Preview

Медицинская генетика

Расширенный поиск

АССОЦИАЦИИ ПОЛИМОРФНЫХ ВАРИАНТОВ ГЕНОВ ПОДВЕРЖЕННОСТИ БРОНХИАЛЬНОЙ АСТМЕ

https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2015-5-28-36

Полный текст:

Аннотация

Бронхиальная астма (БА) является клинически гетерогенной многофакторной патологией с существенной наследственной компонентой в этиологии, которая до конца не установлена. Целью настоящего исследования было изучение ассоциаций полиморфизма плейотропных генов с БА и её эндофенотипами. Проанализировано 23 полиморфных варианта 17 генов. Выявлены ассоциации с астмой и её эндофенотипами девяти генов (IL12A, LTA, TNF, TNFRSF1B, IFNGR2, NOS3, AGTR1, GNB3, PPP3R1); показано, что в развитие изолированной БА и её сочетаний с сопутствующими заболеваниями ассоциированные гены вовлечены в различной степени. Продукты большинства генов, для которых установлены ассоциации с БА и её эндофенотипами, участвуют в реализации двух основных механизмов патогенеза БА: воспаления и бронхоспазма. Установлено, что клинические фенотипы лёгкой, средней и тяжёлой форм БА имеют свои отличительные генетические особенности. Для генов PPP3R1, TNFRSF1B, GNB3, AGTR1 ассоциативное исследование с БА проведено впервые.

Об авторах

Н. П. Бабушкина
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Научно-исследовательский институт медицинской генетики»
Россия

Томск, 634050, Набережная р. Ушайки, 10

 



Е. Ю. Брагина
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Научно-исследовательский институт медицинской генетики»
Россия
Томск, 634050, Набережная р. Ушайки, 10


С. В. Буйкин
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Научно-исследовательский институт медицинской генетики»
Россия
Томск, 634050, Набережная р. Ушайки, 10


И. В. Салтыкова
ГБОУ ВПО Сибирского государственного медицинского университета Минздрава РФ
Россия
Томск, 634050, ул. Московский тракт, 2


М. С. Назаренко
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Научно-исследовательский институт медицинской генетики»
Россия
Томск, 634050, Набережная р. Ушайки, 10


Н. В. Тарасенко
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Научно-исследовательский институт медицинской генетики»
Россия
Томск, 634050, Набережная р. Ушайки, 10


Е. В. Кулиш
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Научно-исследовательский институт медицинской генетики»
Россия
Томск, 634050, Набережная р. Ушайки, 10


В. В. Маркова
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Научно-исследовательский институт медицинской генетики»
Россия
Томск, 634050, Набережная р. Ушайки, 10


О. Г. Половкова
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Научно-исследовательский институт медицинской генетики»
Россия
Томск, 634050, Набережная р. Ушайки, 10


А. Н. Кучер
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Научно-исследовательский институт медицинской генетики»
Россия
Томск, 634050, Набережная р. Ушайки, 10


Список литературы

1. Евдокимова Т.А., Огородова Л.М. Влияние хронической описторхозной инвазии на клиническое течение и иммунный ответ при атопической бронхиальной астме у детей // Педиатрия. — 2006. — №6. — С. 12—17.

2. Животовский Л.А. Популяционная биометрия. — М.: Наука. — 1991. — 271 с.

3. Кучер А.Н., Бабушкина Н.П., Брагина Е.Ю. и др. Изменчивость полиморфных вариантов генов интерлейкинов и их рецепторов у представителей четырех этнических групп сибирского региона // Медицинская генетика. — 2009. — Т. 10. — С. 43—52.

4. Кучер А.Н, Бабушкина Н.П., Маркова В.В. и др. Изменчивость полиморфных вариантов генов-кандидатов заболеваний сердечно-сосудистой системы у представителей четырех

5. этнических групп сибирского региона // Медицинская генетика. — 2010. — №5. — С. 24—34.

6. Кучер А.Н, Бабушкина Н.П., Тарасенко Н.В. и др. Изменчивость полиморфных вариантов генов факторов некроза опухоли и их рецепторов у представителей четырех этнических групп сибирского региона //Медицинская генетика. — 2010. — №6. — С. 16—23.

7. Кучер А.Н., Бабушкина Н.П., Кулиш Е.В. и др. Характеристика изменчивости четырех полиморфных вариантов (rs2069705, rs17880053, rs11126176 и rs804271) у представителей коренного и пришлого населения сибирского региона // Генетика. — Принято в печать.

8. Лакин Г.Ф. Биометрия: Учеб. Пособие для биол. cпец. ВУЗов — 4-е изд., перераб. и доп. — М.: Высш. шк., 1990. — 352 с.

9. Лильин Е.Т., Трубников В.И., Ванюков М.М. Введение в современную фармакогенетику. — М.: Медицина. — 1984. — 160 с.

