетика. 2019;55(9): 1071-1082.

4. Курбатова О.Л., Удина И.Г., Грачева А.С. и др. Генетико-демографические параметры населения г. Новосибирска. Генетика. 2018;54(13):S74-84.

5. Грачева А.С., Победоносцева Е.Ю., Удина И.Г., Курбатова О.Л. Территориальная подразделенность популяции мегаполиса по этническому признаку в связи с проблемой создания генетических баз данных. Москва. Генетика. 2020; 54(12):1453-1463.

6. Грачева А.С., Победоносцева Е.Ю., Удина И.Г., Курбатова О.Л. Территориальная подразделенность популяции мегаполиса по этническому признаку в связи с проблемой создания генетических баз данных. Санкт-Петербург. Генетика. 2019; 55(12):1442- 1450.

7. Грачева А.С., Победоносцева Е.Ю., Удина И.Г., Курбатова О.Л. Территориальная подразделенность популяции мегаполиса по этническому признаку в связи с проблемой создания генетических баз данных. Новосибирск. Генетика. 2018;54(13): 85-90.

8. Удина И.Г., Грачева А.С., Курбатова О.Л. Частоты гаплогрупп Y-хромосомы и процессы миграции в трех поколениях жителей Москвы. Генетика. 2022;58(11):1325–1333.

9. Удина И.Г., Грачева А.С., Боринская С.А, Курбатова О.Л. Особенности распространения гаплогрупп Y-хромосомы в населении Санкт-Петербурга в связи с проблемой создания референтных баз данных. Генетика. 2023;59(11):1319–1325.

10. Athey T.W. Haplogroup prediction from Y-STR values using a Bayesian allele frequency approach. J. Genet. Geneal. 2006;2: 34–39.

11. Meza García L.A. Evolutionary Bioinformatics Online 2005:1 47-50 47 Arlequin (version 3.0): An integrated software package for population genetics data analysis. (URL: http://cmpg.unibe.ch/software/arlequin35)