Итоги программы расширенного генотипирования пациентов c подозрением на муковисцидоз

У 632 пациентов со всей территории РФ с подозрением на МВ был проведен поиск мутаций в гене CFTR. Тестирование проводилось в три этапа: поиск частых мутаций, секвенирование и поиск крупных делеций/дупликаций в гене CFTR. Молекулярно-генетическая причина заболевания выявлена у 372 (58,8%) пробандов. У 243 из них на первом этапе тестирования. Высокая эффективность используемой системы поиска частых мутаций подтверждается также и тем фактом, что у 357 (96%) больных хотя бы один вариант был выявлен с помощью системы поиска частых мутаций. Однако при секвенировании и поиске крупных перестроек были выявлены патогенные варианты, встречающиеся с более высокой частотой, чем варианты в системе регистрации частых мутаций, что говорит о необходимости расширения данной системы. Уточнение и расширение спектра генетических вариантов, приводящих к МВ, дает возможность совершенствовать диагностическую систему, используемую для тестирования первого уровня при подозрении на МВ, тем самым сокращая время и материальные затраты на постановку молекулярно-генетического диагноза и получение персонифицированной терапии.

1. De Boeck K., Wilschanski M., Castellani C., et al. Cystic fibrosis: terminology and diagnostic algorithms. Thorax. 2006;61(7):627-635. doi:10.1136/thx.2005.043539.

2. Thakur S., Ankita., Dash S., et al. Understanding CFTR Functionality: A Comprehensive Review of Tests and Modulator Therapy in Cystic Fibrosis. Cell Biochem Biophys. 2024;82(1):15-34. doi:10.1007/s12013-023-01200-w

3. https://portal.biobase-international.com/hgmd/pro/all.php

4. Рыжкова О.П., Кардымон О.Л., Прохорчук Е.Б., Коновалов Ф.А. с соавт. Руководство по интерпретации данных последовательности ДНК человека, полученных методами массового параллельного секвенирования (MPS) (редакция 2018, версия 2). Медицинская генетика 2019; 18(2): 3-23, DOI: 10.25557/2073-7998.2019.02.3-23.

5. Matsui H., Grubb B.R., Tarran R., et al. Evidence for periciliary liquid layer depletion, not abnormal ion composition, in the pathogenesis of cystic fibrosis airways disease. Cell. 1998;95(7):1005-1015. doi:10.1016/s0092-8674(00)81724-9

6. Jalalirad M., Houshmand M., Mirfakhraie R., Goharbari M.H., Mirzajani F. First study of CF mutations in the CFTR gene of Iranian patients: detection of DeltaF508, G542X, W1282X, A120T, R117H, and R347H mutations. J Trop Pediatr. 2004;50(6):359-361. doi:10.1093/tropej/50.6.359

7. Степанова А.А., Красовский С.А., Поляков А.В. Информативность поиска 19 частых мутаций в гене CFTR у российских больных муковисцидозом и расчетная частота заболевания в Российской Федерации. Генетика. 2016;52(2):231. DOI: 10.7868/ S0016675816010136

8. Petrova N.V., Kashirskaya N.Y., Vasilyeva T.A., et al. Analysis of CFTR Mutation Spectrum in Ethnic Russian Cystic Fibrosis Patients. Genes (Basel). 2020;11(5):554. doi:10.3390/genes11050554