Алгоритм молекулярной диагностики наследственной патологии, ассоциированной с моногенными CNV
https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.11.36-39
Аннотация
Моногенные вариации числа копий участков ДНК (CNV) у пациентов с нарушением психомоторного развития выявляются с частотой до 10%. Исход данного типа аберраций более очевиден, если затронут дозозависимый ген, ассоциированный с заболеванием. Однако патологический фенотип может формироваться в результате гемизиготизации рецессивного варианта нуклеотидной последовательности на интактном гомологе или при сочетании CNV и нуклеотидного варианта (компаундная гетерозигота). Нами разработан и апробирован для 1176 пациентов алгоритм молекулярной диагностики наследственной патологии, ассоциированной с моногенными CNV. Патогенные, вероятно патогенные и структурные хромосомные аберрации с неопределенной клинической значимостью выявлены у 478 пробандов (40,6%), в том числе моногенные CNV - у 60 пациентов (5,1%). Среди 32 моногенных аберраций, присутствие которых подтверждено методом ПЦР в реальном времени, большая часть была унаследована от здоровых родителей (23 CNV или 72%). Семи пациентам проведено секвенирование. Ни одного патогенного варианта нуклеотидной последовательности на интактном гомологе выявлено не было, однако в ряде случаев обнаружены не описанные ранее варианты неопределенного значения в генах, не вовлеченных в CNV.
Об авторах
А. А. Кашеварова
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия
Россия
М. Е. Лопаткина
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия
Россия
О. Ю. Васильева
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия
Россия
Д. А. Федотов
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия
Россия
Е. А. Фонова
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия
Россия
А. А. Сивцев
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия
Россия
А. А. Зарубин
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия
Россия
И. Н. Лебедев
Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук
Россия
Россия
Список литературы
1. Boone P.M., Bacino C.A., Shaw C.A. et al. Detection of clinically relevant exonic copy-number changes by array CGH. Hum Mutat. 2010;31(12):1326-42.
2. Lindy A.S., Stosser M.B., Butler E. et al. Diagnostic outcomes for genetic testing of 70 genes in 8565 patients with epilepsy and neurodevelopmental disorders. Epilepsia. 2018;59(5):1062-1071.
3. Truty R., Paul J., Kennemer M., Lincoln S.E. et al. Prevalence and properties of intragenic copy-number variation in Mendelian disease genes. Genet Med. 2019;21(1):114-123.
4. Brandt T., Sack L.M., Arjona D. et al. Adapting ACMG/AMP sequence variant classification guidelines for single-gene copy number variants. Genet Med. 2020;22(2):336-344.
5. Gridina M.M., Matveeva N.M., Fishman V.S. et al. Allele-specific biased expression of the CNTN6 gene in iPS cell-derived neurons from a patient with intellectual disability and 3p26.3 microduplication involving the CNTN6 gene. Mol Neurobiol. 2018;55(8):6533-6546.
6. Кашеварова А.А., Лопаткина М.Е., Беляева Е.О. и др. Распространенность и спектр моногенных CNV у пациентов с нарушениями интеллектуального развития. Медицинская генетика. 2021;10(231):44-46.
7. Ivanovic V., Brankovic M., Bjelica B. et al. Yield of the PMP22 deletion analysis in patients with compression neuropathies. J Neurol. 2020;267(12):3617-3623.
Рецензия
Для цитирования:
Кашеварова А.А., Лопаткина М.Е., Васильева О.Ю., Федотов Д.А., Фонова Е.А., Сивцев А.А., Зарубин А.А., Лебедев И.Н. Алгоритм молекулярной диагностики наследственной патологии, ассоциированной с моногенными CNV. Медицинская генетика. 2022;21(11):36-39. https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.11.36-39
For citation:
Kashevarova A.A., Lopatkina M.E., Vasilyeva O.Yu., Fedotov D.A., Fonova E.A., Sivtsev A.A., Zarubin A.A., Lebedev I.N. Algorithm for molecular diagnosis of hereditary pathology associated with single-gene CNVs. Medical Genetics. 2022;21(11):36-39. (In Russ.) https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.11.36-39
Просмотров:
247
Послать статью по эл. почте 