medgenМедицинская генетикаMedical Genetics2073-7998Publishing House «Genius Media» LLC10.25557/2073-7998.2023.12.52-58medgen-2387Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯORIGINAL RESEARCHГенетическое разнообразие и идентификационная информативность 43 аутосомных STR-маркеров в популяциях аварцевGenetic diversity and identification information content of 43 autosomal STR markers in Avarian populationsВагайцеваК. В.VagaitsevaK. V.

634050, г. Томск, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10

10, Naberejnaya Ushaiki, Tomsk, 634050

КолесниковН. А.KolesnikovN. A.

634050, г. Томск, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10

10, Naberejnaya Ushaiki, Tomsk, 634050

СкалинМ. Д.SkalinM. D.

119991, ГСП-1, г. Москва, ул. Губкина, д. 3

3, Gubkina st., Moscow, 119333

ХарьковВ. Н.KharkovV. N.

634050, г. Томск, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10

10, Naberejnaya Ushaiki, Tomsk, 634050

РаджабовМ. О.RadzhabovM. O.

367015, г. Махачкала, ул. М. Ярагского, д. 94

94, M. Yaragskogo st., Makhachkala, 367015

СтепановВ. А.StepanovV. A.

634050, г. Томск, ул. Набережная реки Ушайки, д. 10

10, Naberejnaya Ushaiki, Tomsk, 634050

Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук, Научно-исследовательский институт медицинской генетикиРоссияResearch Institute of Medical Genetics, Tomsk NRMCRussian FederationФГБУН Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наукРоссияVavilov Institute of General Genetics Russian Academy of SciencesRussian FederationИнститут физики им. Х.И. Амирханова - обособленное подразделение ФГБУН Дагестанского федерального исследовательского центра Российской академии наукРоссияInstitute of Physics. HI Amirkhanova Dagestan Scientific Center, Russian Academy of SciencesRussian Federation20232312202322125258Copyright © Вагайцева К.В., Колесников Н.А., Скалин М.Д., Харьков В.Н., Раджабов М.О., Степанов В.А., 20232023Вагайцева К.В., Колесников Н.А., Скалин М.Д., Харьков В.Н., Раджабов М.О., Степанов В.А.Vagaitseva K.V., Kolesnikov N.A., Skalin M.D., Kharkov V.N., Radzhabov M.O., Stepanov V.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/2387

Проведена оценка уровня генетического разнообразия, вероятности дискриминации неродственных индивидов (PD, power of discrimination) и исключающей способности (PE, power of exclusion) 43 аутосомных STR (D3S1358, TH01, D12S391, D5S818, TPOX, D13S317, FGA, D22S1045, D18S51, D16S539, D8S1179, CSF1PO, D6S1043, vWA, D21S11, SE33, D10S1248, D1S1656, D19S433, D2S1338, D20S1082, D6S474, D12ATA63, D4S2666, D1S1677, D11S4463, D9S1122, D2S1776, D10S1435, D3S3053, D5S2500, D1S1627, D3S4529, D2S1360, D17S974, D3S1744, D9S2157, D17S1301, D8S1132, Penta D, D21S2050, D7S1517, Penta E) в популяциях аварцев из трех районов Дагестана: Шамильского, Тляратинского, Унцукульского. Полученные результаты показали, что для проведения генетической экспертизы в Дагестане, при выборе референсной группы, необходимо учитывать не только этническую принадлежность индивида, но и географическую локализацию.

We assessed the level of genetic diversity, power of discrimination, power of exclusion of 43 autosomal STRs (D3S1358, TH01, D12S391, D5S818, TPOX, D13S317, FGA, D22S1045, D18S51, D16S539 , D8S1179, CSF1PO, D6S1043, vWA, D21S11, SE33, D10S1248, D1S1656, D19S433, D2S1338, D20S1082, D6S474, D12ATA63, D4S2666, D1S1677, D11S4463, D9S1 122, D2S1776, D10S1435, D3S3053, D5S2500, D1S1627, D3S4529, D2S1360, D17S974 , D3S1744, D9S2157, D17S1301, D8S1132, Penta D, D21S2050, D7S1517, Penta E) in Avar populations from three regions of Dagestan: Shamilsky district, Tlyaratinsky district, Untsukulsky district. The results emphasized the need to take into account the geographic origin of the individual, and not just his nationality, when choosing reference data during genetic examination in the populations of Dagestan.

