Генетическое разнообразие и идентификационная информативность 43 аутосомных STR-маркеров в популяциях аварцев
https://doi.org/10.25557/2073-7998.2023.12.52-58
Аннотация
Проведена оценка уровня генетического разнообразия, вероятности дискриминации неродственных индивидов (PD, power of discrimination) и исключающей способности (PE, power of exclusion) 43 аутосомных STR (D3S1358, TH01, D12S391, D5S818, TPOX, D13S317, FGA, D22S1045, D18S51, D16S539, D8S1179, CSF1PO, D6S1043, vWA, D21S11, SE33, D10S1248, D1S1656, D19S433, D2S1338, D20S1082, D6S474, D12ATA63, D4S2666, D1S1677, D11S4463, D9S1122, D2S1776, D10S1435, D3S3053, D5S2500, D1S1627, D3S4529, D2S1360, D17S974, D3S1744, D9S2157, D17S1301, D8S1132, Penta D, D21S2050, D7S1517, Penta E) в популяциях аварцев из трех районов Дагестана: Шамильского, Тляратинского, Унцукульского. Полученные результаты показали, что для проведения генетической экспертизы в Дагестане, при выборе референсной группы, необходимо учитывать не только этническую принадлежность индивида, но и географическую локализацию.
Об авторах
К. В. Вагайцева
Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук, Научно-исследовательский институт медицинской генетики
Россия
Россия
634050, г. Томск, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10
Н. А. Колесников
Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук, Научно-исследовательский институт медицинской генетики
Россия
Россия
634050, г. Томск, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10
М. Д. Скалин
ФГБУН Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук
Россия
Россия
119991, ГСП-1, г. Москва, ул. Губкина, д. 3
В. Н. Харьков
Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук, Научно-исследовательский институт медицинской генетики
Россия
Россия
634050, г. Томск, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10
М. О. Раджабов
Институт физики им. Х.И. Амирханова - обособленное подразделение ФГБУН Дагестанского федерального исследовательского центра Российской академии наук
Россия
Россия
367015, г. Махачкала, ул. М. Ярагского, д. 94
В. А. Степанов
Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук, Научно-исследовательский институт медицинской генетики
Россия
Россия
634050, г. Томск, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10
Список литературы
1. Rohlfs R.V., Fullerton S.M., Weir B.S. Familial identification: population structure and relationship distinguishability. PLoS Genet. 2012; 8(2): e1002469.
2. Zvénigorosky V., Sabbagh A., Gonzalez A, Fausser J.L. et al. The limitations of kinship determinations using STR data in ill-defined populations. Int J Legal Med. 2020; 134(6): 1981-1990.
3. Булаева К. Б., Давудов О.М., Павлова Т.А. и др. Генетическая подразделенность этнических популяций Дагестана. Генетика. 2003; 39(1): 83-92.
4. Колесников Н.А., Харьков В.Н., Зарубин А.А., Раджабов М.О. и др. Особенности геномного распределения регионов высокой гомозиготности у коренного населения северной Евразии на индивидуальном и популяционном уровнях на основе анализа SNP высокой плотности. Генетика. 2021; 57(11): 1261-1275.
5. Колесников Н.А., Харьков В.Н., Раджабов М.О. и др. Различия по уровню инбридинга в популяциях Дагестана: анализ регионов высокой гомозиготности. Медицинская генетика. 2020; 19(7): 21-22.
6. Степанов В.А., Балановский О.П., Мельников А.В. и др. Характеристика популяций Российской Федерации по панели пятнадцати локусов, используемых для ДНК-идентификации и в судебно-медицинской экспертизе. Acta Naturae. 2011; 3(2): 59–71.
7. Excoffier L., Lischer H.E. L. Arlequin suite ver 3.5: A new series of programs to perform population genetics analyses under Linux and Windows. Molecular Ecology Resources. 2010; 10: 564-567.
8. Харьков В.Н., Котова С.А., Колесников Н.А. и др. Генетическое разнообразие 21 аутосомного STR-маркера системы CODIS в популяциях Восточной Европы. Генетика. 2021; 57(12):1396-1402.
Рецензия
Для цитирования:
Вагайцева К.В., Колесников Н.А., Скалин М.Д., Харьков В.Н., Раджабов М.О., Степанов В.А. Генетическое разнообразие и идентификационная информативность 43 аутосомных STR-маркеров в популяциях аварцев. Медицинская генетика. 2023;22(12):52-58. https://doi.org/10.25557/2073-7998.2023.12.52-58
For citation:
Vagaitseva K.V., Kolesnikov N.A., Skalin M.D., Kharkov V.N., Radzhabov M.O., Stepanov V.A. Genetic diversity and identification information content of 43 autosomal STR markers in Avarian populations. Medical Genetics. 2023;22(12):52-58. (In Russ.) https://doi.org/10.25557/2073-7998.2023.12.52-58
Просмотров:
386
Послать статью по эл. почте 