10. Фрейдин М.Б., Пузырев В.П. Синтропные гены аллергических заболеваний // Генетика. — 2010. — Т. 46. — С. 255—261.

11. Andiappan A.K., Wang de Y., Anantharaman R. et al. Genome-wide association study for atopy and allergic rhinitis in a Singapore Chinese population // PLoS One. — 2011. — Vol. 6. — e19719.

12. Aramburu J., Heitman J., Crabtree G.R. Calcineurin: a central controller of signalling in eukaryotes // EMBO Rep. — 2004. — Vol. 5. — P. 343—348.

13. Bhakta N.R., Woodruff P.G. Human asthma phenotypes: from the clinic, to cytokines, and back again // Immunol. Rev. — 2011. — Vol. 242. — P. 220—232.

14. Binia A., Kabesch M. Respiratory medicine — genetic base for allergy and asthma // Swiss. Med. Wkly. — 2012. — Vol. 142. — w 13612.

15. Blumenthal M.N., Namboodiri K.K, Mendell N. et al.Genetic transmission of serum IgE levels // Am. J. Med. Genet. — 1981. — Vol. 10. — P. 219—228.

16. Bouzigon E., Dizier M.H., Krahenbuhl C. Clustering patterns of LOD scores for asthma-related phenotypes revealed by a genome-wide screen in 295 French EGEA families // Hum. Mol. Genet. — 2004. — Vol. 13. — P. 3103—3113.

17. Bouzigon E., Monier F., Boussaha M. et al. Associations between nitric oxide synthase genesand exhaled NO-related phenotypes according to asthma status // PLoS ONE. — 2012. — Vol. 7. — e36672.

18. Brewington R., Chatterji M., Zoubine M. et al. IFN—independent autocrine cytokine regulatory mechanism in reprogramming of macrophage responses to bacterial lipopolysaccharide // J. Immunol. — 2001. — Vol. 167. — P. 392—398.

19. Chan Y., Fish J.E., D’Abreo C. et al. The Cell-specific Expression of Endothelial Nitric-oxide Synthase: a role for DNA methylation // J. Biol. Chem. — 2004. — Vol. 279. — P. 35087—35100.

20. Chen T., Liang W., Gao L. et al. Association of single nucleotide polymorphisms in interleukin 12 (IL-12A and -B) with asthma in a Chinese population // Hum. Immunol. — 2011. — Vol. 72, №7. — P. 603—606.

21. Dahgam S., Nyberg F., Modig L. et al. Single nucleotide polymorphisms in the NOS2 and NOS3 genes are associated with exhaled nitric oxide // J. Med. Genet. — 2012. — Vol. 49. — P. 200—205.

22. Fitzsimmons C.M., Falcone F.H., Dunne D.W. Helminth allergens, parasite-specific IgE, and its protective role in human immunity// Frontiers in Immunology. — 2014. — Vol. 5. — A.61. — P. 1—12.

23. Gao P.S., Mao X.Q., Jouanguy E. et al. Nonpathogenic common variants of IFNGR1 and IFNGR2 in association with total serum IgE levels // Biochem. Biophys. Res. Commun. — 1999. — Vol. 263, №2. — P. 425—429.

24. Ge C.L., Hao C.L., Tang N.B. et al. Changes of exhaled nitric oxide and peripheral blood eosinophils in children with asthma // Zhongguo Dang Dai Er Ke Za Zhi. — 2009. — Vol. 11. — P. 986—988.

25. Ghosh S., Erzurum S.C. Nitric oxide metabolism in asthma pathophysiology // Biochim. Biophys. Acta. — 2011. — Vol. 1810. — P. 1008—1016.

26. Hill W.G. Estimation of linkage disequilibrium in randomly mating populations // Heredity. — 1974. — Vol. 33, №2. — P. 229—239.

27. Hirota T., Takahashi A., Kubo M. et al. Genome-wide association study identifies three new susceptibility loci for adult asthma in the Japanese population // Nat. Genet. — 2011. — Vol. 43. — P. 893—896.

28. Holla L.I., Jurajda M., Pohunek P., Znojil V. Haplotype analysis of the endothelial nitric oxide synthase gene in asthma // Hum. Immunol. — 2008. — Vol. 69. — P. 306—313.

29. Lordanidou M., Paraskakis E., Tavridou A. et al. G894T polymorphism of eNOS gene is a predictor of response to combination of inhaled corticosteroids with long-lasting (2)-agonists in asthmatic children // Pharmacogenomics. — 2012. — Vol. 13. — P. 1363—1372.

30. Kiley J., Smith R., Noel P. Asthma phenotypes // Curr. Opin. Pulm. Med. — 2007. — Vol. 13. — P. 19—23.

31. Li J., Hu M., Guo J. et al. Calcineurin subunit B is an immunostimulatory protein and acts as a vaccine adjuvant inducing protective cellular and humoral responses against pneumococcal infection // Immunol. Lett. — 2011. — Vol. 140, №1—2. — P. 52—58.

