Оценка частот носительства вариантов в генах, связанных с аутосомно-рецессивными заболеваниями, для формирования списка генов расширенного скрининга носителей

Для расширенного скрининга носительства (РСН) патогенных вариантов (ПВ) в генах, связанных с аутосомно-рецессивными заболеваниями (АРЗ), ACMG был предложен подход, учитывающий, как тяжесть заболеваний, так и частоты носительства ПВ в генах, связанных с АРЗ. Цель – оценка частоты носительства ПВ в генах, связанных с АРЗ и не включенных в рекомендации ACMG, в российской популяции. Была проведена оценка частоты носительства ПВ в 303 кандидатных генах в выборке пациентов НМИЦ ТПМ (n=1126). Для генов с частотой носительства ПВ, превышающей пороговое значение 0,005, проводилась оценка с помощью Базы данных популяционных частот генетических вариантов населения Российской Федерации». Частота носительства ПВ в гене SBDS (частота носительства=0,01171; p_adj < 0,001), связанном с синдромом Швахмана–Даймонда, и в гене ALOX12B, связанном с аутосомно-рецессивным врожденным ихтиозом (частота носительства=0,005845; p_adj < 0,001) в РФ превысила пороговое значение. Эти гены могут быть рассмотрены в качестве кандидатных для РСН в российских популяциях.

1. Gregg A.R., Aarabi M., Klugman S., et al. Screening for autosomal recessive and X-linked conditions during pregnancy and preconception: a practice resource of the American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG). Genetics in medicine. 2021;23(10):1793-1806.

2. База данных популяционных частот генетических вариантов населения Российской Федерации. ФМБА России. Версия приложения 1.1.3 от 17.03.2025. Версия базы 59.1 от 03.10.2024. https://gdbpop.nir.cspfmba.ru/

3. Guo M.H., Gregg A.R. Estimating yields of prenatal carrier screening and implications for design of expanded carrier screening panels. Genetics in Medicine. 2019;21(9):1940-1947.