Метилирование генов матриксных металлопротеиназ и их ингибиторов в норме и при раке молочной железы

Матриксные металлопротеиназы и их ингибиторы вносят значительный вклад в регуляцию межклеточных взаимодействий и, как следствие, в поддержание структуры ткани и ее надлежащего функционирования. В работе изучено метилирование промоторных областей 11 генов матриксных металлопротеиназ ( MMP2, MMP11, MMP14, MMP15, MMP16, MMP17, MMP21, MMP23В, MMP24, MMP25, MMP28 ), а также 4 генов ингибиторов матриксных металлопротеиназ ( TIMP1, TIMP2, TIMP3, TIMP4 ). Коллективно представители этих семейств участвуют в регуляции деградации белков матрикса, сигнальной трансдукции, процессов адгезии и миграции, клеточной дифференцировки, ангиогенеза и апоптоза. Частоты аномального метилирования промоторных областей генов MMP2, MMP23B, MMP24, MMP25, MMP28 при раке молочной железы составили 7,7%, 17%, 11,9%, 15,4% и 4,9% соответственно. Установлено, что промоторные регионы генов TIMP1, TIMP4, MMP14 MMP21 конститутивно метилированы в тканях молочной железы.

внеклеточный матрикс, матриксные металлопротеиназы, ингибиторы матриксных металлопротеиназ, метилирование ДНК, extracellular matrix, matrix metalloproteinases, inhibitors of matrix metalloproteinases, DNA methylation

1. Visse R, Nagase H. Matrix metalloproteinases and tissue inhibitors of metalloproteinases: structure, function, and biochemistry. Circ Res. 2003 May 2; 92(8):827-839.

2. Shuman Moss L.A, Jensen-Taubman S.,Stetler-Stevenson W.G. Matrix Metalloproteinases. Changing Roles in Tumor Progression and Metastasis. Am J Pathol. 2012 Dec; 181(6): 1895-1899.

3. Стрельников В.В., Танас А.С., Руденко В.В., Кузнецова Е.Б., Залетаев Д.В. Геномный анализ метилирования ДНК с использованием секвенирования нового поколения // Медицинская генетика. 2014; 13(3): 32-37.

4. Танас А.С., Кузнецова Е.Б., Борисова М.Э., Руденко В.В., Залетаев Д.В., Стрельников В.В. Дизайн метода бисульфитного секвенирования ограниченных наборов геномных локусов (RRBS) для анализа метилирования CpG-островков человека в больших выборках // Молекулярная биология. 2015; 49(4): 689-699.

5. Tanas A.S., Borisova M.E., Kuznetsova E.B., Rudenko V.V., Karandasheva K.O., Nemtsova M.V., Izhevskaya V.L., Simonova O.A., Larin S.S., Zaletaev D.V., Strelnikov V.V. Rapid and Affordable Genome-Wide Bisulfite DNA Sequencing by XmaI-reduced Representation Bisulfite Sequencing // Epigenomics. 2017; 9(6): 833-847.

6. Hegedus L., Cho H., Xie X., Eliceiri G.L. Additional MDA-MB-231 breast cancer cell matrix metalloproteinases promote invasiveness. J Cell Physiol. 2008 Aug; 216(2):480-485.

7. Benson C.S., Babu S.D., Radhakrishna S. et al. Expression of matrix metalloproteinases in human breast cancer tissues. Dis Markers. 2013;34(6):395-405.

8. Luo Y.P., Zhong M., Wang L.P. et al. Inhibitory effects of RNA interference on MMP-24 expression and invasiveness of ovarian cancer SKOV(3) cells. Nan Fang Yi Ke Da Xue Xue Bao. 2009 Apr; 29(4):781-784.

9. Velasco G., Cal S., Merlos-Suаrez A. et al. Human MT6-matrix metalloproteinase: identification, progelatinase A activation, and expression in brain tumors. Cancer Res. 2000 Feb 15; 60(4):877-82.

10. Riddick A., Shukla C., Pennington C. et al. Identification of degradome components associated with prostate cancer progression by expression analysis of human prostatic tissues. Br J Cancer. 2005 Jun 20; 92(12): 2171-2180.

11. Sohail A., Sun Q., Zhao H., Bernardo M.M. et al. MT4-(MMP17) and MT6-MMP (MMP25), A unique set of membrane-anchored matrix metalloproteinases: properties and expression in cancer. Cancer Metastasis Rev. 2008 Jun; 27(2):289-302.