Copy numbers of active ribosomal genes in genomes carrying different allelic variants of genes for glutathione S-transferases GSTT1 and GSTM1
https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2016-9-40-43
Abstract
Genomic dosages of active ribosomal genes (AcRG) were determined in genomes of 44 apparently healthy subjects (13 men and 31 women aged 17 to 65 years). Previously, polymorphisms of the genes for phase II xenobiotic detoxification enzymes (GXDE) GSTM1 and GSTТ1 were identified in the same subjects. After that, an analysis of combinations of GXDE variants and AcRG copy numbers was performed for each individual genome. The analysis has shown that genomes carrying non-protective (functionally inactive) alleles of GSTM1 and GSTТ1 contain significantly higher genomic dosages of AcRG than genomes carrying functionally active (‘favourable’) alleles of these genes. The findings suggest that the genomic dosage of AcRG exerts certain influence on survival probability (viability) of carriers of the GXDE variants we studied.
About the Authors
N. A. Lyapunova
Federal state budgetary institution «Research Centre for Medical Genetics»
Russian Federation
Russian Federation
Yu. A. Revazova
Federal Scientific Center of Hygiene named after F.F. Erisman
Russian Federation
Russian Federation
References
1. Баранов В.С., Баранова Е. В., Иващенко Т.Э., Асеев М.В. Геном человека и гены «предрасположенности». - СПб. - Интермедика, 2000 - 272 с.
2. Вейко Н.Н., Структурно-функциональная организация рибосомных повторов человека. // Диссертация на соискание ученой степени доктора биологических наук. - Москва. 2001. 258 С.
3. Вейко Н.Н., Еголина Н.А., Радзивил Г.Г., Нурбаев С.Д., Косякова Н.В., Шубаева Н.О., Ляпунова Н.А. Количественное определение повторяющихся последовательностей в геномной ДНК человека. Обнаружение увеличенного количества рибосомных повторов в геномах больных шизофренией (результаты молекулярного и цитогенетического анализа). // Молекул. биология. - 2003. - Т. 37. - №3. - С. 409-419.
4. Вейко Н.Н., Ляпунова Н.А. Характеристика четырех фракций рибосомного повтора генома человека, и их организация в ядрах лимфоцитов. // Цитология. - 2005. - Т.47. - № 9. - С. 800-801
5. Григорьева С.А., Никитина В.А., Косякова Н.В., Кириллов А.В., Аксенова М.Г., Сидорова И.Е., Ревазова Ю.А., Чеботарев А.Н., Бочков Н.П. Частота полиморфизмов генов ферментов биотрансформации ксенобиотиков CYP1A1, GSTM1 и GSTT1 у жителей г. Москвы // Медицинская генетика - 2007. - №3. - С.38-43.
6. Ляпунова Н.А., Вейко Н.Н. Рибосомные гены в геноме человека: идентификация четырех фракций, их организация в ядрышке и метафазных хромосомах. // Генетика.- 2010. - Т. 46. - №9. - С. 1205-1209.
7. Ляпунова Н.А., Еголина Н.А., Цветкова Т.Г., Вейко Н.Н., Кравец-Мандрон И.А., Громова Э.В., Мхитарова Е.В., Косякова Н.В., Викторов В.В. Ядрышкообразующие районы (ЯОР) хромосом человека: опыт количественного цитологического и молекулярного анализа. // Биологические мембраны. - 2001. - Т. 18. - № 3. - С. 189-199.
8. Ляпунова Н.А., Кравец-Мандрон И.А., Цветкова Т.Г. Цитогенетика ядрышкообразующих районов (ЯОР) хромосом человека: выделение четырех морфофункциональных вариантов ЯОР их межиндивидуальное и межхромосомное распределение.// Генетика. - 1998. - Т. 34. - №9. - С. 1298-1306.
9. Пороховник Л.Н., Моделирование организации активных рибосомных генов в геноме человека и фенотипических проявлений их копийности. // Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук. - Москва. 2013, 139 С.
10. Ревазова Ю.А., Хрипач Л.В., Сидорова И.Е., Юрченко В.В., Зыкова И.Е. Комплексный подход в оценке нестабильности генома человека. // Вестник РАМН. - 2006. - №4. - С. 36-41.
11. Ревазова Ю.А., Чеботарев А.Н., Хрипач Л.В., Григорьева С.А., Кириллов А.В., Никитина В.А., Косякова Н.В., Катосова Л.Д., Платонова В.И., Подольная М.А., Журков В.С., Бочков Н.П. Генетический полиморфизм и частота спонтанных и индуцированных хромосомных аберраций в лимфоцитах жителей Москвы. // Медицинская генетика. - 2009. - №4. - С. 26-35.
12. Goodpasture С., Bloom S.E. Visualization of nucleolar organizer regions in mammalian chromosomes using silver staining. // Chromosoma. - 1975. - V. 53. - P. 37-50.
13. Howell W.M., Black D.A. Controlled silver-staining of nucleolus organizer regions with a protective colloidal developer: a 1-step method // Experientia. - 1980. - V.36. - P. 1014-1015
14. Lyapunova N.A., Veiko N.N., Porokhovnik L.N. Human rDNA Genes: Identification of Four Fractions, Their Functions and Nucleolar Location // Chap. 5, P. 95-119. In Proteins of the Nucleolus: Regulation, Translocation and Biomedical Functions. Eds D.H.O’Day and A.Catalano. 2013. Springer Publishing Company, UK.371 pp.
15. Miller D.A., Dev V.G., Tantravahi R., Miller O.J. Suppression of human nucleolus organizer activity in mouse-human somatic hybrid cells. // Experimental Cell Research. - 1976. - V. 101. - P. 235-243.
16. Taylor E.F., Martin-DeLeon P.A. Familial silver staining patterns of human nucleolus organizer regions (NORs). // Am J Hum Genet. - 1981. - V. - 33. - P. - 67-76
17. Velazquez M., Visedo G., Ludena P., de Cabo S.F., Sentis C., Fernandez-Piqueras J. Cytogenetic analysis of a human familial 15p+ marker chromosome. // Genome. - 1991. - V. 34. - №5. - P. 827-829.
Review
For citations:
Lyapunova N.A., Revazova Yu.A. Copy numbers of active ribosomal genes in genomes carrying different allelic variants of genes for glutathione S-transferases GSTT1 and GSTM1. Medical Genetics. 2016;15(9):40-43. (In Russ.) https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2016-9-40-43
Views:
502
Email this article 