ДНК-идентификацияпопуляционная генетикааутосомные STRгенетическая экспертизареференсная база данныхforensic geneticspopulation geneticsautosomal STRsreference databaseReferencesRohlfs R.V., Fullerton S.M., Weir B.S. Familial identification: population structure and relationship distinguishability. PLoS Genet. 2012; 8(2): e1002469.Rohlfs R.V., Fullerton S.M., Weir B.S. Familial identification: population structure and relationship distinguishability. PLoS Genet. 2012; 8(2): e1002469.Zvénigorosky V., Sabbagh A., Gonzalez A, Fausser J.L. et al. The limitations of kinship determinations using STR data in ill-defined populations. Int J Legal Med. 2020; 134(6): 1981-1990.Zvénigorosky V., Sabbagh A., Gonzalez A, Fausser J.L. et al. The limitations of kinship determinations using STR data in ill-defined populations. Int J Legal Med. 2020; 134(6): 1981-1990.Булаева К. Б., Давудов О.М., Павлова Т.А. и др. Генетическая подразделенность этнических популяций Дагестана. Генетика. 2003; 39(1): 83-92.Bulaeva K.B., Davudov O.M., Pavlova T.A., et al. Geneticheskaia podrazdelennost’ étnicheskikh populiatsiĭ Dagestana [Genetic subdivision of Dagestan ethnic populations]. Genetika. 2003;39(1):83-92. (In Russ.)Колесников Н.А., Харьков В.Н., Зарубин А.А., Раджабов М.О. и др. Особенности геномного распределения регионов высокой гомозиготности у коренного населения северной Евразии на индивидуальном и популяционном уровнях на основе анализа SNP высокой плотности. Генетика. 2021; 57(11): 1261-1275.Kolesnikov N.A., Kharkov V.N., Zarubin A.A., Radzhabov M.O., et al. Features of the Genomic Distribution of Runs of Homozygosity in the Indigenous Population of Northern Eurasia at the Individual and Population Levels Based on High Density SNP Analysis. Russian Journal of Genetics. 2021; 57(11): 1271-1284.Колесников Н.А., Харьков В.Н., Раджабов М.О. и др. Различия по уровню инбридинга в популяциях Дагестана: анализ регионов высокой гомозиготности. Медицинская генетика. 2020; 19(7): 21-22.Kolesnikov N.A., Kharkov V.N., Radzhabov M.O., et al. Razlichiya po urovnyu inbridinga v populyatsiyakh Dagestana: analiz regionov vysokoy gomozigotnostiyu [Differences in the level of inbreeding in populations of Dagestan: analysis of runs of homozygosity]. Meditsinskaya genetika [Medical Genetics]. 2020;19(7):21-22. (In Russ.).Степанов В.А., Балановский О.П., Мельников А.В. и др. Характеристика популяций Российской Федерации по панели пятнадцати локусов, используемых для ДНК-идентификации и в судебно-медицинской экспертизе. Acta Naturae. 2011; 3(2): 59–71.Stepanov V.A., Balanovsky O.P., Melnikov A.V., et al. Characteristics of Populations of the Russian Federation over the Panel of Fifteen Loci Used for DNA Identification and in Forensic Medical Examination. Acta Naturae. 2011;3(2):56-67.Excoffier L., Lischer H.E. L. Arlequin suite ver 3.5: A new series of programs to perform population genetics analyses under Linux and Windows. Molecular Ecology Resources. 2010; 10: 564-567.Excoffier L., Lischer H.E. L. Arlequin suite ver 3.5: A new series of programs to perform population genetics analyses under Linux and Windows. Molecular Ecology Resources. 2010; 10: 564-567.Харьков В.Н., Котова С.А., Колесников Н.А. и др. Генетическое разнообразие 21 аутосомного STR-маркера системы CODIS в популяциях Восточной Европы. Генетика. 2021; 57(12):1396-1402.Kharkov V. N., Kotova S. A., Kolesnikov N. A., et al. и др. Genetic Diversity of 21 Autosomic STR Markers of the CODIS System in Populations of Eastern Europe. Russian Journal of Genetics. 2021; 57(12):1408-1414.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.