Preview

Медицинская генетика

Расширенный поиск
Доступ открыт Открытый доступ  Доступ закрыт Только для подписчиков

Анализ транскрипционной активности подсемейств AluYa5 и AluYb8 в геноме человека при старении и долголетии

Полный текст:

Аннотация

Согласно одной из современных концепций старения и долголетия человека, причиной деградации эндогенных процессов является повышение нестабильности генома с возрастом. К факторам генетической нестабильности относятся транспозоны, или мобильные генетические элементы. В геноме человека широко распространены Alu-ретротранспозоны. Среди членов данного семейства AluYa5 и AluYb8 являются единственными, сохранившими транспозиционную активность. С целью проверки гипотезы о роли активности транспозонов AluYa5 и AluYb8 в старении и долголетии человека проведен сравнительный анализ уровня их экспрессии среди лиц разного возраста. В исследовании приняли участие 75 здоровых жителей Республики Башкортостан в возрасте от 21 до 97 лет. Общая выборка дифференцирована на возрастные группы: среднюю (38 человек, 21-39 лет), старческую (23 человека, 82-89 лет) и группу долгожителей (14 человек, 90-97 лет). Образцы РНК выделяли из лейкоцитов периферической венозной крови стандартным тризольным методом. Количественный анализ содержания AluYa5-РНК и AluYb8-РНК в лейкоцитах крови проводили методом ПЦР в реальном времени. Относительное количество мРНК определяли с помощью ΔΔCt-метода. Сравнение возрастных групп проводили с использованием однофакторного дисперсионного анализа Краскела-Уоллиса. В общей анализируемой выборке показатели относительного уровня экспрессии субсемейств AluYa5 и AluYb8 составили 0,84 и 0,80 отн. ед. соответственно. Согласно сравнительному анализу относительного уровня AluYa5-РНК и AluYb8-РНК в лейкоцитах крови людей, относящихся к трем возрастным группам, не наблюдается статистически значимых различий в экспрессии транспозонов семейств AluYa5 (Н=3,59, p=0,17) и AluYb8 (Н=2,65, p=0,27). После объединения групп лиц старческого возраста и долгожителей и сравнения их с лицами среднего возраста различия в показателях значений медианы также не достигли уровня статистической значимости (p=0,1). При этом у людей в возрасте 82 лет и старше наблюдается более низкий уровень экспрессии Alu-элементов субсемейства AluYa5 (0,75 против 2,69 отн. ед.) и AluYb8 (0,73 против 2,15 отн. ед.). Таким образом, в исследованной выборке не было обнаружено статистически значимых изменений относительного уровня экспрессии субсемейств AluYa5 и AluYb8 с возрастом.

Об авторах

В. В. Эрдман
Институт биохимии и генетики - обособленное структурное подразделение Федерального государственного бюджетного научного учреждения Уфимского федерального исследовательского центра Российской академии наук
Россия


Д. Д. Каримов
Институт биохимии и генетики - обособленное структурное подразделение Федерального государственного бюджетного научного учреждения Уфимского федерального исследовательского центра Российской академии наук
Россия


И. А. Туктарова
Институт биохимии и генетики - обособленное структурное подразделение Федерального государственного бюджетного научного учреждения Уфимского федерального исследовательского центра Российской академии наук
Россия


Я. Р. Тимашева
Институт биохимии и генетики - обособленное структурное подразделение Федерального государственного бюджетного научного учреждения Уфимского федерального исследовательского центра Российской академии наук
Россия


Т. Р. Насибуллин
Институт биохимии и генетики - обособленное структурное подразделение Федерального государственного бюджетного научного учреждения Уфимского федерального исследовательского центра Российской академии наук
Россия


О. Е. Мустафина
Институт биохимии и генетики - обособленное структурное подразделение Федерального государственного бюджетного научного учреждения Уфимского федерального исследовательского центра Российской академии наук
Россия


Для цитирования:


Эрдман В.В., Каримов Д.Д., Туктарова И.А., Тимашева Я.Р., Насибуллин Т.Р., Мустафина О.Е. Анализ транскрипционной активности подсемейств AluYa5 и AluYb8 в геноме человека при старении и долголетии. Медицинская генетика. 2020;19(9):50-53.

For citation:


Erdman V.V., Karimov D.D., Tuktarova I.A., Timasheva Ya.R., Nasibullin T.R., Mustafina O.E. Analysis of AluYa5 and AluYb8 subfamilies transcriptional activity in the human genome with aging and longevity. Medical Genetics. 2020;19(9):50-53. (In Russ.)

Просмотров: 92


ISSN 2073-7998 (Print)