Preview

Медицинская генетика

Расширенный поиск

МОЛЕКУЛЯРНОЕ КАРИОТИПИРОВАНИЕ (ACGH) КАК СОВРЕМЕННЫЙ ПОДХОД К ИССЛЕДОВАНИЮ ПРИЧИН НЕВЫНАШИВАНИЯ БЕРЕМЕННОСТИ

https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2013-1-26-35

Полный текст:

Аннотация

 

В первом триместре 15—20% клинически распознаваемых беременностей заканчиваются спонтанными абортами, причиной которых в половине случаев являются хромосомные аномалии у эмбриона. Выявление таких аномалий помогает оценить повторный риск при будущих беременностях. Однако кариотип эмбриона зачастую не может быть установлен методом стандартного цитогенетического анализа вследствие неудач культивирования или контаминации культур клетками материнского происхождения, а также при наличии субмикроскопических перестроек. Матричная сравнительная геномная гибридизация (aCGH) позволяет преодолеть эти ограничения и установить с высоким разрешением реальный хромосомный статус плода. Кроме того, эта технология даёт возможность исследовать вариации крупных блоков повторов (CNV) с целью поиска вариантов, связанных с невынашиванием беременности. В конечном итоге, это поможет выявить гены, нарушения в которых приводят к остановке эмбрионального развития.

 

Об авторах

Т. В. Никитина
ФГБУ «Научно-исследовательский институт медицинской генетики» Сибирского отделения Российской академии медицинских наук
Россия
г.Томск, ул. Набережная р. Ушайки, 10


А. А. Кашеварова
ФГБУ «Научно-исследовательский институт медицинской генетики» Сибирского отделения Российской академии медицинских наук
Россия
г.Томск, ул. Набережная р. Ушайки, 10


Н. А. Скрябин
ФГБУ «Научно-исследовательский институт медицинской генетики» Сибирского отделения Российской академии медицинских наук
Россия
г.Томск, ул. Набережная р. Ушайки, 10


Н. Н. Чечеткина
ФГБУ «Научно-исследовательский институт медицинской генетики» Сибирского отделения Российской академии медицинских наук
Россия
г.Томск, ул. Набережная р. Ушайки, 10


И. Н. Лебедев
ФГБУ «Научно-исследовательский институт медицинской генетики» Сибирского отделения Российской академии медицинских наук
Россия
г.Томск, ул. Набережная р. Ушайки, 10


А. А. Мельников
ФГБУ «Научно-исследовательский институт онкологии» Сибирского отделения Российской академии медицинских наук
Россия


г.Томск, пер. Кооперативный, д. 5



Список литературы

1. Ворсанова С.Г., Юров И.Ю., Колотий А.Д., Береше-ва А.К., Демидова И.А., Куринная О.С., Кравец B.C., Монахов В.В., Соловьев И.В., Юров Ю.Б. Хромосомный мозаицизм в материале спонтанных абортов: интерфазный молекулярно-цитогенетический анализ 650 случаев // Генетика. — 2010. — Т. 46, №10. — С. 1356—1359.

2. Лебедев И.Н., Островерхова Н.В., Никитина Т.В., Суханова Н.Н., Назаренко С.А. Молекулярно-цитогенетическая характеристика хромосомного дисбаланса в клетках спонтанных абортусов с низкой пролиферативной активностью in vitro // Генетика. — 2003. — Т. 39, №8. — С. 1112—1122.

3. Суханова Н.Н., Лебедев И.Н., Никитина Т.В., Саженова Е.А., Назаренко С.А. Структура хромосомных нарушений у 552 спонтанных абортусов Томской популяции // Медицинская генетика. — 2002. — Т. 1, №6. — С. 271—276.

4. Ballif B.C., Kashork C.D., Saleki R., Rorem E., Sundin K., Bejjani B.A., Shaffer L.G. Detecting sex chromosome anomalies and common triploidies in products of conception by array-based comparative genomic hybridization // Prenat. Diagn. — 2006. — Vol. 26. — P. 333—339.

5. Bell K.A., Van Deerlin P.G., Haddad B.R., Feinberg R.F. Cytogenetic diagnosis of «normal 46,XX» karyotypes in spontaneous abortions frequently may be misleading // Fertil. Steril. — 1999. — Vol. 71. — P. 334—341.

6. Benkhalifa M., Kasakyan S., Clement P., Baldi M., Tachdji-an G., Demirol A., Gurgan T., Fiorentino F., Mohammed M., Qumsiyeh M.B. Array comparative genomic hybridization profiling of first-trimester spontaneous abortions that fail to grow in vitro // Prenat. Diagn. — 2005. — Vol. 25. — P. 894—900.

7. Borovic C.L., Perez A.B., da Silva L.R.J., Krepischi-Sanr tos A.C.V., Costa S.S., Rosenberg C. Array-CGH testing in spontaneous abortions with normal karyotypes // Genet. Mol. Biol. — 2008. — Vol. 31, №2. — P. 416—422.

