medgenМедицинская генетикаMedical Genetics2073-7998Publishing House «Genius Media» LLC10.25557/2073-7998.2026.04.52-55medgen-3435Research ArticleКРАТКОЕ СООБЩЕНИЕBRIEF REPORTДинамика генофонда населения мегаполиса по 18 STR Y-хромосомы и 27 аутосомным STR под действием миграцииDynamics of gene pool of megapolis population by 18 STR of Y-chromosome and 27 autosomal STR under action of migrationУдинаИ. Г.UdinaI. G.

119991, г. Москва, ул. Губкина д. 3 

3 Gubkin str., Moscow, 119991 

irina_udina@mail.ruСкалинМ. Д.SkalinM. D.

119991, г. Москва, ул. Губкина д. 3 

121205, г. Москва, территория инновационного центра Сколково, Большой Бульвар, д. 42, стр. 1 

3 Gubkin str., Moscow, 119991 

42, Bldg. 1, Bolshoy Boulevard, Skolkovo innovation hub, Moscow, 121205 

ГубинаМ. А,GubinaM. A.

630090, г. Новосибирск, пр. ак. Лаврентьева, д. 10 

10, Prospekt Lavrentyeva, Novosibirsk, 630090 

ГрачеваА. С.GrachevaA. S.

119991, г. Москва, ул. Губкина д. 3 

3 Gubkin str., Moscow, 119991 

Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наукРоссияN.I. Vavilov Institute of General Genetics of the Russian Academy of SciencesRussian FederationИнститут общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук; OOO «ГОРДИЗ»РоссияN.I. Vavilov Institute of General Genetics of the Russian Academy of Sciences; Gordiz LLCRussian FederationФедеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наукРоссияFederal Research Center Institute of Cytology and Genetics of the Siberian Department of the Russian Academy of SciencesRussian Federation2026100520262545255Copyright © Удина И.Г., Скалин М.Д., Губина М.А., Грачева А.С., 20262026Удина И.Г., Скалин М.Д., Губина М.А., Грачева А.С.Udina I.G., Skalin M.D., Gubina M.A., Gracheva A.S.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/3435

Основным фактором динамики генофонда мегаполиса является миграция. В двух поколениях москвичей, а также в выборках из Санкт-Петербурга и Новосибирска изучены 18 STR Y-хромосомы, по полученным гаплотипам определены гаплогруппы Y-хромосомы с помощью интернет-предиктора Whit Athey’s. В двух поколениях москвичей изучены 27 аутосомных STR, не входящих в систему CODIS. При сравнении выборки из Новосибирска с выборками из Санкт-Петербурга и младшего поколения Москвы по профилям 18 STR Y-хромосомы выявлены статистически значимые различия по оценкам FST. Различия между двумя поколениями москвичей для 18 STR Y-хромосомы по значению FST существенно превышают значение FST, полученное для 27 аутосомных STR. Результаты исследования по ДНК-маркерам Y-хромосомы (18 STR, гаплогруппы) и аутосомным STR демонстрируют обоснованность специфического подхода при создании референтных баз данных для мегаполисов по конкретным ДНК-маркерам, обусловленного их различной динамикой в поколениях мегаполиса. Полученные результаты подтверждают необходимость создания отдельных баз данных для каждого мегаполиса для целей ДНК-идентификации и своевременного обновления этих баз в зависимости от динамики генофонда в поколениях под действием миграции.

In megalopolis, the main factor of dynamics of the gene pool is migration. In two generations of Moscow residents and, also, in the samples from Saint-Petersburg and Novosibirsk, 18 STR of Y-chromosome were studied, by obtained haplotypes Y-chromosome haplogroups were predicted using Internet-predictor Whit Athey’s. In two generations of Muscovites, 27 autosomal STR, not included in the system CODIS, were studied. In comparison of the sample from Novosibirsk with the samples from Saint-Petersburg and the young sample from Moscow, statistically significant estimates of genetic differentiation (FST) by profiles of 18 STR Y-chromosome were observed. For two samples of Muscovites, FST value by 18 STR of Y-chromosome was substantially higher, than the value of FST obtained by autosomal STR. The results of the investigation by DNA-markers of Y-chromosome (18 STR, haplogroups) and 27 autosomal STR demonstrate validity of specific approach for developing reference data bases for megalopolises by different DNA-markers, mediated by individual dynamics in generations. Obtained results support necessity of developing separate data bases for each megalopolis for DNA-identification and their timely update depending on gene pool dynamics in generations under action of migration.

