Preview

Медицинская генетика

Расширенный поиск
Доступ открыт Открытый доступ  Доступ закрыт Только для подписчиков

Изучение полиморфизма генов человека, ортологи которых функционально задействованы в реакцию на экспериментальную ишемию мозга в модельных системах

https://doi.org/10.25557/2073-7998.2020.05.83-85

Полный текст:

Аннотация

В условиях модели экспериментальной ишемии мозга крыс, вызванной обратимой окклюзией правой средней мозговой артерии, с использованием методов RNA-Seq и ПЦР в реальном времени были выявлены гены, значительно меняющие свою активность в мозге крыс. Для 38 наиболее активных генов были определены гены-ортологи у человека. С использованием баз данных проекта 1000 геномов (популяция CEU) был изучен полиморфизм каждого из генов и отобраны локусы, которые демонстрировали максимальное число ассоциаций с другими полиморфизмами (tagSNPs). На первом этапе был исследован полиморфизм генов DRD2, CCL23, SOCS3, HSPB1 и CHRM4, в каждом из которых были идентифицированы от одного до трех tagSNPs. С использованием метода ПЦР в режиме реального времени (TaqMan) аллельные варианты отобранных локусов были генотипированы в выборке больных ишемическим инсультом (100 чел.) и контрольной группе (100 чел.). Частоты встречаемости генотипов исследованных полиморфизмов в контрольной группе, в большинстве случаев, оказались близкими таковым в группе больных с ишемическим инсультом. Наиболее существенные различия в распределении генотипов между выборками (p = 0,088) были продемонстрированы для локуса rs8069976 из региона локализации гена SOCS3. Для уточнения направленности выявленных различий планируется их проверка на выборках больных и контроля больших размеров.

Об авторах

А. В. Хрунин
ФГБУН Институт молекулярной генетики Российской академии наук
Россия


Г. В. Хворых
ФГБУН Институт молекулярной генетики Российской академии наук
Россия


Е. Д. Гнатко
ФГБУН Институт молекулярной генетики Российской академии наук; ФГАОУ ВО Первый Московский государственный медицинский университет имени И.М. Сеченова Министерства здравоохранения Российской Федерации
Россия


И. Б. Филиппенков
ФГБУН Институт молекулярной генетики Российской академии наук
Россия


В. В. Ставчанский
ФГБУН Институт молекулярной генетики Российской академии наук
Россия


Л. В. Дергунова
ФГБУН Институт молекулярной генетики Российской академии наук
Россия


С. А. Лимборская
ФГБУН Институт молекулярной генетики Российской академии наук
Россия


Для цитирования:


Хрунин А.В., Хворых Г.В., Гнатко Е.Д., Филиппенков И.Б., Ставчанский В.В., Дергунова Л.В., Лимборская С.А. Изучение полиморфизма генов человека, ортологи которых функционально задействованы в реакцию на экспериментальную ишемию мозга в модельных системах. Медицинская генетика. 2020;19(5):83-85. https://doi.org/10.25557/2073-7998.2020.05.83-85

For citation:


Khrunin A.V., Khvorykh G.V., Gnatko E.D., Filippenkov I.B., Stavchansky V.V., Dergunova L.V., Limborska S.A. Study of polymorphism of human genes, orthologues of which are functionally involved in the response to experimental brain ischemia in model systems. Medical Genetics. 2020;19(5):83-85. (In Russ.) https://doi.org/10.25557/2073-7998.2020.05.83-85

Просмотров: 34


ISSN 2073-7998 (Print)