Оценка патогенности дупликаций, выявленных при микроматричном анализе, на примере двух пациентов с картиной мышечной дистрофии Дюшенна
https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.12.56-59
Аннотация
Внутригенные делеции и дупликации представляют собой серьезную проблему при оценке результатов хромосомного микроматричного анализа у пациентов с подозрением на моногенное заболевание. Оценка клинической значимости и каузативности таких генетических вариантов, особенно протяженных дупликаций, затруднена, поскольку CNV, затрагивающие один или несколько экзонов гена, могут иметь различные фенотипические эффекты. В статье представлены результаты обследования двух пациентов с направительным диагнозом мышечная дистрофия. У обоих пациентов при проведении хромосомного микроматричного анализа диагностированы внутригенные дупликации в гене DMD. В работе обсуждаются особенности интерпретации таких CNV и предлагаются рекомендации для окончательной постановки генетического диагноза.
Об авторах
Ж. Г. Маркова
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова
Россия
Россия
М. Е. Миньженкова
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова
Россия
Россия
И. В. Шаркова
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова
Россия
Россия
М. С. Петухова
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова
Россия
Россия
Н. В. Шилова
ФГБНУ «Медико-генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова
Россия
Россия
Список литературы
1. Waggoner D., Wain K.E., Dubuc A.M., Conlin L., Hickey S.E., Lamb A.N., Martin C.L., Morton C.C., Rasmussen K., Schuette J.L., Schwartz S., Miller D.T.; ACMG Professional Practice and Guidelines Committee. Yield of additional genetic testing after chromosomal microarray for diagnosis of neurodevelopmental disability and congenital anomalies: a clinical practice resource of the American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG). Genet Med. 2018;20(10):1105-1113. doi: 10.1038/s41436-018-0040-6
2. Aartsma-Rus A., den Dunnen J.T. Phenotype predictions for exon deletions/duplications: A user guide for professionals and clinicians using Becker and Duchenne muscular dystrophy as examples. Hum Mutat. 2019;40(10):1630-1633. doi: 10.1002/humu.23850. Muntoni F., Torelli S., Ferlini A. Dystrophin and mutations: one gene, several proteins, multiple phenotypes. Lancet Neurol 2003; 2: 731-40. doi: 10.1016/S1474-4422(03)00585-4
3. Baskin B., Stavropoulos D.J., Rebeiro P.A., Orr J., Li M., Steele L., Marshall C.R., Lemire E.G., Boycott K.M., Gibson W., Ray P.N.Complex genomic rearrangements in the dystrophin gene due to replication-based mechanisms. Mol Genet Genomic Med. 2014;2(6):539-47. doi: 10.1002/mgg3.108
4. del Gaudio D., Yang Y., Boggs B.A., Schmitt E.S., Lee J.A., Sahoo T., Pham H.T., Wiszniewska J., Chinault A.C., Beaudet A.L., Eng C.M. Molecular diagnosis of Duchenne/Becker muscular dystrophy: enhanced detection of dystrophin gene rearrangements by oligonucleotide array-comparative genomic hybridization. Hum Mutat. 2008;29(9):1100-7. doi: 10.1002/humu.20841
5. Bai Y., Liu J., Xu J., Sun Y., Li J., Gao Y., Liu L., Jia C., Kong X., Wang L. Long-Read Sequencing Revealed Extragenic and Intragenic Duplications of Exons 56-61 in DMD in an Asymptomatic Male and a DMD Patient. Front Genet. 2022;13:878806. doi: 10.3389/fgene.2022.878806
6. Bladen C.L., Salgado D., Monges S., et al. The TREAT-NMD DMD Global Database: analysis of more than 7,000 Duchenne muscular dystrophy mutations. Hum Mutat. 2015;36(4):395-402. doi: 10.1002/humu.22758
7. Sheikh O., Yokota T. Advances in Genetic Characterization and Genotype-Phenotype Correlation of Duchenne and Becker Muscular Dystrophy in the Personalized Medicine Era. J Pers Med. 2020;10(3):111. doi: 10.3390/jpm10030111
8. Bovolenta M., Neri M., Fini S., et al.. A novel custom high density-comparative genomic hybridization array detects common rearrangements as well as deep intronic mutations in dystrophinopathies. BMC Genomics. 2008;9:572. doi: 10.1186/1471-2164-9-572
9. Zaum A.K., Nanda I., Kress W., Rost S. Detection of pericentric inversion with breakpoint in DMD by whole genome sequencing. Mol Genet Genomic Med. 2022;10(10):e2028. doi: 10.1002/mgg3.2028
10. Whitehead M.T., Helman G., Gropman A.L.. MR Imaging Findings in Xp21.2 Duplication Syndrome. J Radiol Case Rep. 2016;10(5):9-14. doi: 10.3941/jrcr.v10i5.2563
Рецензия
Для цитирования:
Маркова Ж.Г., Миньженкова М.Е., Шаркова И.В., Петухова М.С., Шилова Н.В. Оценка патогенности дупликаций, выявленных при микроматричном анализе, на примере двух пациентов с картиной мышечной дистрофии Дюшенна. Медицинская генетика. 2022;21(12):56-59. https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.12.56-59
For citation:
Markova Zh.G., Minzhenkova M.E., Sharkova I.V., Petukhova M.S., Shilova N.V. Assessment of the duplication`s pathogenicity detected by chromosomal microarray, in the example of two patients with Duchenne muscular dystrophy. Medical Genetics. 2022;21(12):56-59. (In Russ.) https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.12.56-59
Просмотров:
294
Послать статью по эл. почте 