мегаполисмиграциягенофонддинамикаSTRгаплотипыгаплогруппыY-хромосомареферентные базы данныхmegalopolismigrationgene pooldynamicsSTRhaplotypesY-chromosomehaplogroupsreference databaseИсследование проведено в рамках темы государственного задания ИОГен РАН: «Изучение генетического полиморфизма клетки, организма и популяции для разработки новых генетических технологий».The research was carried out within the framework of the N.I. Vavilov Institute of General Genetics, RAS State task: «The study of genetic polymorphism of cell, organism and population for development new genetic technologies».ReferencesКурбатова О.Л., Янковский Н.К. Миграция – основной фактор популяционной динамики городского населения России. Генетика. 2016;52(7):831–851.Kurbatova O.L., Yankovsky N.K. Migration as the main factor of the Russia’s urban population dynamics. Russ J Genet. 2016; 52(7): 726–745.Курбатова О.Л., Грачева А.С., Победоносцева Е.Ю., Удина И.Г. Генетико-демографические параметры населения Москвы. Миграционные процессы. Генетика. 2021;57(12):1438–1449.Kurbatova O.L., Gracheva A.S., Pobedonostseva E.Y., Udina I.G. et al. Genetic Demography of the Populatio of Moscow: Migration Processes. Russ J Genet.2021; 57(12): 1443–1453.Курбатова О.Л., Удина И.Г., Грачева А.С., и др. Генетико-демографические параметры населения г. Санкт-Петербурга. Миграционные процессы. Генетика. 2019;55(9): 1071-1082.Kurbatova O.L., Udina I.G., Gracheva A.S. et al. Genetic Demography of the Population of St. Petersburg: Migration Processes. Russ J Genet. 2019; 55(9):1119–1129.Курбатова О.Л., Удина И.Г., Грачева А.С. и др. Генетико-демографические параметры населения г. Новосибирска. Генетика. 2018;54(13):S74-84.Kurbatova O.L., Udina I.G., Gracheva A.S., et al. Genetikodemograficheskiye parametry naseleniya g. Novosibirska [Geneticdemographic parameters of the Novosibirsk population]. Genetika [Genetics]. 2018;54(13):74-84. (In Russ.)Грачева А.С., Победоносцева Е.Ю., Удина И.Г., Курбатова О.Л. Территориальная подразделенность популяции мегаполиса по этническому признаку в связи с проблемой создания генетических баз данных. Москва. Генетика. 2020; 54(12):1453-1463.Gracheva A.S., Pobedonostseva E.Y., Udina I.G. et al. Territorial Subdivision of the Megalopolis Population by the Ethnic Trait in Relation to the Problem of Creating Genetic Databases: Moscow. Russ J Genet. 2020; 56(12):1520–1529.Грачева А.С., Победоносцева Е.Ю., Удина И.Г., Курбатова О.Л. Территориальная подразделенность популяции мегаполиса по этническому признаку в связи с проблемой создания генетических баз данных. Санкт-Петербург. Генетика. 2019; 55(12):1442- 1450.Gracheva A.S., Pobedonostseva E.Y., Udina I.G. et al. Territorial Subdivision of the Megalopolis Population by the Ethnic Trait in Relation to the Problem of Creating Genetic Databases. St. Petersburg. Russ J Genet. 2019; 55(12):1536–1544.Грачева А.С., Победоносцева Е.Ю., Удина И.Г., Курбатова О.Л. Территориальная подразделенность популяции мегаполиса по этническому признаку в связи с проблемой создания генетических баз данных. Новосибирск. Генетика. 2018;54(13): 85-90.Gracheva A.S., Pobedonostseva E.Yu., Udina I.G., Kurbatova O.L. Territorial subdivision of the megalopolis population by the ethnic traitin relation to the problem of creating genetic databases. Novosibirsk. Genetika [Genetics]. 2018;54(13): 85-90. (In Russ.)Удина И.Г., Грачева А.С., Курбатова О.Л. Частоты гаплогрупп Y-хромосомы и процессы миграции в трех поколениях жителей Москвы. Генетика. 2022;58(11):1325–1333.Udina I.G., Gracheva A.S., Kurbatova O.L. Frequencies of Y-Chromosome Haplogroups and Migration Processes in Three Generations of Moscow Residents. Russ J Genet. 2022; 58(11): 1365–1372.Удина И.Г., Грачева А.С., Боринская С.А, Курбатова О.Л. Особенности распространения гаплогрупп Y-хромосомы в населении Санкт-Петербурга в связи с проблемой создания референтных баз данных. Генетика. 2023;59(11):1319–1325.Udina I.G., Gracheva A.S., Borinskaya S.A., Kurbatova O.L. Distribution Peculiarities of Y-Chromosome Haplogroups in the Population of St. Petersburg in Connection with the Problem of Creation of Reference Databases. Russ J Genet. 2023; 59(11): 1216– 1221.Athey T.W. Haplogroup prediction from Y-STR values using a Bayesian allele frequency approach. J. Genet. Geneal. 2006;2: 34–39.Athey T.W. Haplogroup prediction from Y-STR values using a Bayesian allele frequency approach. J. Genet. Geneal. 2006;2: 34–39.Meza García L.A. Evolutionary Bioinformatics Online 2005:1 47-50 47 Arlequin (version 3.0): An integrated software package for population genetics data analysis. (URL: http://cmpg.unibe.ch/software/arlequin35)Meza García L.A. Evolutionary Bioinformatics Online 2005:1 47-50 47 Arlequin (version 3.0): An integrated software package for population genetics data analysis. (URL: http://cmpg.unibe.ch/software/arlequin35)

The authors declare that there are no conflicts of interest present.