Поиск этноспецифических ассоциаций сайтов связывания микроРНК кандидатных генов остеоартрита у женщин из Республики Башкортостан

Аннотация

За последние десятилетия были проведены многочисленные исследования генетических маркеров остеоартрита (ОА), однако молекулярный патогенез заболевания до сих пор остается неясным. Сайты связывания микроРНК, которые служат промежуточным звеном между генетическими и эпигенетическими механизмами, представляют собой многообещающую новую область исследований. Цель исследования: исследовать сайты связывания микроРНК таргетных генов у женщин с ОА с учетом этнической принадлежности. В исследование включены 356 женщин (51,67±11,5 лет) с ОА и 161 сопоставимая по возрасту женщина без патологии суставов. Локусы rs1061237, rs1061347 (COL1A1), rs9659030 (COL11A1), rs229069, rs229077, rs9978597 (ADAMTS5), rs5854, rs470215 (MMP1), rs1042840 (MMP13), rs1042673 (SOX9), rs13317 (FGFR1), rs4647940 (FGFRL1), rs73611720 (GDF5), rs6854081 (FGF2) были генотипированы методом конкурентной аллель-специфической ПЦР (KASP). Аллель С rs229069 и аллель T rs13317 были ассоциированы с ОА в общей выборке (OR=1,43 и OR=1,67). После поправки Беньямина-Хохберга ассоциация rs13317 оставалась статистически значимой (p<0,05). С учетом этнической гетерогенности, были выявлены ассоциации аллеля Т (rs1061237) с ОА у женщин русского происхождения (OR=1,77), аллеля G (rs6854081) у женщин татарского происхождения (OR=4,78), аллеля С (rs229069) и аллеля Т (rs73611720) у женщин смешанного происхождения и других этнических групп (OR=2,25 и OR=3,02). Все ассоциации оставались статистически значимыми после поправки Бенджамина-Хохберга. Таким образом, выявлены ассоциации полиморфных вариантов генов FGFR2, FGF2, ADAMTS5 с остеоартритом в различных этнических группах Республики Башкортостан.