8. Cartegni L., Chew S.L., Krainer A.R. Listening to silence and understanding nonsense: exonic mutations that affect splicing // Nat. Rev. Genet. — 2002. — Vol. 3, №4. — P. 285—298.

9. Ceulemans S., van der Ven K., Del-Favero J. Targeted screening and validation of copy number variations // Methods Mol. Biol. — 2012. — Vol. 838. — P. 311—328.

10. Conrad D.F., Andrews T.D., Carter N.P., Hurles M.E., Pritchard J.K. Articles Legal documents include patentsinclude citations 12. Advanced searchCreate alert My Citations Settings A high-resolution survey of deletion polymorphism in the human genome // Nat. Genet. — 2006. — Vol. 38, №1. — P. 75—81.

11. Desphande M., Harper J., HoUoway M., Palmer R., Wang R. Evaluation of array comparative genomic hybridization for genetic analysis of chorionic villus sampling from pregnancy loss in comparison to karyotyping and multiplex ligation-dependent probe amplification // Genet. Test. Mol. Biomarkers. — 2010. — Vol. 14, №3. — P. 421—424.

12. de Smith A.J., Walters R.G., Froguel P., Blakemore A.I. Human genes involved in copy number variation: mechanisms of origin, functional effects and implications for disease // Cytogenet. Genome Res. — 2008. — Vol. 123. — P. 17—26.

13. Diego-Alvarez M., de Alba R., Cardero-Merlo R., Diaz-Re-carens J., Ayuso C., Ramos C., Lorda-sanchez I. MLPA as a screening method of aneuploidy and unbalanced chromosomal rearrangements in spontaneous miscarriages. // Prenat. Diagn. — 2007. — Vol. 27. — P. 765—771.

14. Eiben B., Bartels I., Bahr-Porsch S., Borgmann S., Gatz G., GeUert G., Goebel R., Hammans W., Hentemann M., Osmers R. Cytogenetic analysis of 750 spontaneous abortions with the di-rect-preparation method of chorionic villi and its implications for studying genetic causes of pregnancy wastage // Am. J. Hum. Genet. — 1990. — Vol. 47. — P. 656—663.

15. Feuk L., Carson A.R., Scherer S.W. Structural variation in the human genome // Nat. Rev. Genet. — 2006. — Vol. 7, №2. — P. 85—97.

16. Fritz B., Hallermann C., Olert J., Fuchs B., Bruns M., Aslan M., Schmidt S., Coerdt W., Muntefering H., Rehder H. Cytogenetic analyses of culture failures by comparative genomic hybridisation (CGH)-Re-evaluation of chromosome aberration rates in early spontaneous abortions. // Eur. J. Hum. Genet. — 2001. — Vol. 9. — P. 539—547.

17. Gao J., Liu C., Yao F., Hao N., Zhou J., Zhou Q., Zhang L., Liu X., Bian X., Liu J. Array-based comparative genomic hybridization is more informative than conventional karyotyping and fluorescence in situ hybridization in the analysis of first-trimester spontaneous abortion // Mol. Cytogenet. — 2012. — Vol. 16, №5. doi: 10.1186/1755-8166-5-33.

18. Goddijn M., Leschot N.J. Genetic aspects of miscarriage // Bamieres Best Pract. Res. Clin. Obstet. Gynaecol. — 2000. — Vol. 14. — P. 855—865.

19. Jobanputra V., Esteves C., Sobrino A., Brown S., Kline J., Warburton D. Using FISH to increase the yield and accuracy of karyotypes from spontaneous abortion specimens // Prenat. Diagnosis. — 2011. — Vol. 31. — P. 755—759.

20. Lebedev I.N. Mosaic aneuploidy in early fetal loss // Cytogenet. Genome Research. — 2011. — Vol. 133, №2—4. — P. 169—183.

21. Menten B., Swerts K., DeUe Chiaie B., Janssens S., Buys-se K., Phillipe J., Speleman F. Array comparative genomic hybridization and flow cytometry analysis of spontaneous abortions and mors in utero samples // BMC Med. Genet. — 2009. — Vol. 14. — P. 89—93.

22. Menasha J., Llevy B., Hirschhorn K., Kardon N.B. Incidence and spectrum of chromosome abnormalities in spontaneous abortions: new insights from 12-year study // Genetics in Medicine. — 2005. — Vol. 7, №4. — P. 251—263.

23. Nikitina T.V., Lebedev I.N., Sukhanova N.N., Sazheno-va E.A., Nazarenko S.A. A mathematical model for evaluation of maternal cell contamination in cultured cells from spontaneous abortions: significance for cytogenetic analysis of prenatal selection factors // Ferfflity Stormy. — 2005. — Vol. 83, №4. — P. 964—972.

24. Rai R., Regan L. Recurrent miscarriage // Lancet. — 2006. — Vol. 368. — P. 601—611.

25. Rajcan-Separovic E., Diego-alvarez D., Robinson W.P., Tyson C., Qiao Y., Harvard C., Fawcett C., Katousek D., Philipp T., Somerville M.J., Stephenson M.D. Identification of copy number variants in miscarriage from couples with idiopathic recurrent pregnancy loss // Hum. Reprod. — 2010. — Vol. 25. — P. 2913—2922.

