Preview

Медицинская генетика

Расширенный поиск
Доступ открыт Открытый доступ  Доступ закрыт Только для подписчиков

Микроматричный анализ транскриптома мононуклеаров пациентов с раком лёгкого

https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.07.33-35

Аннотация

Среди онкологических заболеваний наиболее серьёзной проблемой является рак лёгкого. Для изучения молекулярно-генетической структуры рака лёгкого был проведён анализ транскриптома с использованием материала мононуклеаров периферической крови пациентов и здоровых индивидов. В качестве основного экспериментального метода использовался одноцветный микроматричный анализ. Анализ функционального обогащения групп генов с использованием ресурсов биологических баз данных (Gene Ontology, KEGG и Reactome) позволил провести аннотацию полученных результатов. Были получены данные о дифференциально экспрессирующихся группах генов, задействованных в определенных биологических сигнальных путях, среди них группы генов иммунного ответа, синтеза белка и клеточного цикла характеризовались наибольшим уровнем функционального обогащения. Кластеры генов компонентов специфического и врождённого иммунного ответа (FCGR2A, FCGR2C, FCGR2B, C5AR, IL6R, CXCL8), а также факторов резистентности к туберкулёзу (ATP6V0B, MAPK14, ITGAX, CORO1A) имели пониженные показатели экспрессии. Сниженная экспрессия также была установлена у генов, контролирующих синтез белка (EIF4A2, EIF4A1, RPL23). У генов Т-клеточного сигнального пути (RASGRP1, PDCD1, CD3G, PIK3R1, CD8A), а также факторов апоптоза (PDCD1, CCR7, CCR5, IL1A) был определён повышенный уровень экспрессии. Гены, установленные в результате проведённого анализа, могут в перспективе быть использованы в качестве диагностических маркеров развития рака лёгкого.

Об авторах

В. Ю. Буслаев
Федеральный исследовательский центр угля и углехимии СО РАН
Россия


В. И. Минина
Федеральный исследовательский центр угля и углехимии СО РАН; Кемеровский государственный университет
Россия


В. Г. Дружинин
Кемеровский государственный университет
Россия


Список литературы

1. Bray F., Ferlay J., Soerjomataram I., et al. Global cancerstatistics 2018: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries. CA: A Cancer Journal for Clinicians. 2018 Nov;68(6):394-424.

2. Malhotra J., Malvezzi M., Negri E., et al. Risk factors for lung cancer worldwide. Eur Respir J. 2016 Sep;48(3):889-902.

3. Wang J., Liu Q., Yuan S., et al. Genetic predisposition to lung cancer: comprehensive literature integration, meta-analysis, and multiple evidence assessment of candidate-gene association studies. Sci Rep. 2017 Aug;7(1):8371-8384.

4. Han J., Chen M., Wang Y., et al. Identification of Biomarkers Based on Differentially Expressed Genes in Papillary Thyroid Carcinoma. Sci Rep. 2018 Jul;8(1):9912-9923.

5. Malone J.H., Oliver B. Microarrays, deep sequencing and the true measure of the transcriptome. BMC Biol. 2011 May;9(1):34-43.

6. Misono S., Mizuno K., Suetsugu T., et al. Molecular Signature of Small Cell Lung Cancer after Treatment Failure: The MCM Complex as Therapeutic Target. Cancers. 2021 Mar 10;13(6):1187-1203.


Рецензия

Для цитирования:


Буслаев В.Ю., Минина В.И., Дружинин В.Г. Микроматричный анализ транскриптома мононуклеаров пациентов с раком лёгкого. Медицинская генетика. 2022;21(7):33-35. https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.07.33-35

For citation:


Buslaev V.Yu., Minina V.I., Druzhinin V.G. Microarray analysis of mononuclears transcriptome of lung cancer patients. Medical Genetics. 2022;21(7):33-35. (In Russ.) https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.07.33-35

Просмотров: 264


ISSN 2073-7998 (Print)