Preview

Медицинская генетика

Расширенный поиск

Анализ уровня метилирования предполагаемого регуляторного региона гена MIR100 при атеросклерозе сонных артерий методом таргетного бисульфитного секвенирования

https://doi.org/10.25557/2073-7998.2023.01.43-46

Аннотация

   В нестабильных атеросклеротических бляшках сонных артерий усиливается экспрессия микроРНК miR-100, что может быть связано с вариабельностью метилирования CpG-сайтов гена MIR100 и его регуляторных регионов.

   Целью работы был анализ связи уровня метилирования ДНК предполагаемого регуляторного региона гена MIR100 (E-box) с клинически выраженным атеросклерозом сонных артерий методом таргетного бисульфитного секвенирования.

   В качестве материала использовались ткани сосудов и лейкоциты крови пациентов с клинически выраженным атеросклерозом сонных артерий (n = 19), а также лейкоциты периферической крови относительно здоровых индивидов (n = 18). В результате выявлена тканеспецифичность паттерна метилирования региона chr11:122,024,891-122,025,506 (сборка генома GRCh37/hg19), включающего E-box — уровень метилирования в непоражённых сонных артериях снижен по сравнению как с венами (p < 0,001), так и с лейкоцитами периферической крови (p < 0,007). При этом в атеросклеротических бляшках наблюдается значимое гипометилирование относительно непоражённых артерий, однако уровень метилирования ДНК в лейкоцитах крови пациентов с атеросклерозом не отличается от такового в лейкоцитах крови контрольной группы. Полученные результаты позволяют говорить о тканеспецифичности метилирования предполагаемого регуляторного региона гена MIR100 (E-box) и о возможной его связи с атеросклеротическим поражением артерий, однако метилирование исследуемого региона нельзя применять в качестве диагностического биомаркера атеросклероза.

Об авторах

Ю. А. Королёва
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия

634050

ул. Набережная р. Ушайки, д. 10

Томск



А. А. Зарубин
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия

634050

ул. Набережная р. Ушайки, д. 10

Томск



Н. П. Бабушкина
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия

634050

ул. Набережная р. Ушайки, д. 10

Томск



Д. Е. Гомбоева
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия

634050

ул. Набережная р. Ушайки, д. 10

Томск



Э. Ф. Муслимова
Научно-исследовательский институт кардиологии, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия

634012

ул. Киевская, д. 111 а

Томск



М. С. Кузнецов
Научно-исследовательский институт кардиологии, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия

634012

ул. Киевская, д. 111 а

Томск



Б. Н. Козлов
Научно-исследовательский институт кардиологии, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия

634012

ул. Киевская, д. 111 а

Томск



М. С. Назаренко
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия

634050

ул. Набережная р. Ушайки, д. 10

Томск



Список литературы

1. Cipollone F., Felicioni L., Sarzani R. et al. A unique microRNA signature associated with plaque instability in humans. Stroke.2011; 42 (9): 2556-2563.

2. Maitrias P., Metzinger-Le Meuth V., Massy Z. A. et al. MicroRNA deregulation in symptomatic carotid plaque. Journal of vascular surgery.2015; 62 (5); 1245-1250.e1.

3. Morales S., Monzo M., Navarro A. Epigenetic regulation mechanisms of microRNA expression. Biomolecular concepts. 2017; 8 (5-6); 203-212.

4. Chen D., Sun Y., Yuan Y. et al. miR-100 induces epithelial-mesen-chymal transition but suppresses tumorigenesis, migration and invasion. PLoS genetics. 2014; 10 (2); e1004177.


Рецензия

Для цитирования:


Королёва Ю.А., Зарубин А.А., Бабушкина Н.П., Гомбоева Д.Е., Муслимова Э.Ф., Кузнецов М.С., Козлов Б.Н., Назаренко М.С. Анализ уровня метилирования предполагаемого регуляторного региона гена MIR100 при атеросклерозе сонных артерий методом таргетного бисульфитного секвенирования. Медицинская генетика. 2023;22(1):43-46. https://doi.org/10.25557/2073-7998.2023.01.43-46

For citation:


Koroleva I.A., Zarubin A.A., Babushkina N.P., Gomboeva D.E., Muslimova E.F., Kuznetsov M.S., Kozlov B.N., Nazarenko M.S. Methylation level analysis of putative regulatory region of MIR100 gene in carotid atherosclerosis by targeted bisulfite sequencing. Medical Genetics. 2023;22(1):43-46. (In Russ.) https://doi.org/10.25557/2073-7998.2023.01.43-46

Просмотров: 257


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2073-7998 (Print)