26. Raican-Separovic E., Qiao Y., Tyson C., Harvard C., Fawcett C., Kalousek D., Stephenson M., Philipp T.. Genomic changes detected by array CGH in human embryos with developmental defects // Mol. Hum. Reprod. — 2010. — Vol. 16. — P. 125—134.

27. Robberecht C., Schuddinck V., Fryns J.P., Vermeesch J.R. Diagnosis of miscarriages by molecular karyotyping: benefits and pitfalls // Genet. Med. — 2009. — Vol. 11. — P. 646—654.

28. Robberecht C., Pexsters A., Deprest J., Fryns J.P., D’Hoog-he T., Vermeesch J.R. Cytogenetic and morphological analysis of early products of conception following hystero-embryoscopy from coupl es with recurrent pregnancy loss // Prenat. Diagn. — 2012. — Vol. 4. — P. 1-10. doi: 10.1002/pd.3936.

29. Schaeffer A.J., Chung J., Heretis K., Wong A., Ledbetter D.H., Lese M.C. Comparative genomic hybridization-array analysis enhances the detection of aneuploidies and submicroscopic imbalances in spontaneous miscarriages // Am. J. Hum. Genet. — 2004. — Vol. 74. — P. 1168—1174.

30. Scott S.A., Cohen N., Brandt T., Toruner G., Desnick R.J., Edelmann L. Detection of low-level mosaicism and placental mosaicism by oligonucleotide array comparative genomic hybridization // Genet. Med. — 2010. — Vol. 12, №2. — P. 85—92.

31. Shearer B.M., Thorknd E.C., Carlton A.W., Jakl S.M., Ketterling R.P. Reflex fluorescent in situ hybridization testing for unsuccessful product of conception cultures: a retrospective analysis of 5555 samples attempted by conventional cytogenetics and fluorescent in situ hybridization // Genet. Med. — 2011. — Vol. 13. — P. 545—552.

32. Shimokawa O., Harada N., Miyake N., Satoh K., Mizuguc-hi T., Niikawa N., Matsumoto N. Array comparative genomic hybridization analysis in first-trimester spontaneous abortions with «normal» ka^orjfpes // Am. J. Med. Genet. — 2006. — Vol. 140. — P. 1931—1935.

33. Solinas-Toldo S., Lampel S., Stilgenbauer S., Nickolenko J., Benner A., Dchner H., Cremer T., Lichter P. Matrix-based comparative genomic hybridization: Biochips to screen for genomic imbalances // Genes, Chromoromes and Cancer. — 1997. — Vol. 20, №4. — P. 399—407.

34. Stranger B.E., Forrest M.S., Dunning M., Ingle C.E., Beaz-ley C., Thorne N., Redon R., Bird C.P., de Grassi A., Lee C., Ty-ler-Smith C., Carter N., Scherer S.W., Tavare S., Deloukas P., Hur-les M.E., Dermitzakis E.T. Relative impact of nucleotide and copy number variation on gene expression phenotypes // Science. — 2007. — Vol. 315. — P. 848—853.

35. van den Berg M.M., van Maarle M.C., van Wefy M., God-dijn M. Genetics of early miscarriage // Biochim Biophys Acta. — 2012. — doi:10.1016/ j.bbadis.2012.07.001.

36. Zhang Y.X., Zhang Y.P., Gu Y., Guan F.J., Li S.L., Xie J.S., Shen Y., Wu B.L., Ju W., Jenkins E.C., Brown W.T., Zhong N. Genetic analysis of first-trimester miscarriages with a combination of cytogenetic karyotyping, microsatellite genotyping and array CGH // Clin. Genet. — 2009. — Vol. 75. — P. 133—140.

37. Warren J.E., Turok D.K., Maxwell T.M., Brothman A.R., Silver R.M. Array comparative genomic hybridization for genetic evaluation of fetal loss between 10 and 20 weeks of gestation // Ob-stet. Gynecol. — 2009. — Vol. 114. — P. 1093—1102.


Для цитирования:


Никитина Т.В., Кашеварова А.А., Скрябин Н.А., Чечеткина Н.Н., Лебедев И.Н., Мельников А.А. МОЛЕКУЛЯРНОЕ КАРИОТИПИРОВАНИЕ (ACGH) КАК СОВРЕМЕННЫЙ ПОДХОД К ИССЛЕДОВАНИЮ ПРИЧИН НЕВЫНАШИВАНИЯ БЕРЕМЕННОСТИ. Медицинская генетика. 2013;12(1):26-35. https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2013-1-26-35

For citation:


Nikitina T.V., Kashevarova А.А., Skryabin N.А., Chechetkina N.N., Melnikov А.А., Lebedev I.N. MOLECULAR KARYOTYPING (ACGH) AS MODERN APPROACH FOR INVESTIGATIONS OF MISCARRIAGE CAUSES. Medical Genetics. 2013;12(1):26-35. (In Russ.) https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2013-1-26-35

Просмотров: 333


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2073-7998 (Print)