medgenМедицинская генетикаMedical Genetics2073-7998Publishing House «Genius Media» LLCmedgen-302Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯORIGINAL RESEARCHSTR-маркеры хромосом, несущих мутации F508del и CFTRdele2,3(21kb) гена CFTRSTR markers of chromosomes carrying F508del and CFTRdele2,3(21kb) mutations of CFTR geneМарковаЕ. В.MarkovaE. V.genlab.kcrm@mail.ruТатаруД. А.TataruD. A.noemail@neicon.ruКрасноярский центр репродуктивной медициныРоссияKrasnoyarsk Center for Reproductive MedicineRussian Federation201720022018166920Copyright © Маркова Е.В., Татару Д.А., 20182018Маркова Е.В., Татару Д.А.Markova E.V., Tataru D.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/302

Мутация F508del является самой распространенной мутацией гена CFTR во всем мире и чаще других исследуется в пренатальной и преимплантационной диагностике муковисцидоза. CFTRdele2,3(21kb) - вторая по частоте мутация в России. Исследование STR-маркеров, сцепленных с геном CFTR , в сочетании с анализом мутации может повысить достоверность результата исследования эмбриона или плода, при этом необходимо принимать во внимание особенности гаплотипа мутантных хромосом. В работе проведен анализ STR-маркеров 151 образцов ДНК у лиц из 17 семей с МВ и 14 семей без МВ; гаплотипированы 136 нормальных неродственных хромосом, 32 хромосомы с мутацией F508del и 7 хромосом с мутацией CFTRdele2,3(21kb); проанализировано 106 мейозов. Рекомбинаций или мутаций не отмечено. Установлено, что мутантные хромосомы мало полиморфны по внутригенным маркерам. Внегенные STR-маркеры позволяют лучше, чем внутригенные индивидуализировать мутантные хромосомы, в том числе, для выявления контаминации. Частота аллелей микросателлитных полиморфных локусов интронов 1, 6a, 8 и 17b соответствовала распределению для европеоидов. Получены новые данные по уровню гетерозиготности, аллельной структуре нормальных хромосом и хромосом с мутациями F508del и CFTRdele2,3(21kb) для маркеров D7S486, D7S655 и D7S677.

F508del is the major worldwide mutation of the CFTR gene and the main indication for prenatal and preimplantation diagnosis of cystic fibrosis (CF). The CFTRdele2,3(21kb) mutation is second frequent for the Russian Federation after F508del. STR markers linked with CFTR gene analysis in addition to the mutation detection can increase the accuracy of embryo and fetus evaluation results. Mutant chromosome haplotypes should be taken into account. We analyzed STR markers for 151 DNA samples from 17 CF families and 14 non CF families; haplotyped 136 normal unrelated chromosomes, 32 F508del-chromosomes and 7 CFTRdele2,3(21kb) chromosomes. There was no recombination or mutations for 106 meiosis. Our data revealed that mutant chromosome not enough polymorphic for intragenic markers. Extragenic STR markers allowed to individualize mutant chromosome better for contamination problem detection as well. Allele frequencies for polymorphic microsatellites of introns 1, 6a, 8 and 17b were consistent with Caucasian populations. We got new data for heterozygosity rate and allele structure of normal and F508del- and CFTRdele2,3(21kb)-chromosomes for D7S486, D7S655 and D7S677 markers.

