Клиническая значимость молекулярно-генетических подходов на основе технологий NGS в выборке пациентов с первичной цилиарной дискинезией

Первичная цилиарная дискинезия (ПЦД) представляет собой редкое и малоизученное заболевание, фенотип которого пересекается с другими распространенными заболеваниями респираторного тракта, создавая сложности для диагностики. Существующие на данный момент подходы к диагностике и верификации ПЦД требуют подтверждения с использованием геномного анализа, в связи с чем молекулярно-генетические методы, основанные на применении технологий NGS, приобретают решающее значение. В нашей лаборатории был проведен биоинформатический анализ данных полного экзомного секвенирования 19 пробандов из неродственных семей в возрасте до 17 лет с клинически установленным диагнозом ПЦД. В результате у 14 (74%) из 19 пробандов были выявлены варианты в генах, ответственных за формирование фенотипа ПЦД. Обнаруженные генетические варианты были классифицированы в соответствии с рекомендациями ACMG. Таким образом, использование комплексных подходов, включающих клинико-генетические и молекулярно-генетические методы анализа, позволяет повысить диагностическую эффективность в отношении ПЦД.

первичная цилиарная дискинезия, полное экзомное секвенирование, биоинформатический анализ данных

1. Hildebrandt F., Benzing T., Ciliopathies. N Engl J Med. 2011;364(16):1533- 1543. doi: 10.1056/NEJMra1010172.

2. Богорад А.Е., Дьякова С.Э., Мизерницкий Ю.Л. Первичная цилиарная дискинезия: современные подходы к диагностике и терапии. Российский вестник перинатологии и педиатрии. 2019;64:(5):123-133. doi: 10.21508/1027-4065-2019-64-5-123-133.

3. Новак А.А., Мизерницкий Ю.Л. Первичная цилиарная дискинезия: состояние проблемы и перспективы. Медицинский совет. 2021;(1):276-285. doi: 10.21518/2079-701X-2021-1-276-285.

4. Ferkol T., Leigh M. Primary ciliary dyskinesia and newborn respiratory distress. Semin Perinatol. 2006;30(6):335-340. doi: 10.1053/j.semperi. 2005.11.001.

5. Mullowney T., Manson D., Kim R., Stephens D., Shah V., Dell S. Primary ciliary dyskinesia and neonatal respiratory distress. Pediatrics. 2014;134(6):1160-1166. doi: 10.1542/peds.2014-0808.

6. Lucas J.S., Barbato A., Collins S.A., Goutaki M., Behan L., Caudri D. et al. European respiratory society guidelines for the diagnosis of primary ciliary dyskinesia. Eur Respir J. 2017;49(1):1601090. doi: 10.1183/13993003.01090-2016.

7. Sturgess J.M., Turner J.A. Ultrastructural pathology of cilia in the immotile cilia syndrome. Perspect Pediatr Pathol. 1984;8(2):133-161.

8. O’Callaghan C., Rutman A., Williams G.M., Hirst R.A. Inner dynein arm defects causing primary ciliary dyskinesia: repeat testing required. Eur Respir J. 2011;38(3):603-607. doi: 10.1183/09031936.00108410.

9. Fliegauf M., Olbrich H., Horvath J., Wildhaber J.H., Zariwala M., Kennedy M. et al. Mislocalization of DNAH5 and DNAH9 in respiratory cells from patients with primary ciliary dyskinesia. Am J Respir Crit Care Med. 2005;171(12):1343-1949. doi: 10.1164/rccm.200411-1583OC.

10. Brennan S.K., Ferkol T.W., Davis S.D. Emerging Genotype-Phenotype Relationships in Primary Ciliary Dyskinesia.Int J Mol Sci. 2021 Jul 31;22(15):8272.

11. Leigh M.W. Hazucha M.J. Chawla K.K. Baker B.R. Shapiro A.J. Brown D.E. et al. Standardizing nasal nitric oxide measurement as a test for primary ciliary dyskinesia. Ann Am Thorac Soc. 2013; 10: 574-581

12. Wheway G., Thomas N.S., Carroll M., et al. Whole genome sequencing in the diagnosis of primary ciliary dyskinesia. BMC Med Genomics. 2021 Sep 23;14(1):234.

13. Green R.C., Berg J.S., Grody W.W., Kalia S.S., Korf B.R., Martin C.L., McGuire A.L., Nussbaum R.L., O’Daniel J.M., Ormond K.E., Rehm H.L., Watson M.S., Williams M.S., Biesecker L.G.; American College of Medical Genetics and Genomics. ACMG recommendations for reporting of incidental findings in clinical exome and genome sequencing. Genet Med. 2013 Jul;15(7):565-74. doi: 10.1038/gim.2013.73.