STR-маркеры хромосом, несущих мутации F508del и CFTRdele2,3(21kb) гена CFTR

Мутация F508del является самой распространенной мутацией гена CFTR во всем мире и чаще других исследуется в пренатальной и преимплантационной диагностике муковисцидоза. CFTRdele2,3(21kb) - вторая по частоте мутация в России. Исследование STR-маркеров, сцепленных с геном CFTR , в сочетании с анализом мутации может повысить достоверность результата исследования эмбриона или плода, при этом необходимо принимать во внимание особенности гаплотипа мутантных хромосом. В работе проведен анализ STR-маркеров 151 образцов ДНК у лиц из 17 семей с МВ и 14 семей без МВ; гаплотипированы 136 нормальных неродственных хромосом, 32 хромосомы с мутацией F508del и 7 хромосом с мутацией CFTRdele2,3(21kb); проанализировано 106 мейозов. Рекомбинаций или мутаций не отмечено. Установлено, что мутантные хромосомы мало полиморфны по внутригенным маркерам. Внегенные STR-маркеры позволяют лучше, чем внутригенные индивидуализировать мутантные хромосомы, в том числе, для выявления контаминации. Частота аллелей микросателлитных полиморфных локусов интронов 1, 6a, 8 и 17b соответствовала распределению для европеоидов. Получены новые данные по уровню гетерозиготности, аллельной структуре нормальных хромосом и хромосом с мутациями F508del и CFTRdele2,3(21kb) для маркеров D7S486, D7S655 и D7S677.

CFTR, муковисцидоз, F508del, CFTRdele2, 3(21kb), STR-маркеры, IVS1, IVS6a, IVS8, IVS17b, D7S486, D7S655, D7S677, CFTR, Cystic fibrosis, F508del, CFTRdele2, 3(21kb), STR markers, IVS1, IVS6, IVS8, IVS17b, D7S486, D7S655, D7S677

1. Saleheen D, Frossard PM. The cradle of the DF508 mutation. Journal of Ayub Medical College, Abbottabad. 2008;20(4):157-160.

2. Петрова НВ, Кондратьева ЕИ, Красовский СА и др. Проект национального консенсуса «Муковисцидоз: определение, диагностические критерии и терапия». Раздел «Генетика муковисцидоза. Молекулярно-генетическая диагностика при муковисцидозе». Медицинская генетика. 2016;15(11): 29-43.

3. Berwouts S, Morris M, Girodon E et al. Mutation Nomenclature in Practice: Findings and Recommendations from the Cystic Fibrosis External Quality Assessment Scheme. Human Mutation. 2011;0:1-7.

4. Girardet A, Viart V, Plaza S et al. The improvement of the best practice guidelines for preimplantation genetic diagnosis of cystic fibrosis: toward an international consensus. European Journal of Human Genetics. 2016;24:469-478.

5. Cystic Fibrosis Mutation Database. http://www.genet.sickkids.on.ca/StatisticsPage.html

6. Иващенко ТЭ, Баранов ВС. Биохимические и молекулярно-генетические основы патогенеза муковисцидоза. Интермедика, Санкт-Петербург. 2002:256.

7. Корытина Г.Ф., Викторова Т.В., Иващенко Т.Э. и др. Анализ внутригенных полиморфных маркеров гена CFTR у больных муковисцидозом и здоровых доноров из Башкортостана. Генетика. 2003;39(11):1542-1549.

8. Петрова НВ Анализ четырех полиморфизмов в гене CFTR в семьях больных муковисцидозом. Медицинская генетика. 2006;5: 27-32.

9. Rechitsky S, Verlinsky O, Kuliev A. PGD for cystic fibrosis patients and couples at risk of an additional genetic disorder combined with 24-chromosome aneuploidy testing. Reproductive BioMedicine Online. 2013;26:420-430.

10. Mateu E, Calafell F, Dolors Ramos M et al. Can a Place of Origin of the Main Cystic Fibrosis Mutations Be Identified? American Journal of Human Genetics. 2002;70:257-264.

11. Dequeker E, Stuhrmann M, Morris M et al. Best practice guidelines for molecular genetic diagnosis of cystic fibrosis and CFTR-related disorders - updated European recommendations. European Journal of Human Genetics. 2008:1-15.

12. Winsor EJ, Akoury H, Chitayat D et al. The role of molecular microsatellite identity testing to detect sampling errors in prenatal diagnosis. Prenatal Diagnosis. 2010;30(8):746-52.

13. Hadi Fredj S, Ouali F, Siala H et al. Prenatal diagnosis of cystic fibrosis: 10-years experience. Pathologie Biologie. 2015;63(3):126-129.

14. Harton GL, De Rycke M, Fiorentino F et al: ESHRE PGD consortium best practice guidelines for amplification-based PGD. Human Reproduction. 2011;26:33-40.

15. de Araujo FG, Novaes FC, dos Santos NPC et al. Prevalence of DF508, G551D, G542X, and R553X mutations among cystic fibrosis patients in the North of Brazil. Brazilian Journal of Medical and Biological Research. 2005;38(1):11-15.

16. Маркова ЕВ, Татару ДА, Преда ОГ. Фрагментный анализ полиморфизма (TG)mTn интрона 8 гена CFTR. Медицинская генетика. 2017,16(1):11-19.

17. ALFRED. The ALlele FREquency Database. https://alfred.med.yale.edu/alfred/recordinfo.asp?condition=loci.locus_uid=’LO000194O#sites

18. Маркова ЕВ, Серебренникова ОА, Зотова НВ и др. Анализ мутаций гена CFTR у больных с различной патологией. Медицинская генетика. 2006;5:39-42.

19. Morral N, Nunes V, Casals T, Estivill X. CA/GT microsatellite alleles within the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) gene are not generated by unequal crossingover. Genomics.1991;10(3):692-698.