Семейный случай внутригенной микродупликации MBD5 (2q23.1)

Вариации числа копий участков ДНК (CNV) являются причиной интеллектуальных нарушений, расстройств аутистического спектра, синдрома дефицита внимания и гиперактивности, а также других поражений нервной системы. Те же самые патогенные CNV могут наследоваться от здоровых родителей, а также встречаются у внутриутробно погибших зародышей человека, поднимая вопрос о неполной пенетрантности и плейотропных свойствах некоторых вариаций. В данной работе мы сообщаем о случае моногенной микродупликации в регионе 2q23.1, содержащей ген MBD5, унаследованной от здорового отца, и рассматриваем возможную ассоциацию данной микроструктурной хромосомной аномалии не только с рождением больного ребенка в семье, но и с неразвивающейся беременностью у его матери.

1. Kashevarova A.A., Drozdov G.V., Fedotov D.A. et al. Pleiotropy of Copy Number Variation in Human Genome. Russ J Genet. 2022; 58 (10): 1180–1192. doi:10.1134/S1022795422100040

2. Kikas T., Punab A.M., Kasak L, et al. Microdeletions and microduplications linked to severe congenital disorders in infertile men. Sci Rep. 2023;13(1):574. doi:10.1038/s41598-023-27750-w

3. Jenabi E., Ayubi E., Bashirian S., et al. Association between previous abortion history and risk of autism spectrum disorders among offspring: a meta-analysis. Clin Exp Pediatr. 2023;66(2):70-75. doi:10.3345/cep.2022.00108

4. Wang H., Li F., Miao M., et al. Maternal spontaneous abortion and the risk of attention-deficit/hyperactivity disorder in offspring: a population-based cohort study. Hum Reprod. 2020;35(5):1211-1221. doi:10.1093/humrep/deaa035

5. Ji H., Yu Y., Miao M., et al. Risk of intellectual disability and maternal history of spontaneous abortion: a nationwide cohort study. Dev Med Child Neurol. 2021;63(7):831-838. doi:10.1111/dmcn.14839

6. Riggs E.R., Andersen E.F., Cherry A.M., et al. Technical standards for the interpretation and reporting of constitutional copy-number variants: a joint consensus recommendation of the American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG) and the Clinical Genome Resource (ClinGen). Genet Med. 2020;22(2):245-257. doi:10.1038/s41436-019-0686-8

7. Brandt T., Sack L.M., Arjona D., et al. Adapting ACMG/AMP sequence variant classification guidelines for single-gene copy number variants. Genet Med. 2020;22(2):336-344. doi:10.1038/s41436-019-0655-2

8. Лебедев И.Н., Шилова Н.В., Юров И.Ю. и др. Рекомендации Российского общества медицинских генетиков по хромосомному микроматричному анализу. Медицинская генетика. 2023;22(10):3-47. doi.org/10.25557/2073-7998.2023.10.3-47

9. Database of Genomic Variants (DGV). URL: https://dgv.tcag.ca/ (Accessed 18 Dec 2024).

10. Mapping the clinical genome (DECIPHER). URL: https://www.deciphergenomics.org/. (Accessed 18 Dec 2024)

11. Mullegama S.V., Rosenfeld J.A., Orellana C., et al. Reciprocal deletion and duplication at 2q23.1 indicates a role for MBD5 in autism spectrum disorder. Eur J Hum Genet. 2014;22(1):57-63. doi:10.1038/ejhg.2013.67

12. Bonnet C., Ali Khan A., Bresso E. et al. Extended spectrum of MBD5 mutations in neurodevelopmental disorders. Eur J Hum Genet. 2013;21(12):1457-1461. doi:10.1038/ejhg.2013.22

13. Myers K.A., Marini C., Carvill G.L., et al. Phenotypic Spectrum of Seizure Disorders in MBD5-Associated Neurodevelopmental Disorder. Neurol Genet. 2021;7(2):e579. doi:10.1212/NXG.0000000000000579

14. Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM). URL: https://omim.org/help/about (Accessed 18 Dec 2024)

15. Newman S., Hermetz K.E., Weckselblatt B., Rudd M.K. Next-generation sequencing of duplication CNVs reveals that most are tandem and some create fusion genes at breakpoints. Am J Hum Genet. 2015;96(2):208-220. doi:10.1016/j.ajhg.2014.12.017

16. Wang Y., Li Y., Chen Y., et al. Systematic analysis of copy-number variations associated with early pregnancy loss. Ultrasound Obstet Gynecol. 2020;55(1):96-104. doi:10.1002/uog.20412

17. Sheng Y.R., Hou S.Y., Hu W.T., et al. Characterization of Copy-Number Variations and Possible Candidate Genes in Recurrent Pregnancy Losses. Genes (Basel). 2021;12(2):141. doi:10.3390/genes12020141

18. Gu C., Li K., Li L., Gao H.., Li R, He Y. Genomic imbalance in euploid pregnancy loss. J Assist Reprod Genet. 2022;39(9):2115-2124. doi:10.1007/s10815-022-02527-8

19. Shao Y., Yang S., Cheng L., et al. Identification of chromosomal abnormalities in miscarriages by CNV-Seq. Mol Cytogenet. 2024;17(1):4. doi:10.1186/s13039-024-00671-7

20. Vasilyev S.A., Skryabin N.A., Kashevarova A.A., et al. Differential DNA Methylation of the IMMP2L Gene in Families with Maternally Inherited 7q31.1 Microdeletions is Associated with Intellectual Disability and Developmental Delay. Cytogenet Genome Res. 2021;161(3-4):105-119. doi:10.1159/000514491

21. Guo J., Zou Z., Dou X., et al. Zebrafish Mbd5 binds to RNA m5C and regulates histone deubiquitylation and gene expression in development metabolism and behavior. Nucleic Acids Res. 2024;52(8):4257-4275. doi:10.1093/nar/gkae093

22. Baymaz H.I., Fournier A., Laget S, et al. MBD5 and MBD6 interact with the human PR-DUB complex through their methyl-CpG-binding domain. Proteomics. 2014;14(19):2179-2189. doi:10.1002/pmic.201400013

23. Baldarelli R.M., Smith C.L., Ringwald M., et al. Mouse Genome Informatics: an integrated knowledgebase system for the laboratory mouse. Genetics. 2024;227(1):iyae031. doi:10.1093/genetics/iyae031

24. Mullegama S.V., Alaimo J.T., Chen L., Elsea S.H. Phenotypic and molecular convergence of 2q23.1 deletion syndrome with other neurodevelopmental syndromes associated with autism spectrum disorder. Int J Mol Sci. 2015;16(4):7627-7643. doi:10.3390/ijms16047627