32. Li X., Hawkins G.A., Ampleford E.J., et al. Genome-wide association study identifies TH1 pathway genes associated with lung function in asthmatic patients // J. Allergy. Clin. Immunol. — 2013. — Vol. 132, №2. — P. 313—320. e15.

33. Lue K.-H., Ku M.-S., Li C. et al. ACE gene polymorphism might disclose why some Taiwanese children with allergic rhinitis develop asthma symptoms but others do not // Pediatr Allergy Immunol. — 2006. — Vol. 17. — P. 508—513.

34. Matouk C.C., Marsden P.A. Epigenetic Regulation of Vascular Endothelial Gene Expression // Circ Res. — 2008. — Vol. 102. — P. 873—887.

35. Moghaddam A.S., Shabani M., Fateminasab F., Reza Khakzad M. Level of Nitric Oxide in Bronchoalveolar Lavage Fluid of Asthmatic Mice Model // IJI. — 2005. — Vol. 2, №2. — P. 103—110.

36. Morris J.A. and Gardner M.J. Statistics in Medicine: Calculating confidence intervals for relative risks (odds ratios) and standardized ratios and rates // Br. Med. J. (Clin. Res. Ed.). — 1988. — Vol. 296. — P. 1313—1316.

37. Pillai S.G., Chiano M.N., White N.J. et al. A genome-wide search for linkage to asthma phenotypes in the genetics of asthma international network families: evidence for a major susceptibility locus on chromosome 2p // Europ. J. Hum. Genet. — 2006. — Vol. 14. — P. 307—316.

38. Ricciardolo F.L., Di Stefano A., Sabatini F., Folkerts G. Reactive nitrogen species in the respiratory tract // Eur. J. Pharmacol. — 2006. — Vol. 533. — P. 240—252.

39. Rosskopf D., Busch S., Manthey I. et al. G protein beta 3 gene: structure, promoter, and additional polymorphisms // Hypertension. — 2000. — Vol. 36. — P. 33—41.

40. Schilders G., van Dijk E., Pruijn G.J.M. C1D and hMtr4p associate with the human exosome subunit PM/Scl-100 and are involved in pre-rRNA processing // Nucleic Acids Research. — 2007. — Vol. 35, №8. — P. 2564—2572.

41. Torgerson D.G., Ampleford E.J., Chiu G.Y. et al. Meta-analysis of genome-wide association studies of asthma in ethnically diverse North American populations // Nat. Genet. — 2011. — Vol. 43. — P. 887—892.

42. Wilk J.B., Djousse L., Arnett D.K. et al. Evidence for major genes influencing pulmonary function in the NHLBI family heart study // Genet. Epidemiol. — 2000. — Vol. 19. — P. 81—94.

43. Yang M., Fu X., Zhang Y. et al. The +252A/G polymorphism in the Lymphotoxin- gene increases the risk of asthma: A meta-analysis // Respirology. — 2012. — Vol. 17. — P. 1229—1236.

44. Zamir I., Dawson J., Lavinsky R.M. et al. Cloning and characterization of a corepressor and potential component of the nuclear hormone receptor repression complex // Proc. Natl. Acad. Sci. — 1997. — Vol. 94. — P. 14400—14405.

45. Zhang Y., Zhang J., Tian C. et al. The -308 G/A polymorphism in TNF- gene is associated with asthma risk: an update by meta-analysis // J. Clin. Immunol. — 2011. — Vol. 31. — P. 174—185.

46. http://genome-euro.ucsc.edu/cgi-bin

47. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ projects/sviewer


Для цитирования:


Бабушкина Н.П., Брагина Е.Ю., Буйкин С.В., Салтыкова И.В., Назаренко М.С., Тарасенко Н.В., Кулиш Е.В., Маркова В.В., Половкова О.Г., Кучер А.Н. АССОЦИАЦИИ ПОЛИМОРФНЫХ ВАРИАНТОВ ГЕНОВ ПОДВЕРЖЕННОСТИ БРОНХИАЛЬНОЙ АСТМЕ. Медицинская генетика. 2015;14(5):28-36. https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2015-5-28-36

For citation:


Babushkina N.P., Bragina E.Y., Buikin S.V., Saltykova I.V., Nazarenko M.S., Tarasenko N.V., Kulish E.V., Markova V.V., Polovkova O.G., Kucher A.N. ASSOCIATION OF POLYMORPHIC VARIANTS OF SUSCEPTIBILITY GENES COMMON DISEASES WITH BRONCHIAL ASTHMA. Medical Genetics. 2015;14(5):28-36. (In Russ.) https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2015-5-28-36

Просмотров: 196


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2073-7998 (Print)