CFTRмуковисцидозF508delCFTRdele23(21kb)STR-маркерыIVS1IVS6aIVS8IVS17bD7S486D7S655D7S677CFTRCystic fibrosisF508delCFTRdele23(21kb)STR markersIVS1IVS6IVS8IVS17bD7S486D7S655D7S677ReferencesSaleheen D, Frossard PM. The cradle of the DF508 mutation. Journal of Ayub Medical College, Abbottabad. 2008;20(4):157-160.Saleheen D, Frossard PM. The cradle of the DF508 mutation. Journal of Ayub Medical College, Abbottabad. 2008;20(4):157-160.Петрова НВ, Кондратьева ЕИ, Красовский СА и др. Проект национального консенсуса «Муковисцидоз: определение, диагностические критерии и терапия». Раздел «Генетика муковисцидоза. Молекулярно-генетическая диагностика при муковисцидозе». Медицинская генетика. 2016;15(11): 29-43.Петрова НВ, Кондратьева ЕИ, Красовский СА и др. Проект национального консенсуса «Муковисцидоз: определение, диагностические критерии и терапия». Раздел «Генетика муковисцидоза. Молекулярно-генетическая диагностика при муковисцидозе». Медицинская генетика. 2016;15(11): 29-43.Berwouts S, Morris M, Girodon E et al. Mutation Nomenclature in Practice: Findings and Recommendations from the Cystic Fibrosis External Quality Assessment Scheme. Human Mutation. 2011;0:1-7.Berwouts S, Morris M, Girodon E et al. Mutation Nomenclature in Practice: Findings and Recommendations from the Cystic Fibrosis External Quality Assessment Scheme. Human Mutation. 2011;0:1-7.Girardet A, Viart V, Plaza S et al. The improvement of the best practice guidelines for preimplantation genetic diagnosis of cystic fibrosis: toward an international consensus. European Journal of Human Genetics. 2016;24:469-478.Girardet A, Viart V, Plaza S et al. The improvement of the best practice guidelines for preimplantation genetic diagnosis of cystic fibrosis: toward an international consensus. European Journal of Human Genetics. 2016;24:469-478.Cystic Fibrosis Mutation Database. http://www.genet.sickkids.on.ca/StatisticsPage.htmlCystic Fibrosis Mutation Database. http://www.genet.sickkids.on.ca/StatisticsPage.htmlИващенко ТЭ, Баранов ВС. Биохимические и молекулярно-генетические основы патогенеза муковисцидоза. Интермедика, Санкт-Петербург. 2002:256.Иващенко ТЭ, Баранов ВС. Биохимические и молекулярно-генетические основы патогенеза муковисцидоза. Интермедика, Санкт-Петербург. 2002:256.Корытина Г.Ф., Викторова Т.В., Иващенко Т.Э. и др. Анализ внутригенных полиморфных маркеров гена CFTR у больных муковисцидозом и здоровых доноров из Башкортостана. Генетика. 2003;39(11):1542-1549.Корытина Г.Ф., Викторова Т.В., Иващенко Т.Э. и др. Анализ внутригенных полиморфных маркеров гена CFTR у больных муковисцидозом и здоровых доноров из Башкортостана. Генетика. 2003;39(11):1542-1549.Петрова НВ Анализ четырех полиморфизмов в гене CFTR в семьях больных муковисцидозом. Медицинская генетика. 2006;5: 27-32.Петрова НВ Анализ четырех полиморфизмов в гене CFTR в семьях больных муковисцидозом. Медицинская генетика. 2006;5: 27-32.Rechitsky S, Verlinsky O, Kuliev A. PGD for cystic fibrosis patients and couples at risk of an additional genetic disorder combined with 24-chromosome aneuploidy testing. Reproductive BioMedicine Online. 2013;26:420-430.Rechitsky S, Verlinsky O, Kuliev A. PGD for cystic fibrosis patients and couples at risk of an additional genetic disorder combined with 24-chromosome aneuploidy testing. Reproductive BioMedicine Online. 2013;26:420-430.Mateu E, Calafell F, Dolors Ramos M et al. Can a Place of Origin of the Main Cystic Fibrosis Mutations Be Identified? American Journal of Human Genetics. 2002;70:257-264.Mateu E, Calafell F, Dolors Ramos M et al. Can a Place of Origin of the Main Cystic Fibrosis Mutations Be Identified? American Journal of Human Genetics. 2002;70:257-264.Dequeker E, Stuhrmann M, Morris M et al. Best practice guidelines for molecular genetic diagnosis of cystic fibrosis and CFTR-related disorders - updated European recommendations. European Journal of Human Genetics. 2008:1-15.Dequeker E, Stuhrmann M, Morris M et al. Best practice guidelines for molecular genetic diagnosis of cystic fibrosis and CFTR-related disorders - updated European recommendations. European Journal of Human Genetics. 2008:1-15.Winsor EJ, Akoury H, Chitayat D et al. The role of molecular microsatellite identity testing to detect sampling errors in prenatal diagnosis. Prenatal Diagnosis. 2010;30(8):746-52.Winsor EJ, Akoury H, Chitayat D et al. The role of molecular microsatellite identity testing to detect sampling errors in prenatal diagnosis. Prenatal Diagnosis. 2010;30(8):746-52.Hadi Fredj S, Ouali F, Siala H et al. Prenatal diagnosis of cystic fibrosis: 10-years experience. Pathologie Biologie. 2015;63(3):126-129.Hadi Fredj S, Ouali F, Siala H et al. Prenatal diagnosis of cystic fibrosis: 10-years experience. Pathologie Biologie. 2015;63(3):126-129.Harton GL, De Rycke M, Fiorentino F et al: ESHRE PGD consortium best practice guidelines for amplification-based PGD. Human Reproduction. 2011;26:33-40.Harton GL, De Rycke M, Fiorentino F et al: ESHRE PGD consortium best practice guidelines for amplification-based PGD. Human Reproduction. 2011;26:33-40.de Araujo FG, Novaes FC, dos Santos NPC et al. Prevalence of DF508, G551D, G542X, and R553X mutations among cystic fibrosis patients in the North of Brazil. Brazilian Journal of Medical and Biological Research. 2005;38(1):11-15.de Araujo FG, Novaes FC, dos Santos NPC et al. Prevalence of DF508, G551D, G542X, and R553X mutations among cystic fibrosis patients in the North of Brazil. Brazilian Journal of Medical and Biological Research. 2005;38(1):11-15.Маркова ЕВ, Татару ДА, Преда ОГ. Фрагментный анализ полиморфизма (TG)mTn интрона 8 гена CFTR. Медицинская генетика. 2017,16(1):11-19.Маркова ЕВ, Татару ДА, Преда ОГ. Фрагментный анализ полиморфизма (TG)mTn интрона 8 гена CFTR. Медицинская генетика. 2017,16(1):11-19.ALFRED. The ALlele FREquency Database. https://alfred.med.yale.edu/alfred/recordinfo.asp?condition=loci.locus_uid=’LO000194O#sitesALFRED. The ALlele FREquency Database. https://alfred.med.yale.edu/alfred/recordinfo.asp?condition=loci.locus_uid=’LO000194O#sitesМаркова ЕВ, Серебренникова ОА, Зотова НВ и др. Анализ мутаций гена CFTR у больных с различной патологией. Медицинская генетика. 2006;5:39-42.Маркова ЕВ, Серебренникова ОА, Зотова НВ и др. Анализ мутаций гена CFTR у больных с различной патологией. Медицинская генетика. 2006;5:39-42.Morral N, Nunes V, Casals T, Estivill X. CA/GT microsatellite alleles within the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) gene are not generated by unequal crossingover. Genomics.1991;10(3):692-698.Morral N, Nunes V, Casals T, Estivill X. CA/GT microsatellite alleles within the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) gene are not generated by unequal crossingover. Genomics.1991;10(3):692-698.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.