Анализ генофенотипических связей в популяционных исследованиях

Работа выполнена на репрезентативных выборках ойратов из 14 популяций на территории РФ, Киргизии, Монголии, собранных в 2013–2017 гг. Материалом для изучения генофонда ойратов послужила кровь 454 мужчин, 80 образцов были прогенотипированы с использованием наборов Illumina Omni Express v1.2. Выборка антропологического исследования составила 1057 человек (548 женщин и 509 мужчин). Для сопоставления данных генетического анализа и антропологического исследования были использованы межпопуляционные расстояния по всем изученным системам (генетическим, этноантропологическим, антропометрическим) и дальнейший расчет попарной близости матриц расстояний − многомерное обобщение квадратичного коэффициента корреляции Пирсона. Установлены генофенотипические связи между примененными генетическими системами и антропометрическими данными мужчин и женщин, что говорит об устойчивости этих связей. Мужские антропометрические данные сильнее коррелируют с генетическими системами, самую сильную связь показывают поперечные размеры (0,81; 0,71; 0,72), пропорции скелета (0,73; 0,75; 0,52), затем продольные (0,69; 0,62; 0,79) и обхватные размеры (0,66; 0,70; 0,69). Такие корреляции свидетельствуют о применимости антропометрических данных в популяционных исследованиях и предлагаются к введению в практику изучения генетического разнообразия народонаселения.

1. Balinova N., Post H., Kushniarevich A., et al. Y-Chromosomal analysis of clan structure of Kalmyks, the only European Mongol people, and their relationship to Oirat-Mongols of Inner Asia. European Journal of Human Genetics. 2019; 27(9): 1466-1474.

2. Balinova N., Hudjašov G., Pankratov V., et al. Gene pool preservation across time and space In Mongolian-speaking Oirats. Eur J Hum Genet. 2024; 32(9):1150-1158. doi: 10.1038/s41431-024-01588-w.

3. Хомякова И.А., Балинова Н.В. Антропологические особенности торгутов и дербетов Калмыкии и Западной Монголии: сравнительный анализ. Вестник Московского университета. Серия 23: Антропология. 2017; 1: 15-32.

4. Хомякова И.А., Балинова Н.В. Антропологические исследования в Республике Алтай: предварительный анализ морфологических особенностей северных и южных алтайцев. Вестник Московского университета. Серия 23: Антропология. 2017; 4: 28-41.

5. Хомякова И.А., Балинова Н.В. Антропологические исследования в Туве и Северной Монголии: тувинцы, тувинцы-тоджинцы, цаатаны. Вестник Московского университета. Серия 23: Антропология. 2017; 2: 12-25.

6. Kimura M. The neutral theory of molecular evolution: a review of recent evidence. Jpn J Genet. 1991;66: 367–386. doi:10.1266/jjg.66.367

7. Mahalanobis P. C. On the Generalized Distance in Statistics. Proceedings of the National Institute of Science of India. 1936;2: 49–55.

8. Danecek P., Auton A., Abecasis G., et al. The variant call format and VCFtools. Bioinformatics. 2011;27: 2156–2158. doi:10.1093/bioinformatics/btr330

9. Nei M. A New Measure of Genetic Distance. Genetic Distance. Boston, MA: Springer US; 1974; 63–76. doi:10.1007/978-1-4684-2139-2_6

10. Lê S., Josse J., Husson F. FactoMineR: An R Package for Multivariate Analysis. J Stat Softw. 2008;25: 1–18. doi:10.18637/jss.v025.i01