Разнонаправленная корреляция метилирования ДНК в различных регионах гена CARMN (MIR143HG) с экспрессией микроРНК кластера miR-143/145 в атеросклеротических бляшках сонных артерий

При нарушении стабильности атеросклеротических бляшек (АСБ) сонных артерий отмечают изменение экспрессии микроРНК кластера miR-143/145. В некоторых тканях экспрессию кластера miR-143/145 регулирует изменение уровня метилирования промотора гена-хозяина CARMN (он же MIR143HG), однако возможно влияние метилирования в промоторах генов MIR143 и MIR145, приходящихся на «тело» гена CARMN. Как правило, для уровней экспрессии генов и метилирования в их промоторных регионах отмечается отрицательная корреляция. Целью работы был анализ связи экспрессии кластера микроРНК miR-143/145 с уровнем метилирования CpG-сайтов в гене CARMN в АСБ. ДНК и микроРНК для анализа выделены из АСБ пациентов с клинически выраженным атеросклерозом сонных артерий (n=14). Анализ метилирования ДНК проведен на метилочипе, экспрессии микроРНК – методом microRNA-seq. Выявлена обратная корреляция экспрессии miR-145-3p и miR-143-3p с метилированием cg01726320, cg01558401 и cg26585864 в промоторе CARMN и прямая – с метилированием cg04317047, cg16684117 и cg21242144 в «теле» гена CARMN и в промоторах MIR143 и MIR145. Полученные результаты говорят о важной роли метилирования промотора генахозяина CARMN в регуляции экспрессии кластера miR-143/145 при атеросклеротическом поражении сонных артерий.

1. Королёва Ю.А., Назаренко М.С., Кучер А.Н. Роль микроРНК в формировании нестабильности атеросклеротической бляшки. Биохимия. 2018; 83(1): 34-46.

2. Riches K., Alshanwani A.R., Warburton P., et al. Elevated expression levels of miR-143/5 in saphenous vein smooth muscle cells from patients with Type 2 diabetes drive persistent changes in phenotype and function. J Mol Cell Cardiol. 2014; 74(100): 240-250.

3. Ehrlich K.C., Lacey M., Ehrlich M. Tissue-specific epigenetics of atherosclerosis-related ANGPT and ANGPTL genes. Epigenomics. 2019; 11(2): 169-186.

4. Huan T., Mendelson M., Joehanes R., et al. Epigenome-wide association study of DNA methylation and microRNA expression highlights novel pathways for human complex traits. Epigenetics. 2020; 15(1-2): 183-198.

5. Deng J., Shoemaker R., Xie B., et al. Targeted bisulfite sequencing reveals changes in DNA methylation associated with nuclear reprogramming. Nat Biotechnol. 2009; 27(4): 353-360.