Транскриптом опухоли молочной железы с различным статусом амплификации длинного плеча 8 хромосомы

Аннотация

Изучено изменение транкриптома опухоли молочной железы (РМЖ) с различным статусом амплификации длинного плеча 8 хромосомы (с локусом 8q24) и в процессе предоперационной химиотерапии. В исследовании использовались парные образцы биопсийного материала до лечения и операционного материала от 60 больных РМЖ люминального В подтипа, получавших 4-8 курсов неоадъювантной химиотерапии (НХТ). Показано, что в 65% случаев амплификация 8q сохраняется в опухоли после НХТ. Показаны топ-10 сигнальных путей дифференциально-экспрессируемых генов (ДЭГ) в опухоли больных РМЖ до лечения и после НХТ с наличием амплификации 8q. ДЭГ пациентов с различным статусом амплификации 8q (с регионом 8q24) до лечения и после НХТ пересекаются всего по 8 генам. В резидуальной опухоли у больных с амплификацией 8q было установлено повышение экспрессии генов стволовости GSK3B, MYC, GATA3, SMAD4, SMAD2, принимающих участие в WNT- и TGFb-сингналинге. Проведенное исследование показывает большое влияние амплификации длинного плеча хромосомы 8 на опухолевый транскриптом при РМЖ, независимо от других молекулярно-генетических признаков. Амплификация 8q с участием региона 8q24 приводит к значительному сдвигу уровня транскрипции большого количества генов именно после воздействия химиотерапии.